Пакет: edlib-aligner (1.2.7-4 и други)

[ Източник: libedlib  ]

edlib sequence alignment tool using edit distance

Edlib is a lightweight and super fast C/C++ library for sequence alignment using edit distance. This package provides an aligner using this library.

Features of libedlib

 * Calculates edit distance (Levehnstein distance).
 * It can find optimal alignment path (instructions how to transform
   first sequence into the second sequence).
 * It can find just the start and/or end locations of alignment path -
   can be useful when speed is more important than having exact
   alignment path.
 * Supports multiple alignment methods: global(NW), prefix(SHW) and
   infix(HW), each of them useful for different scenarios.
 * You can extend character equality definition, enabling you to e.g.
   have wildcard characters, to have case insensitive alignment or to
   work with degenerate nucleotides.
 * It can easily handle small or very large sequences, even when finding
   alignment path, while consuming very little memory.
 * Super fast thanks to Myers's bit-vector algorithm.

Други пакети, свързани с edlib-aligner

• dep: libc6 (>= 2.34)

  GNU C Library: Shared libraries
  също и виртуален пакет, предлаган от libc6-udeb

• dep: libedlib1 (= 1.2.7-4+b1)

  library for sequence alignment using edit distance

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [не armel, armhf]

  GCC support library

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  GNU Standard C++ Library v3

Изтегляне на edlib-aligner

Изтегляне за всички налични архитектури

Архитектура	Версия	Големина на пакета	Големина след инсталиране	Файлове
amd64	1.2.7-4+b1	24,2 кБ	67,0 кБ	[списък на файловете]
arm64	1.2.7-4+b1	22,4 кБ	87,0 кБ	[списък на файловете]
armel	1.2.7-4+b1	19,6 кБ	54,0 кБ	[списък на файловете]
armhf	1.2.7-4+b1	19,7 кБ	46,0 кБ	[списък на файловете]
i386	1.2.7-4+b1	23,2 кБ	62,0 кБ	[списък на файловете]
mips64el	1.2.7-4+b1	23,1 кБ	88,0 кБ	[списък на файловете]
mipsel	1.2.7-4+b1	22,3 кБ	87,0 кБ	[списък на файловете]
ppc64el	1.2.7-4+b1	27,4 кБ	87,0 кБ	[списък на файловете]
s390x	1.2.7-4+b1	22,7 кБ	67,0 кБ	[списък на файловете]