Pakiet: macs (3.0.2-2 i inne)

[ Pakiet źródłowy: macs  ]

Model-based Analysis of ChIP-Seq on short reads sequencers

MACS empirically models the length of the sequenced ChIP fragments, which tends to be shorter than sonication or library construction size estimates, and uses it to improve the spatial resolution of predicted binding sites. MACS also uses a dynamic Poisson distribution to effectively capture local biases in the genome sequence, allowing for more sensitive and robust prediction. MACS compares favorably to existing ChIP-Seq peak-finding algorithms, is publicly available open source, and can be used for ChIP-Seq with or without control samples.

Inne pakiety związane z macs

• dep: libc6 (>= 2.38)

  Biblioteka GNU C: biblioteki współdzielone
  również pakiet wirtualny udostępniany przez libc6-udeb

• dep: python3

  Interaktywny, wysokopoziomowy i obiektowy język programowania (domyślna wersja Python 3)

  dep: python3 (<< 3.15)

  dep: python3 (>= 3.13~)

• dep: python3-cykhash

  cython wrapper for khash-sets/maps, efficient implementation of isin and unique

• dep: python3-hmmlearn

  unsupervised learning and inference of Hidden Markov Models

• dep: python3-numpy

  Biblioteka Pythona do obliczeń numerycznych (Python 3)

• dep: python3-numpy2-abi0

  pakiet wirtualny udostępniany przez python3-numpy

  lub python3-numpy-abi9

  Pakiet niedostępny

• dep: python3-scipy

  Narzędzia naukowe dla Pythona 3

• dep: python3-sklearn

  Python modules for machine learning and data mining - Python 3

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [nie armhf]

  Biblioteka kompresyjna - pliki wykonawcze

  dep: zlib1g (>= 1:1.2.3.3) [armhf]

Pobieranie macs

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur

Architektura	Wersja	Rozmiar pakietu	Rozmiar po instalacji	Pliki
amd64	3.0.2-2+b1	4 118,8 KiB	14 900,0 KiB	[lista plików]
arm64	3.0.2-2+b1	3 740,6 KiB	15 496,0 KiB	[lista plików]
armhf	3.0.2-2+b1	3 847,2 KiB	12 002,0 KiB	[lista plików]
i386	3.0.2-2+b1	3 889,5 KiB	16 084,0 KiB	[lista plików]
ppc64el	3.0.2-2+b1	3 945,5 KiB	18 952,0 KiB	[lista plików]
riscv64	3.0.2-2+b1	4 112,4 KiB	11 776,0 KiB	[lista plików]
s390x	3.0.2-2+b1	4 114,3 KiB	15 120,0 KiB	[lista plików]