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パッケージ: tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-9 など)

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最尤法による系統樹の再構築

TREE-PUZZLE (PUZZLE の新たな名前) は対話式のコンソールプログラムで、巨大な データセットを解析して、個々の内分枝の支持の推定を自動的に割り当てる高速な ツリー検索アルゴリズム quartet puzzling を実装しています。TREE-PUZZLE はま た、ユーザが指定した系統樹に対して、その枝長だけでなく、ペアワイズ最尤距離 も計算します。枝長は分子時計の仮定の下でも計算することができます。さらに、 TREE-PUZZLE は、仮定した内分枝の支持をツリー全体を計算することなく調査し、 配列アライメントの系統学的な内容を視覚化する、尤度マッピングという新たな方 法を提供します。

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::analysing, use::comparing, サポート形式: プレーンテキスト, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

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アーキテクチャ バージョン パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
alpha (非公式の移植版) 5.3~rc16+dfsg-9+b1 166.5 kB493.0 kB [ファイル一覧]
amd64 5.3~rc16+dfsg-9+b1 165.3 kB397.0 kB [ファイル一覧]
arm64 5.3~rc16+dfsg-9+b1 150.5 kB428.0 kB [ファイル一覧]
armel 5.3~rc16+dfsg-9+b1 160.0 kB412.0 kB [ファイル一覧]
armhf 5.3~rc16+dfsg-9+b1 150.9 kB304.0 kB [ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版) 5.3~rc16+dfsg-9+b1 158.1 kB401.0 kB [ファイル一覧]
i386 5.3~rc16+dfsg-9+b1 177.7 kB484.0 kB [ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版) 5.3~rc16+dfsg-9+b1 214.9 kB785.0 kB [ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版) 5.3~rc16+dfsg-9+b1 152.7 kB420.0 kB [ファイル一覧]
mips64el 5.3~rc16+dfsg-9+b1 164.8 kB508.0 kB [ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版) 5.3~rc16+dfsg-9+b1 176.8 kB493.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 5.3~rc16+dfsg-9+b1 175.0 kB493.0 kB [ファイル一覧]
riscv64 5.3~rc16+dfsg-9+b2 166.1 kB345.0 kB [ファイル一覧]
s390x 5.3~rc16+dfsg-9+b1 175.4 kB440.0 kB [ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版) 5.3~rc16+dfsg-9+b1 178.0 kB365.0 kB [ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版) 5.3~rc16+dfsg-9+b1 152.5 kB1,070.0 kB [ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版) 5.3~rc16+dfsg-9+b1 161.8 kB376.0 kB [ファイル一覧]