Balík: zalign (0.9.1-5)

[ Zdroj: zalign  ]

parallel local alignment of biological sequences

zAlign is a local sequence aligner, especially intended for use with large biological DNA sequences, with more than 1Mbp (Millions of base pairs). It uses the Smith-Waterman exact algorithm with affine gap cost function to perform this task.

zAlign can be used both in distributed (clusters, for example) or standalone environments. Currently it has been tested on Linux and Sun Solaris, using both the MPICH (http://www.mcs.anl.gov/research/projects/mpi/mpich1/) and OpenMPI (http://www.open-mpi.org/) implementations. Ports for other Unix-like environments are highly considered.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom zalign

• dep: libc6 (>= 2.14) [amd64]

  knižnica GNU C - zdieľané knižnice
  tiež virtuálny balík poskytovaný balíkom libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.17) [arm64, ppc64el]

  dep: libc6 (>= 2.4) [nie amd64, arm64, ppc64el]

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [nie armel, armhf]

  podporná knižnica GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libopenmpi3 (>= 4.0.5)

  knižnica na vyskokovýkonné odovzdávanie správ - zdieľaná knižnica

• dep: libstdc++6 (>= 4.9)

  štandardná knižnica C++ GNU v3

Stiahnuť zalign

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
amd64	47.9 kB	267.0 kB	[zoznam súborov]
arm64	45.1 kB	263.0 kB	[zoznam súborov]
armel	25.4 kB	117.0 kB	[zoznam súborov]
armhf	25.6 kB	97.0 kB	[zoznam súborov]
i386	48.4 kB	261.0 kB	[zoznam súborov]
mips64el	50.3 kB	550.0 kB	[zoznam súborov]
mipsel	48.9 kB	318.0 kB	[zoznam súborov]
ppc64el	50.7 kB	415.0 kB	[zoznam súborov]
s390x	46.5 kB	287.0 kB	[zoznam súborov]