Balík: sprai (0.9.9.23+dfsg1-2)

[ Zdroj: sprai  ]

single-pass sequencing read accuracy improver

Sprai is a tool to correct sequencing errors in single-pass reads for de novo assembly. It is originally designed for correcting sequencing errors in single-molecule DNA sequencing reads, especially in Continuous Long Reads (CLRs) generated by PacBio RS sequencers. The goal of Sprai is not maximizing the accuracy of error-corrected reads. Instead, Sprai aims at maximizing the continuity (i.e., N50 contig length) of assembled contigs after error correction.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom sprai

• dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.7) [nie arm64, ppc64el]

• dep: ncbi-blast+

  next generation suite of BLAST sequence search tools

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: time

  program GNU time na meranie využitia zdrojov CPU

• sug: make

  nástroj na riadenie kompilácie

• sug: pbalign

  Balík nie je dostupný

• sug: pbgenomicconsensus

  Balík nie je dostupný

• sug: pbh5tools

  Balík nie je dostupný

Stiahnuť sprai

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	1,475.9 kB	1,706.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	1,473.9 kB	1,694.0 kB	[zoznam súborov]
armel	1,473.3 kB	1,686.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	1,471.6 kB	1,666.0 kB	[zoznam súborov]
i386	1,477.0 kB	1,710.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	1,476.7 kB	1,705.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	1,477.6 kB	1,882.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	1,473.9 kB	1,698.0 kB	[zoznam súborov]