Balík: ncbi-blast+ (2.16.0+ds-7)

[ Zdroj: ncbi-blast+  ]

next generation suite of BLAST sequence search tools

The Basic Local Alignment Search Tool (BLAST) is the most widely used sequence similarity tool. There are versions of BLAST that compare protein queries to protein databases, nucleotide queries to nucleotide databases, as well as versions that translate nucleotide queries or databases in all six frames and compare to protein databases or queries. PSI-BLAST produces a position-specific-scoring-matrix (PSSM) starting with a protein query, and then uses that PSSM to perform further searches. It is also possible to compare a protein or nucleotide query to a database of PSSM’s. The NCBI supports a BLAST web page at blast.ncbi.nlm.nih.gov as well as a network service.

Značky: Pole: Biológia, Bioinformatika, Implementované v: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Purpose: use::analysing, works-with::biological-sequence

Ostatné balíky súvisiace s balíkom ncbi-blast+

• dep: libatomic1 (>= 4.8) [armel]

  pomocná knižnica poskytujúca zabudované funkcie __atomic

• dep: libbz2-1.0

  kvalitná knižnica na komprimáciu súborov s triedením blokov - dynamická knižnica

• dep: libc6 (>= 2.38)

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [s390x]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [amd64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ppc64el]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.5) [arm64, riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 7) [i386]

• dep: libgomp1 (>= 6)

  podporná knižnica GCC OpenMP (GOMP)

• dep: liblmdb0 (>= 0.9.7)

  Lightning Memory-Mapped Database - zdieľaná knižnica

• dep: libmbedcrypto16 (>= 3.6.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - crypto library

• dep: libmbedtls21 (>= 3.6.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - tls library

• dep: libmbedx509-7 (>= 3.6.0)

  lightweight crypto and SSL/TLS library - x509 certificate library

• dep: libncbi-vdb3 (>= 3.2.1+dfsg) [amd64, arm64]

  libraries for using data in the INSDC Sequence Read Archives

• dep: libnghttp2-14 (>= 1.28.0)

  knižnica implementujúca protokol HTTP/2 - zdieľaná knižnica

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nová knižnica PCRE - 8-bitová dynamická knižnica

• dep: libsqlite3-0 (>= 3.6.12)

  zdieľaná knižnica SQLite 3

• dep: libstdc++6 (>= 14)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

• dep: libuv1t64 (>= 1.33.1)

  knižnica na asynchrónne oznamovanie udalostí - dynamická knižnica

• dep: libzstd1 (>= 1.5.5) [amd64, arm64]

  rýchly bezstratový komprimačný algoritmus

• dep: ncbi-data

  platformovo nezávislé dáta sady nástrojov NCBI

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: zlib1g (>= 1:1.2.11.dfsg)

  komprimačná knižnica - dynamická verzia

• enh: t-coffee

  Multiple Sequence Alignment

Stiahnuť ncbi-blast+

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	15,609.3 kB	70,546.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	14,119.1 kB	73,195.0 kB	[zoznam súborov]
armel	12,852.0 kB	60,567.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	13,117.6 kB	50,136.0 kB	[zoznam súborov]
i386	16,216.4 kB	68,340.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	14,625.5 kB	79,183.0 kB	[zoznam súborov]
riscv64	14,369.6 kB	56,126.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	14,171.8 kB	66,162.0 kB	[zoznam súborov]