wszystkie opcje
buster  ] [  bullseye  ] [  sid  ]
[ Pakiet źródłowy: e-mem  ]

Pakiet: e-mem (1.0.1-4)

Odnośniki dla e-mem

Screenshot

Zasoby systemu Debian:

Pobieranie pakietu źródłowego e-mem:

Opiekunowie:

Zasoby zewnętrzne:

Podobne pakiety:

Efficient computation of Maximal Exact Matches for very large genomes

E-MEM enables efficient computation of Maximal Exact Matches (MEMs) that does not use full text indexes. The algorithm uses much less space and is highly amenable to parallelization. It can compute all MEMs of minimum length 100 between the whole human and mouse genomes on a 12 core machine in 10 min and 2 GB of memory; the required memory can be as low as 600 MB. It can run efficiently genomes of any size. Extensive testing and comparison with currently best algorithms is provided.

Mummer has many different scripts where one of the key program is MEM computation. In all the scripts, the MEM computation program can be replaced with e-mem with ease for better performance.

Inne pakiety związane z e-mem

  • wymaga
  • poleca
  • sugeruje
  • enhances

Pobieranie e-mem

Pobierz dla wszystkich dostępnych architektur
Architektura Rozmiar pakietu Rozmiar po instalacji Pliki
amd64 34,1 KiB106,0 KiB [lista plików]
arm64 30,9 KiB94,0 KiB [lista plików]
armel 33,9 KiB101,0 KiB [lista plików]
armhf 33,5 KiB81,0 KiB [lista plików]
i386 40,2 KiB117,0 KiB [lista plików]
mips64el 33,6 KiB117,0 KiB [lista plików]
mipsel 40,9 KiB120,0 KiB [lista plików]
ppc64el 34,4 KiB162,0 KiB [lista plików]
s390x 31,5 KiB102,0 KiB [lista plików]