Paquet : dialign-tx (1.0.2-13)

[ Paquet source : dialign-t  ]

alignement séquentiel multiple basé sur les segments

DIALIGN-TX est un outil en ligne de commandes pour réaliser un alignement multiple de séquences de protéines ou d'ADN. C'est une ré-implémentation complète de l'approche basée sur les segments incluant plusieurs nouvelles améliorations et heuristiques qui améliore significativement la qualité des alignements en sortie comparée à DIALIGN 2.2 et DIALIGN-T. Pour les alignements par paires, DIALIGN-TX utilise un algorithme de « fragment- chaining » qui favorise les chaînes d'alignements locaux de faible score plutôt que les fragments isolés de score élevé. Pour l'alignement multiple, DIALIGN-TX utilise une procédure gloutonne améliorée qui est moins sensible aux fausses similitudes locales des séquences.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::comparing, works-with-format::TODO, Format pris en charge: Texte simple, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à dialign-tx

• dep: dialign-tx-data (= 1.0.2-13)

  alignement de plusieurs séquences par segments – fichiers de données

• dep: libc6 (>= 2.29)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• enh: t-coffee

  alignement multiple de séquences

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Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	80,2 ko	204,0 ko	[liste des fichiers]