Пакунок: libbifrost0 (1.3.5-2)

[ Source: bifrost  ]

library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

Libbifrost is the shared library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Інші пакунки пов'язані з libbifrost0

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Бібліотека GNU C: спільні бібліотеки
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [not amd64, riscv64]

  Допоміжна бібліотека GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64, riscv64]

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  Стандартна бібліотека C++ GNU, версії 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  Бібліотека стискання даних (виконавчий модуль)

Завантажити libbifrost0

Завантаження для всіх доступних архітектур

Архітектура	Розмір пакунка	Розмір після встановлення	Файли
amd64	451.7 kB	1,512.0 kB	[список файлів]
arm64	411.4 kB	1,388.0 kB	[список файлів]
ppc64el	473.1 kB	1,708.0 kB	[список файлів]
riscv64	452.7 kB	1,128.0 kB	[список файлів]
s390x	473.9 kB	1,632.0 kB	[список файлів]