Paquet : libssw1 (1.2.5-1 et autres)

[ Paquet source : libssw  ]

Paquet « expérimental »

Avertissement : ce paquet appartient à la distribution expérimentale. Cela signifie qu'il peut être instable ou bogué et peut éventuellement causer des pertes de données. Assurez-vous de consulter le journal des modifications (changelog) et les autres documentations existantes avant de l'utiliser.

fast SIMD parallelized implementation of the Smith-Waterman algorithm

SSW is a fast implementation of the Smith-Waterman algorithm, which uses the Single-Instruction Multiple-Data (SIMD) instructions to parallelize the algorithm at the instruction level. SSW library provides an API that can be flexibly used by programs written in C, C++ and other languages. The library can do protein and genome alignment directly. Current version of this implementation is ~50 times faster than an ordinary Smith-Waterman. It can return the Smith-Waterman score, alignment location and traceback path (cigar) of the optimal alignment accurately; and return the sub-optimal alignment score and location heuristically.

Autres paquets associés à libssw1

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.16) [x32]

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.27) [riscv64]

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

  dep: libc6 (>= 2.4) [armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, s390x, sparc64]

• dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.4) [alpha]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf, ia64, m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libstdc++6 (>= 11)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: zlib1g

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger libssw1

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	1.2.5-1	24,3 ko	85,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	1.2.5-1	20,9 ko	56,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	1.2.5-1	19,4 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
armel	1.2.5-1	20,2 ko	56,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	1.2.5-1	20,7 ko	52,0 ko	[liste des fichiers]
i386	1.2.5-1	25,2 ko	80,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	1.2.5-1	28,7 ko	89,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	1.2.5-1	23,1 ko	68,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	1.2.5-1	24,5 ko	86,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	1.2.5-1	25,4 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	1.2.5-1	19,7 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	1.2.5-1+b1	25,4 ko	57,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	1.2.5-1	24,7 ko	68,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	1.2.5-1	26,9 ko	84,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	1.2.5-1	23,0 ko	1 046,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	1.2.5-1	20,8 ko	56,0 ko	[liste des fichiers]