パッケージ: libfastahack-dev (1.0.0+dfsg-11 など)

libfastahack-dev に関するリンク

Debian の資源:

libfastahack ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (devel)

fastahack is a small application for indexing and extracting sequences and subsequences from FASTA files. The included Fasta.cpp library provides a FASTA reader and indexer that can be embedded into applications which would benefit from directly reading subsequences from FASTA files. The library automatically handles index file generation and use.

Features:

 * FASTA index (.fai) generation for FASTA files
 * Sequence extraction
 * Subsequence extraction
 * Sequence statistics (currently only entropy is provided)

Sequence and subsequence extraction use fseek64 to provide fastest-possible extraction without RAM-intensive file loading operations. This makes fastahack a useful tool for bioinformaticists who need to quickly extract many subsequences from a reference FASTA sequence.

This is the development package containing the statically linked library and the header files.

タグ: ソフトウェア開発: ライブラリ, 役割: 開発ライブラリ

その他の libfastahack-dev 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11) [ia64]

library for indexing and sequence extraction from FASTA files (lib)

dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b1) [alpha, hppa, loong64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32]

dep: libfastahack0 (= 1.0.0+dfsg-11+b2) [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x]

libfastahack-dev のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	28.5 kB	164.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.0.0+dfsg-11+b2	27.2 kB	117.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.0.0+dfsg-11+b2	25.5 kB	114.0 kB	[ファイル一覧]
armel	1.0.0+dfsg-11+b2	26.6 kB	105.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	1.0.0+dfsg-11+b2	26.5 kB	92.0 kB	[ファイル一覧]
hppa (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	27.1 kB	96.0 kB	[ファイル一覧]
i386	1.0.0+dfsg-11+b2	28.8 kB	102.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11	33.3 kB	165.0 kB	[ファイル一覧]
loong64 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	106.8 kB	1,190.0 kB	[ファイル一覧]
m68k (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	26.6 kB	101.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	1.0.0+dfsg-11+b2	28.7 kB	136.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	27.1 kB	121.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.0.0+dfsg-11+b2	27.3 kB	119.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.0.0+dfsg-11+b2	78.2 kB	697.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.0.0+dfsg-11+b2	26.9 kB	117.0 kB	[ファイル一覧]
sh4 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	29.5 kB	94.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	23.1 kB	108.0 kB	[ファイル一覧]
x32 (非公式の移植版)	1.0.0+dfsg-11+b1	27.4 kB	99.0 kB	[ファイル一覧]