パッケージ: spoa (4.1.4-1)

[ ソース: spoa  ]

SIMD partial order alignment tool

Spoa (SIMD POA) is a c++ implementation of the partial order alignment (POA) algorithm (as described in 10.1093/bioinformatics/18.3.452) which is used to generate consensus sequences (as described in 10.1093/bioinformatics/btg109). It supports three alignment modes: local (Smith-Waterman), global (Needleman-Wunsch) and semi-global alignment (overlap).

その他の spoa 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.34) [alpha, ia64, sh4 以外]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, hppa, ia64, m68k 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  GCC 共有ライブラリ

• dep: libspoa7.0.0 (>= 4.1.4)

  SIMD partial order alignment library

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4 以外]

  圧縮ライブラリ - ランタイム

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armel, armhf, hppa, m68k, sh4]

spoa のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	35.9 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	37.2 kB	82.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	36.0 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
armel	34.7 kB	73.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	34.0 kB	61.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	37.7 kB	82.0 kB	[ファイル一覧]
i386	37.8 kB	77.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	41.3 kB	106.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	35.9 kB	73.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	36.3 kB	100.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	37.1 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	37.7 kB	98.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	35.9 kB	70.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	37.1 kB	78.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	38.5 kB	97.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	34.8 kB	1,060.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	37.0 kB	77.0 kB	[ファイル一覧]