パッケージ: libbifrost-dev (1.3.5-2 など)

libbifrost-dev に関するリンク

Debian の資源:

bifrost ソースパッケージをダウンロード:

メンテナ:

外部の資源:

ホームページ [github.com]

類似のパッケージ:

static library and header files for libbifrost

Libbifrost-dev is the development library for the command-line tool bifrost for sequencing that features a broad range of functions, such as indexing, editing, and querying the graph, and includes a graph coloring method that maps each k-mer of the graph to the genomes it occurs in.

 * Build, index, color and query the compacted de Bruijn graph
 * No need to build the uncompacted de Bruijn graph
 * Reads or assembled genomes as input
 * Output graph in GFA (can be visualized with Bandage), FASTA or binary
 * Graph cleaning: short tip clipping, etc.
 * Multi-threaded
 * No parameters to estimate with other tools
 * Exact or approximate k-mer search of queries

その他の libbifrost-dev 関連パッケージ

依存

推奨

提案

enhances

dep: libbifrost0 (= 1.3.1-1) [ia64]

library for parallel construction, indexing and querying of de Bruijn graphs

dep: libbifrost0 (= 1.3.5-2) [ia64 以外]

libbifrost-dev のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード
アーキテクチャ	バージョン	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
alpha (非公式の移植版)	1.3.5-2	681.7 kB	5,376.0 kB	[ファイル一覧]
amd64	1.3.5-2	629.7 kB	4,029.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	1.3.5-2	608.6 kB	4,021.0 kB	[ファイル一覧]
ia64 (非公式の移植版)	1.3.1-1	727.4 kB	5,395.0 kB	[ファイル一覧]
loong64	1.3.5-2	2,464.7 kB	28,789.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64 (非公式の移植版)	1.3.5-2	653.6 kB	4,323.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	1.3.5-2	663.9 kB	4,282.0 kB	[ファイル一覧]
riscv64	1.3.5-2	2,555.7 kB	30,133.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	1.3.5-2	661.8 kB	4,212.0 kB	[ファイル一覧]
sparc64 (非公式の移植版)	1.3.5-2	578.8 kB	4,033.0 kB	[ファイル一覧]