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パッケージ: phybin (0.3-7)

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binning/clustering newick trees by topology

PhyBin is a simple command line tool that classifies a set of Newick tree files by their topology. The purpose of it is to take a large set of tree files and browse through the most common tree topologies.

It can do simple binning of identical trees or more complex clustering based on an all-to-all Robinson-Foulds distance matrix.

phybin produces output files that characterize the size and contents of each bin or cluster (including generating GraphViz-based visual representations of the tree topologies).

その他の phybin 関連パッケージ

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アーキテクチャ パッケージサイズ インストールサイズ ファイル
amd64 3,578.3 kB26,553.0 kB [ファイル一覧]
arm64 3,567.3 kB29,774.0 kB [ファイル一覧]
armhf 5,186.6 kB33,521.0 kB [ファイル一覧]
i386 5,314.7 kB42,376.0 kB [ファイル一覧]
ppc64el 3,464.4 kB40,666.0 kB [ファイル一覧]
riscv64 4,687.3 kB32,590.0 kB [ファイル一覧]
s390x 7,118.5 kB55,881.0 kB [ファイル一覧]