Пакет: libbifrost-dev (1.3.1-1)

[ Източник: bifrost  ]

static library and header files for libbifrost

Libbifrost-dev is the development library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

Други пакети, свързани с libbifrost-dev

• dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1)

  library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

Изтегляне на libbifrost-dev

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
alpha (неофициална архитектура)	637,5 кБ	5 213,0 кБ	[списък на файловете]
amd64	588,8 кБ	3 858,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	556,6 кБ	3 837,0 кБ	[списък на файловете]
ia64 (неофициална архитектура)	727,4 кБ	5 395,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	612,3 кБ	4 463,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64 (неофициална архитектура)	603,5 кБ	4 167,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	619,4 кБ	4 138,0 кБ	[списък на файловете]
riscv64	1 790,5 кБ	18 705,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	610,5 кБ	4 019,0 кБ	[списък на файловете]
sparc64 (неофициална архитектура)	536,7 кБ	3 889,0 кБ	[списък на файловете]