Balík: assemblytics (1.0+ds-2)

[ Zdroj: assemblytics  ]

detect and analyze structural variants from a genome assembly

Assemblytics incorporates a unique anchor filtering approach to increase robustness to repetitive elements, and identifies six classes of variants based on their distinct alignment signatures. Assemblytics can be applied both to comparing aberrant genomes, such as human cancers, to a reference, or to identify differences between related species.

Ostatné balíky súvisiace s balíkom assemblytics

• dep: perl

  Practical Extraction and Report Language od Larryho Walla

• dep: python3

  interactive high-level object-oriented language (default python3 version)

• dep: python3-numpy

  schopnosti rýchlych polí do jazyka Python 3

• dep: r-base-core

  jadro GNU R na štatistické výpočty a grafický systém

• dep: r-cran-ggplot2

  implementácia Gramatiky grafiky

• dep: r-cran-plyr

  nástroje na rozdeľovanie, aplikovanie a kombinovanie dát

• dep: r-cran-rcolorbrewer

  balík GNU R poskytujúci vhodné palety farieb

• rec: mummer

  Efficient sequence alignment of full genomes

Stiahnuť assemblytics

Stiahnuť pre všetky dostupné architektúry

Architektúra	Veľkosť balíka	Nainštalovaná veľkosť	Súbory
all	18.5 kB	88.0 kB	[zoznam súborov]