Пакет: velvet (1.2.10+dfsg1-7)

[ Източник: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Етикети: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Purpose: Analysing

Други пакети, свързани с velvet

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  GCC OpenMP (GOMP) support library

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  compression library - runtime

• sug: velvet-example

  Example data for the Velvet sequence assembler

Изтегляне на velvet

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	662,4 кБ	1 255,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	643,7 кБ	1 214,0 кБ	[списък на файловете]
armel	659,4 кБ	1 344,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	645,5 кБ	1 049,0 кБ	[списък на файловете]
i386	687,6 кБ	1 430,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	662,0 кБ	1 432,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	679,6 кБ	1 485,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	672,3 кБ	1 586,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	648,1 кБ	1 302,0 кБ	[списък на файловете]