Pakiet: velvet (1.2.10+dfsg1-7)

[ Pakiet źródłowy: velvet  ]

Nucleic acid sequence assembler for very short reads

Velvet is a de novo genomic assembler specially designed for short read sequencing technologies, such as Solexa or 454, developed by Daniel Zerbino and Ewan Birney at the European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI), near Cambridge, in the United Kingdom.

Velvet currently takes in short read sequences, removes errors then produces high quality unique contigs. It then uses paired read information, if available, to retrieve the repeated areas between contigs.

Znaczniki: Dziedzina: Biologia, Bioinformatyka, Zaimplementowane w: implemented-in::c, interface::commandline, Rola: Program, Przeznaczenie: Analizowanie

Inne pakiety związane z velvet

• dep: libc6 (>= 2.29)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  Biblioteka wspierająca GCC OpenMP (GOMP)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.0.2)

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

• sug: velvet-example

  Example data for the Velvet sequence assembler

Pobieranie velvet

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	662,4 KiB	1 255,0 KiB	[lista plików]
arm64	643,7 KiB	1 214,0 KiB	[lista plików]
armel	659,4 KiB	1 344,0 KiB	[lista plików]
armhf	645,5 KiB	1 049,0 KiB	[lista plików]
i386	687,6 KiB	1 430,0 KiB	[lista plików]
mips64el	662,0 KiB	1 432,0 KiB	[lista plików]
mipsel	679,6 KiB	1 485,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	672,3 KiB	1 586,0 KiB	[lista plików]
s390x	648,1 KiB	1 302,0 KiB	[lista plików]