Пакет: plink2 (2.00~a3-210203+dfsg-1 и другие)

[ Источник: plink2  ]

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

plink2 is a comprehensive update of plink and plink1.9 with new algorithms and new methods, faster and less memory consumer than the first plink.

Другие пакеты, относящиеся к plink2

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, mipsel]

  библиотека для атомарного выполнения кода

• dep: libblas3

  реализация алгоритмов линейной алгебры — библиотека

  или libblas.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  вспомогательная библиотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: liblapack3

  библиотека подпрограмм линейной алгебры вер. 3 — динамическая версия

  или liblapack.so.3

  виртуальный пакет, предоставляемый libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [armel, armhf]

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: libzstd1 (>= 1.4.0)

  быстрый алгоритм сжатия без потерь

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  библиотека сжатия

Загрузка plink2

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
amd64	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	1 796,9 Кб	14 206,0 Кб	[список файлов]
arm64	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	828,6 Кб	2 183,0 Кб	[список файлов]
armel	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	793,7 Кб	2 249,0 Кб	[список файлов]
armhf	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	805,3 Кб	1 645,0 Кб	[список файлов]
i386	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	1 210,7 Кб	10 374,0 Кб	[список файлов]
mips64el	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	977,4 Кб	2 955,0 Кб	[список файлов]
mipsel	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	900,0 Кб	2 683,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	960,9 Кб	2 831,0 Кб	[список файлов]
s390x	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	899,6 Кб	2 687,0 Кб	[список файлов]