Package: autodock (4.2.6-8)

[ Source: autodocksuite  ]

análise das ligações do ligante à estrutura de proteína

AutoDock é um representante único dos programas que tratam a simulação da atracagem indo de ligantes químicos bem pequenos até receptores grandes de proteínas. Versões anteriores tinham toda a flexibilidade nos ligantes enquanto a proteína era mantida rígida. Esta última versão 4 também permite flexibilidade de cadeias laterais selecionadas dos resíduos de superfície, i.e., leva os "rotamers" em consideração.

O programa AutoDock realiza a atracagem do ligante a um conjunto de grades descrevendo a proteína alvo. O AutoGrid pré-calcula estas grades.

Tags: Field: Biology, Structural Biology, Implemented in: implemented-in::c, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::analysing, works-with-format::TODO, Works with: 3D Model, Need an extra tag

Other Packages Related to autodock

• dep: libc6 (>= 2.29)

  GNU Biblioteca C: Bibliotecas compartilhadas
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1)

  Biblioteca de suporte GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  Biblioteca C++ padrão da GNU v3

• sug: autodocktools

  Package not available

• sug: autogrid

  pré-calcula ligações de ligantes aos seus receptores

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