パッケージ: plink2 (2.00~a3-210203+dfsg-1 など)

[ ソース: plink2  ]

whole-genome association analysis toolset

plink expects as input the data from SNP (single nucleotide polymorphism) chips of many individuals and their phenotypical description of a disease. It finds associations of single or pairs of DNA variations with a phenotype and can retrieve SNP annotation from an online source.

SNPs can evaluated individually or as pairs for their association with the disease phenotypes. The joint investigation of copy number variations is supported. A variety of statistical tests have been implemented.

plink2 is a comprehensive update of plink and plink1.9 with new algorithms and new methods, faster and less memory consumer than the first plink.

その他の plink2 関連パッケージ

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel, mipsel]

  __atomic ビルトイン関数を提供するサポートライブラリ

• dep: libblas3

  基本線形代数のリファレンス実装 - 共有ライブラリ

  または libblas.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, libblas3, libblis3-openmp, libblis3-pthread, libblis3-serial, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libdeflate0 (>= 1.0)

  fast, whole-buffer DEFLATE-based compression and decompression

• dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, mipsel]

• dep: liblapack3

  線形代数ルーチンライブラリ 3 - 共有ライブラリ版

  または liblapack.so.3

  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージです: libatlas3-base, liblapack3, libopenblas0-openmp, libopenblas0-pthread, libopenblas0-serial

• dep: libstdc++6 (>= 4.1.1) [armel, armhf]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libzstd1 (>= 1.4.0)

  高速なロスレス圧縮アルゴリズム

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  圧縮ライブラリ - ランタイム

plink2 のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	1,796.9 kB	14,206.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	828.6 kB	2,183.0 kB	[ファイル一覧]
armel	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	793.7 kB	2,249.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	805.3 kB	1,645.0 kB	[ファイル一覧]
i386	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	1,210.7 kB	10,374.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	977.4 kB	2,955.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	900.0 kB	2,683.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	960.9 kB	2,831.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	2.00~a3-210203+dfsg-1+b1	899.6 kB	2,687.0 kB	[ファイル一覧]