[ Quellcode: pairtools ]
Paket: python3-pairtools (1.0.3-1 und andere)
Links für python3-pairtools
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Betreuer:
Externe Ressourcen:
- Homepage [github.com]
Ähnliche Pakete:
Framework to process sequencing data from a Hi-C experiment
Simple and fast command-line framework to process sequencing data from a Hi-C experiment.
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- Detect ligation junctions (a.k.a. Hi-C pairs) in aligned paired-end sequences of Hi-C DNA molecules - Sort .pairs files for downstream analyses - Detect, tag and remove PCR/optical duplicates - Generate extensive statistics of Hi-C datasets - Select Hi-C pairs given flexibly defined criteria - Restore .sam alignments from Hi-C pairs
Andere Pakete mit Bezug zu python3-pairtools
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- dep: cython3 [hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- C-Extensions for Python 3
-
- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.3.4) [hppa]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, sparc64]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.33) [ia64]
- GNU-C-Bibliothek: Laufzeitbibliotheken
auch ein virtuelles Paket, bereitgestellt durch libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4]
- GCC Support-Bibliothek
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
-
- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC Support-Bibliothek
-
- dep: libstdc++6 (>= 11) [nicht hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- GNU-Implementierung der Standard-C++-Bibliothek (Version 3)
-
- dep: python3
- interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
- dep: python3 (<< 3.11) [ia64, x32]
- dep: python3 (<< 3.12) [hppa, ppc64, sparc64]
- dep: python3 (<< 3.13) [nicht hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- dep: python3 (>= 3.10~) [hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- dep: python3 (>= 3.11~) [nicht hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
-
- dep: python3-bioframe [nicht hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
-
- dep: python3-click
- Wrapper um optparse für Befehlszeilenprogramme - Python 3.x
-
- dep: python3-nose [hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- test discovery and running for Python3 unittest
-
- dep: python3-numpy (>= 1:1.20.0) [hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- Fast array facility to the Python language (Python 3)
- dep: python3-numpy (>= 1:1.22.0) [nicht hppa, ia64, ppc64, sh4, sparc64, x32]
- dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0) [sh4]
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- dep: python3-numpy-abi9
- virtuelles Paket, bereitgestellt durch python3-numpy
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- dep: python3-pandas [nicht hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- data structures for "relational" or "labeled" data
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- dep: python3-pysam (>= 0.20.0+ds-3~) [nicht hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
-
- dep: python3-scipy [nicht hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- Wissenschaftliche Werkzeuge für Python 3
-
- dep: python3-yaml [nicht hppa, ia64, ppc64, sparc64, x32]
- Python3-Parser und -Emitter für YAML
-
- sug: python3-pairtools-examples (>= 1.0.2)
- Process sequencing data from a Hi-C experiment (examples)
python3-pairtools herunterladen
Architektur | Version | Paketgröße | Größe (installiert) | Dateien |
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alpha (inoffizielle Portierung) | 1.0.3-1 | 207,9 kB | 1.177,0 kB | [Liste der Dateien] |
amd64 | 1.0.3-1 | 226,4 kB | 1.021,0 kB | [Liste der Dateien] |
arm64 | 1.0.3-1 | 202,3 kB | 1.043,0 kB | [Liste der Dateien] |
armel | 1.0.3-1 | 199,0 kB | 903,0 kB | [Liste der Dateien] |
armhf | 1.0.3-1 | 203,9 kB | 763,0 kB | [Liste der Dateien] |
hppa (inoffizielle Portierung) | 0.3.0-3.2+b2 | 144,6 kB | 640,0 kB | [Liste der Dateien] |
i386 | 1.0.3-1 | 226,5 kB | 1.007,0 kB | [Liste der Dateien] |
ia64 (inoffizielle Portierung) | 0.3.0-3.2+b1 | 137,3 kB | 612,0 kB | [Liste der Dateien] |
m68k (inoffizielle Portierung) | 1.0.3-1 | 202,5 kB | 923,0 kB | [Liste der Dateien] |
mips64el | 1.0.3-1 | 194,3 kB | 1.191,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64 (inoffizielle Portierung) | 0.3.0-3.2+b2 | 146,6 kB | 752,0 kB | [Liste der Dateien] |
ppc64el | 1.0.3-1 | 217,0 kB | 1.171,0 kB | [Liste der Dateien] |
riscv64 | 1.0.3-1 | 221,6 kB | 871,0 kB | [Liste der Dateien] |
sh4 (inoffizielle Portierung) | 1.0.3-1+b1 | 309,0 kB | 1.152,0 kB | [Liste der Dateien] |
sparc64 (inoffizielle Portierung) | 0.3.0-3.2+b2 | 125,9 kB | 2.292,0 kB | [Liste der Dateien] |
x32 (inoffizielle Portierung) | 0.3.0-3.2+b1 | 121,6 kB | 405,0 kB | [Liste der Dateien] |