Pakiet: python-cogent (1.9-14) [debports]

Odnośniki dla python-cogent

Zasoby systemu Debian:

Raporty o błędach

Pobieranie pakietu źródłowego :

Nie znaleziono

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Strona internetowa [pycogent.org]

Podobne pakiety:

framework for genomic biology

PyCogent is a software library for genomic biology. It is a fully integrated and thoroughly tested framework for:

 * controlling third-party applications,
 * devising workflows; querying databases,
 * conducting novel probabilistic analyses of biological sequence
   evolution, and
 * generating publication quality graphics.

It is distinguished by many unique built-in capabilities (such as true codon alignment) and the frequent addition of entirely new methods for the analysis of genomic data.

Pakiety udostępniające python-cogent

python3-cogent3: framework for genomic biology

Inne pakiety związane z python-cogent

wymaga

poleca

sugeruje

enhances

dep: libc6 (>= 2.28)

Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb
dep: python

Pakiet niedostępny

dep: python (<< 2.8)

dep: python (>= 2.7~)
dep: python-matplotlib

Pakiet niedostępny
dep: python-numpy (>= 1:1.14.3)

Pakiet niedostępny
dep: python-numpy-abi9

Pakiet niedostępny

rec: blast2

Pakiet niedostępny
rec: cd-hit

Pakiet programów przeznaczonych do szybkiego grupowania sekwencji
rec: clearcut

Niezwykle wydajna rekonstrukcja drzewa filogenetycznego
rec: dialign

Dopasowanie wielu sekwencji w oparciu o segmenty
rec: muscle

Multiple alignment program of protein sequences

sug: cdbfasta

Narzędzia do indeksowania i przeszukiwania CDB z plików multi-Fasta
sug: clustalw

global multiple nucleotide or peptide sequence alignment
sug: fasttree

phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
sug: mafft

Multiple alignment program for amino acid or nucleotide sequences
sug: mothur

Zestaw narzędzi analizy sekwencyjnej do badań nad florą bakteryjną
sug: parsinsert

Parsimonious Insertion of unclassified sequences into phylogenetic trees
sug: python-cogent-doc

docs for python3-cogent3
sug: rdp-classifier

extensible sequence classifier for fungal lsu, bacterial and archaeal 16s
sug: rtax

Classification of sequence reads of 16S ribosomal RNA gene

Pobieranie python-cogent

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
sh4 (port nieoficjalny)	2 420,6 KiB	7 527,0 KiB	[lista plików]