Package: dialign-tx (1.0.2-13)

[ Source: dialign-t  ]

Segmentové uspořádání násobných sekvencí

DIALIGN-TX je nástroj pro příkazovou řádku umožňující provádět alignmenty několika proteinových nebo DNA sekvencí. Je to úplně přepsaná implementace segmentového přístupu s několika vylepšeními a heuristikou, což výrazně zvyšuje kvalitu výsledných aligmentů v porovnání s DIALIGN 2.2 a DIALIGN T. Pro párové alignmenty používá algoritmus "řetězení fragmentů" (fragment chaining), který upřednostňuje řetězce lokálních alignmentů s nízkým skóre před jednotlivými fragmenty s vysokým skóre. Pro násobné alignmenty DIALIGN-TN používá vylepšený "hladový postup" (greedy procedure), který není tak citlivý na nepodstatné lokální podobnosti.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::TODO, Supports Format: Plain Text, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-13)

  Segment-based multiple sequence alignment (data files)

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Knihovna GNU C: Sdílené knihovny
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Download dialign-tx

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	80.2 kB	204.0 kB	[list of files]