パッケージ: libssw1 (1.2.5-1 など)
試験的な (experimental の) パッケージ
警告: このパッケージは experimental ディストリビューションのものです。つまり、おそらく不安定でバグがあり、それどころかデータの損失を起こすかもしれません。使用前には、変更履歴やその他の参照可能なドキュメントを必ず調べてください。
fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm
SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.
その他の libssw1 関連パッケージ
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- dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]
- dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]
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- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
- GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]
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- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf, ia64, m68k 以外]
- GCC 共有ライブラリ
- dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]
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- dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]
- GCC 共有ライブラリ
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- dep: libstdc++6 (>= 11)
- GNU 標準 C++ ライブラリ v3
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- dep: libunwind8 [ia64]
- プログラムのコールチェーン測定ライブラリ - ランタイム版
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- dep: zlib1g
- 圧縮ライブラリ - ランタイム
libssw1 のダウンロード
| アーキテクチャ | バージョン | パッケージサイズ | インストールサイズ | ファイル |
|---|---|---|---|---|
| alpha (非公式の移植版) | 1.2.5-1 | 24.3 kB | 85.0 kB | [ファイル一覧] |
| amd64 | 1.2.5-1 | 20.9 kB | 56.0 kB | [ファイル一覧] |
| arm64 | 1.2.5-1 | 19.4 kB | 84.0 kB | [ファイル一覧] |
| armel | 1.2.5-1 | 20.2 kB | 56.0 kB | [ファイル一覧] |
| armhf | 1.2.5-1 | 20.7 kB | 52.0 kB | [ファイル一覧] |
| i386 | 1.2.5-1 | 25.2 kB | 80.0 kB | [ファイル一覧] |
| ia64 (非公式の移植版) | 1.2.5-1 | 28.7 kB | 89.0 kB | [ファイル一覧] |
| m68k (非公式の移植版) | 1.2.5-1 | 23.1 kB | 68.0 kB | [ファイル一覧] |
| mips64el | 1.2.5-1 | 24.5 kB | 86.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64 (非公式の移植版) | 1.2.5-1 | 25.4 kB | 84.0 kB | [ファイル一覧] |
| ppc64el | 1.2.5-1 | 19.7 kB | 84.0 kB | [ファイル一覧] |
| riscv64 | 1.2.5-1+b1 | 25.4 kB | 57.0 kB | [ファイル一覧] |
| s390x | 1.2.5-1 | 24.7 kB | 68.0 kB | [ファイル一覧] |
| sh4 (非公式の移植版) | 1.2.5-1 | 26.9 kB | 84.0 kB | [ファイル一覧] |
| sparc64 (非公式の移植版) | 1.2.5-1 | 23.0 kB | 1,046.0 kB | [ファイル一覧] |
| x32 (非公式の移植版) | 1.2.5-1 | 20.8 kB | 56.0 kB | [ファイル一覧] |