Pacote: libgkarrays-dev (2.1.0+dfsg-4.2 e outros)

[ Fonte: libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences (development)

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

This is the development library for libgkarrays.

Etiquetas: Desenvolvimento de software: Bibliotecas, Função: Biblioteca de desenvolvimento

Outros pacotes relacionados a libgkarrays-dev

• dep: libgkarrays1t64 (= 2.1.0+dfsg-4.2) [não arm64]

  library to query large collection of NGS sequences

  dep: libgkarrays1t64 (= 2.1.0+dfsg-4.2+b1) [arm64]

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Arquitetura	Versão	Tamanho do pacote	Tamanho instalado	Arquivos
alpha (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	92.8 kB	611.0 kB	[lista de arquivos]
amd64	2.1.0+dfsg-4.2	83.2 kB	515.0 kB	[lista de arquivos]
arm64	2.1.0+dfsg-4.2+b1	81.3 kB	513.0 kB	[lista de arquivos]
armel	2.1.0+dfsg-4.2	81.2 kB	461.0 kB	[lista de arquivos]
armhf	2.1.0+dfsg-4.2	80.0 kB	439.0 kB	[lista de arquivos]
hppa (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	96.0 kB	498.0 kB	[lista de arquivos]
i386	2.1.0+dfsg-4.2	90.7 kB	495.0 kB	[lista de arquivos]
ia64 (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	100.7 kB	607.0 kB	[lista de arquivos]
loong64 (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	149.6 kB	1,279.0 kB	[lista de arquivos]
m68k (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	85.5 kB	478.0 kB	[lista de arquivos]
mips64el	2.1.0+dfsg-4.2	89.6 kB	563.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64 (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	86.3 kB	538.0 kB	[lista de arquivos]
ppc64el	2.1.0+dfsg-4.2	87.1 kB	531.0 kB	[lista de arquivos]
riscv64	2.1.0+dfsg-4.2	160.8 kB	1,390.0 kB	[lista de arquivos]
s390x	2.1.0+dfsg-4.2	79.4 kB	510.0 kB	[lista de arquivos]
sh4 (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	85.0 kB	443.0 kB	[lista de arquivos]
sparc64 (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	77.9 kB	514.0 kB	[lista de arquivos]
x32 (porte não oficial)	2.1.0+dfsg-4.2	82.4 kB	468.0 kB	[lista de arquivos]