Paket: libgkarrays-dev (2.1.0+dfsg-4.2)

[ Quellcode: libgkarrays  ]

library to query large collection of NGS sequences (development)

Gk-arrays are provided as a simple-to-use C++ library dedicated to queries on large collection of sequences as produced by high-throughput sequencers (e.g. HiSeq 2000 from Illumina, 454 from Roche).

Gk-arrays index k-mers of reads and allows one to answer different queries on that read collection (e.g. how many reads share this k-mer? where does this k-mer occur in the read collection?).

Gk-arrays consist of a space-efficient alternative to hash tables while being similar in terms of query times.

This is the development library for libgkarrays.

Markierungen: Software-Entwicklung: Bibliotheken, Rolle: Entwicklungs-Bibliothek

Andere Pakete mit Bezug zu libgkarrays-dev

• dep: libgkarrays1t64 (= 2.1.0+dfsg-4.2)

  library to query large collection of NGS sequences

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Architektur	Paketgröße	Größe (installiert)	Dateien
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amd64	83,2 kB	515,0 kB	[Liste der Dateien]
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armel	81,2 kB	461,0 kB	[Liste der Dateien]
armhf	80,0 kB	439,0 kB	[Liste der Dateien]
hppa (inoffizielle Portierung)	96,0 kB	498,0 kB	[Liste der Dateien]
i386	90,7 kB	495,0 kB	[Liste der Dateien]
ia64 (inoffizielle Portierung)	100,7 kB	607,0 kB	[Liste der Dateien]
m68k (inoffizielle Portierung)	85,5 kB	478,0 kB	[Liste der Dateien]
mips64el	89,6 kB	563,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64 (inoffizielle Portierung)	86,3 kB	538,0 kB	[Liste der Dateien]
ppc64el	87,1 kB	531,0 kB	[Liste der Dateien]
riscv64	160,8 kB	1.390,0 kB	[Liste der Dateien]
s390x	79,4 kB	510,0 kB	[Liste der Dateien]
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sparc64 (inoffizielle Portierung)	77,9 kB	514,0 kB	[Liste der Dateien]
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