Package: trinityrnaseq (2.15.1+dfsg-5 and others)

[ Source: trinityrnaseq  ]

assemblati de novo di RNA-Seq

Trinity rappresenta un metodo innovativo per una ricostruzione de novo efficiente e robusta di trascrittomi da dati di RNA-seq. Trinity combina tre moduli software indipendenti: Inchworm, Chrysalis e Butterfly, applicati sequenzialmente per elaborare grandi volumi di letture di RNA-seq. Trinity partiziona i dati delle sequenze in molti grafi de Bruijn individuali, ciascuno dei quali rappresenta la complessità trascrizionale ad un dato gene o locus, e poi elabora ciascun grafo indipendentemente per estrarre isoforme di splicing a lunghezza intera e per separare i trascritti derivati da geni paraloghi.

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Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
alpha (unofficial port)	2.15.1+dfsg-2	1,656.3 kB	8,135.0 kB	[list of files]
amd64	2.15.1+dfsg-5+b1	1,679.8 kB	7,456.0 kB	[list of files]
arm64	2.15.1+dfsg-5+b1	1,616.8 kB	7,740.0 kB	[list of files]
ia64 (unofficial port)	2.15.1+dfsg-2	1,717.4 kB	9,611.0 kB	[list of files]
m68k (unofficial port)	2.15.1+dfsg-2	1,654.5 kB	7,399.0 kB	[list of files]
ppc64 (unofficial port)	2.15.1+dfsg-2	1,664.4 kB	8,572.0 kB	[list of files]
ppc64el	2.15.1+dfsg-5+b1	1,667.4 kB	8,316.0 kB	[list of files]
riscv64	2.15.1+dfsg-5+b1	1,660.8 kB	6,824.0 kB	[list of files]
sh4 (unofficial port)	2.15.1+dfsg-2	1,726.5 kB	7,736.0 kB	[list of files]
sparc64 (unofficial port)	2.15.1+dfsg-2	1,576.3 kB	18,081.0 kB	[list of files]
x32 (unofficial port)	2.15.1+dfsg-2	1,676.7 kB	7,287.0 kB	[list of files]