Пакунок: samtools (1.19.2-1 and others) [debports]

[ Source:  ]

processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats

Samtools is a set of utilities that manipulate nucleotide sequence alignments in the binary BAM format. It imports from and exports to the ascii SAM (Sequence Alignment/Map) and CRAM formats, does sorting, merging and indexing, and allows one to retrieve reads in any regions swiftly. It is designed to work on a stream, and is able to open a BAM or CRAM (not SAM) file on a remote FTP or HTTP server.

Інші пакунки пов'язані з samtools

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: libncurses6 (>= 6)

  Спільні бібліотеки для роботи із терміналом

• dep: libtinfo6 (>= 6)

  Низькорівнева колективна бібліотека „terminfo“ для роботи з терміналом

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

• sug: cwltool

  Common Workflow Language reference implementation

Завантажити samtools

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Версія	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
hppa (unofficial port)	1.19.2-1+b1	627.8 kB	1,355.0 kB	[список файлів]