Пакет: r-bioc-demixt (1.14.0+dfsg-1)

[ Источник: r-bioc-demixt  ]

Cell type-specific deconvolution of heterogeneous tumor samples

When studying cancer cells from tumors excised from patients, the samples will be a mixture of tumors and healthy cells, e.g. from invading immune cells. For comparing samples, the interest may be more on comparing the transcriptome of the tumors themselves.

This package prepares the statistical separation (deconvolution) of RNAseq or microarray generated expression data for two or three components.

Другие пакеты, относящиеся к r-bioc-demixt

• dep: libc6 (>= 2.29)

  библиотека GNU C: динамически подключаемые библиотеки
  также виртуальный пакет, предоставляемый libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  вспомогательная библиотека GCC

• dep: libgomp1 (>= 4.9)

  вспомогательная библиотека GCC OpenMP (GOMP)

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  стандартная библиотека GNU C++ версии 3

• dep: r-api-4.0

  виртуальный пакет, предоставляемый r-base-core

• dep: r-api-bioc-3.16

  виртуальный пакет, предоставляемый r-bioc-biocgenerics

• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  GNU R core of statistical computation and graphics system

• dep: r-bioc-dss

  Bioconductor dispersion shrinkage for sequencing data

• dep: r-bioc-summarizedexperiment

  BioConductor assay container

• dep: r-bioc-sva

  GNU R Surrogate Variable Analysis

• dep: r-cran-base64enc

  GNU R package that provides tools for base64 encoding

• dep: r-cran-dendextend

  Extending 'dendrogram' Functionality in GNU R

• dep: r-cran-ggplot2

  implementation of the Grammar of Graphics

• dep: r-cran-kernsmooth

  GNU R package for kernel smoothing and density estimation

• dep: r-cran-knitr

  GNU R package for dynamic report generation using Literate Programming

• dep: r-cran-matrixcalc

  GNU R functions for matrix calculations -- matrixcalc

• dep: r-cran-matrixstats

  GNU R methods that apply to rows and columns of a matrix

• dep: r-cran-psych

  GNU R procedures for psychological, psychometric, and personality research

• dep: r-cran-rcpp (>= 1.0.0)

  GNU R package for Seamless R and C++ Integration

• dep: r-cran-rmarkdown

  convert R markdown documents into a variety of formats

• dep: r-cran-truncdist

  GNU R functions for truncated random variables

Загрузка r-bioc-demixt

Загрузить для всех доступных архитектур

Архитектура	Размер пакета	В установленном виде	Файлы
s390x	2 584,2 Кб	3 128,0 Кб	[список файлов]