Пакет: damapper (0.0+git20240314.b025cf9-1 и другие)

[ Источник: damapper  ]

long read to reference genome mapping tool

Recognised as the Damapper Library, this is a long read to reference genome mapping command line tool.

For a given reference database 'X' and read block 'Y', damapper produces the single file 'Y.X.las'. Each output file is sorted in order of the A-reads, and if a match is a chain of local alignments, then the LA's in the chain occur in increasing order of A-coordinates.

HPC.damapper writes a UNIX shell script to the standard output that maps every read in blocks <first> to <last> of database <reads> to a reference sequence <ref>. If <last> is missing then only the single block <first> is mapped, and if <first> is also missing then all blocks of the database are mapped.

This package contains the damapper and HPC.damapper binaries.

Другие пакеты, относящиеся к damapper

• dep: libc6 (>= 2.34) [не alpha, ia64, sh4]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.39) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

Загрузка damapper

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Версия	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
alpha (неофициальный перенос)	0.0+git20240314.b025cf9-1	104,9 Кб	428,0 Кб	[список файлов]
amd64	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,3 Кб	316,0 Кб	[список файлов]
arm64	0.0+git20240314.b025cf9-1	96,8 Кб	364,0 Кб	[список файлов]
armel	0.0+git20240314.b025cf9-1	98,1 Кб	302,0 Кб	[список файлов]
armhf	0.0+git20240314.b025cf9-1	97,4 Кб	226,0 Кб	[список файлов]
hppa (неофициальный перенос)	0.0+git20240314.b025cf9-1	103,7 Кб	308,0 Кб	[список файлов]
i386	0.0+git20240314.b025cf9-1	109,5 Кб	346,0 Кб	[список файлов]
ia64 (неофициальный перенос)	0.0+git20210330.ab45103-2	128,4 Кб	549,0 Кб	[список файлов]
m68k (неофициальный перенос)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95,0 Кб	298,0 Кб	[список файлов]
mips64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	100,2 Кб	437,0 Кб	[список файлов]
ppc64 (неофициальный перенос)	0.0+git20240314.b025cf9-1	111,2 Кб	428,0 Кб	[список файлов]
ppc64el	0.0+git20240314.b025cf9-1	112,4 Кб	428,0 Кб	[список файлов]
riscv64	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,6 Кб	248,0 Кб	[список файлов]
s390x	0.0+git20240314.b025cf9-1	116,5 Кб	336,0 Кб	[список файлов]
sh4 (неофициальный перенос)	0.0+git20240314.b025cf9-1	120,6 Кб	298,0 Кб	[список файлов]
sparc64 (неофициальный перенос)	0.0+git20240314.b025cf9-1	95,8 Кб	2 094,0 Кб	[список файлов]
x32 (неофициальный перенос)	0.0+git20240314.b025cf9-1	106,3 Кб	298,0 Кб	[список файлов]