Package: samtools (1.20-3) [debports]

[ Source:  ]

Forarbejdning af sekvensopstillinger i SAM-, BAM- og CRAM-formater

Samtools er et sæt af værktøjer, der manipulerer sammenligninger af nukleotidsekvenser i det binære BAM-format. Værktøjet importerer fra og eksporterer til ascii SAM-formatet (Sequence Alignment/Map) og CRAM-formater, udfører sortering, sammenlægning og indeksering, og gør det muligt at hente læsninger i alle områder hurtigt. Det er designet til at arbejde på en strøm, og er i stand til at åbne en BAM- eller CRAM-fil (ikke SAM) på en ekstern FTP- eller HTTP-server.

Other Packages Related to samtools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.20~)

  C-bibliotek for høj-gennemløb sekvensdataformater

• dep: libncurses6 (>= 6)

  delte biblioteker til terminalhåndtering

• dep: libtinfo6 (>= 6)

  delt terminfo-bibliotek på lavt niveau for terminalhåndtering

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

• sug: cwltool

  Common Workflow Language - referenceimplementering

Download samtools

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	634.3 kB	1,371.0 kB	[list of files]