[ experimental ]
[ 原始碼： libssw ]
套件：libssw1（1.2.5-1 以及其他的）
試製（Experimental）套件
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fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.
其他與 libssw1 有關的套件
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU C 函式庫：共用函式庫
同時作為一個虛擬套件由這些套件填實： libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [除 armel, armhf, ia64, m68k]
- GCC 支援函式庫
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 支援函式庫
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU Standard C++ Library v3
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- dep: libunwind8 [ia64]
- library to determine the call-chain of a program - runtime
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- dep: zlib1g
- 壓縮函式庫 - 跑程式時用(runtime)
下載 libssw1
| 硬體架構 | 版本 | 套件大小 | 安裝後大小 | 檔案 |
|---|---|---|---|---|
| alpha （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 24。3 kB | 85。0 kB | [檔案列表] |
| amd64 | 1.2.5-1 | 20。9 kB | 56。0 kB | [檔案列表] |
| arm64 | 1.2.5-1 | 19。4 kB | 84。0 kB | [檔案列表] |
| armel | 1.2.5-1 | 20。2 kB | 56。0 kB | [檔案列表] |
| armhf | 1.2.5-1 | 20。7 kB | 52。0 kB | [檔案列表] |
| i386 | 1.2.5-1 | 25。2 kB | 80。0 kB | [檔案列表] |
| ia64 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 28。7 kB | 89。0 kB | [檔案列表] |
| m68k （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 23。1 kB | 68。0 kB | [檔案列表] |
| mips64el | 1.2.5-1 | 24。5 kB | 86。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 25。4 kB | 84。0 kB | [檔案列表] |
| ppc64el | 1.2.5-1 | 19。7 kB | 84。0 kB | [檔案列表] |
| riscv64 | 1.2.5-1+b1 | 25。4 kB | 57。0 kB | [檔案列表] |
| s390x | 1.2.5-1 | 24。7 kB | 68。0 kB | [檔案列表] |
| sh4 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 26。9 kB | 84。0 kB | [檔案列表] |
| sparc64 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 23。0 kB | 1，046。0 kB | [檔案列表] |
| x32 （非官方移植版） | 1.2.5-1 | 20。8 kB | 56。0 kB | [檔案列表] |