Пакет: libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-11 и други)

[ Източник: libfastahack  ]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (devel)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This is the development package containing the statically linked library and the header files.

Етикети: Software Development: Библиотеки, Role: Development Library

Други пакети, свързани с libfastahack-dev

• dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11) [ia64]

  library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

  dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b2) [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

  dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b3) [amd64, arm64, armhf, i386, loong64, ppc64el, riscv64, s390x]

Изтегляне на libfastahack-dev

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11+b2	28,5 кБ	162,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b3	27,3 кБ	117,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b3	26,0 кБ	116,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b3	24,7 кБ	88,0 кБ	[списък на файловете]
hppa (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11+b2	27,0 кБ	96,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.0.0+dfsg-11+b3	29,0 кБ	101,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11	33,3 кБ	165,0 кБ	[списък на файловете]
loong64	1.0.0+dfsg-11+b3	106,4 кБ	1 173,0 кБ	[списък на файловете]
m68k (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11+b2	25,9 кБ	96,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11+b2	27,3 кБ	120,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b3	27,5 кБ	119,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b3	108,3 кБ	1 259,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b3	26,9 кБ	116,0 кБ	[списък на файловете]
sh4 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11+b2	25,9 кБ	84,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11+b2	23,0 кБ	108,0 кБ	[списък на файловете]
x32 (неофициална архитектура)	1.0.0+dfsg-11+b2	27,1 кБ	99,0 кБ	[списък на файловете]