Package: libbifrost0 (1.3.5-2)

[ Source: bifrost  ]

Bibliotek for parallel konstruktion, indeksering og forespørgsel af de Bruijn-grafer

Libbifrost er det delte bibliotek for kommandolinjeværktøjet bifrost for sekventering, der har en bred vifte af funktioner, såsom indeksering, redigering og forespørgsel af grafen samt inkluderer en farvemetode for grafen, der oversætter hver k-mer for grafen til genomerne de fremgår af.

 * Bygge, indeksere, farvelægge og forespørge de kompakte de Bruijn-grafer
 * Intet behov for at bygge de udpakkede de Bruijn-grafer
 * Læsninger eller samlede genomer som inddata
 * Resultatgraf i GFA (kan visualiseres med Bandage), FASTA eller binært
 * Grafrensning: kort fif-klipning etc.
 * Flere tråde
 * Ingen parametre at estimere med andre værktøjer
 * Præcis eller tilnærmelsesvis k-mer-søgning for forespørgsler

Other Packages Related to libbifrost0

• dep: libc6 (>= 2.38)

  GNU C-bibliotek: Delte biblioteker
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not amd64, riscv64]

  GCC støttebibliotek

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  GNU Standard C++ bibliotek v3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Komprimeringsbibliotek - kørselstid

Download libbifrost0

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	451.7 kB	1,512.0 kB	[list of files]
arm64	411.4 kB	1,388.0 kB	[list of files]
ppc64el	473.1 kB	1,708.0 kB	[list of files]
riscv64	452.7 kB	1,128.0 kB	[list of files]
s390x	473.9 kB	1,632.0 kB	[list of files]