パッケージ: amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2)

[ ソース: amap-align  ]

Protein multiple alignment by sequence annealing

AMAP is a command line tool to perform multiple alignment of peptidic sequences. It utilizes posterior decoding, and a sequence-annealing alignment, instead of the traditional progressive alignment method. It is the only alignment program that allows one to control the sensitivity / specificity tradeoff. It is based on the ProbCons source code, but uses alignment metric accuracy and eliminates the consistency transformation.

The Java visualisation tool of AMAP 2.2 is not yet packaged in Debian.

タグ: 分野: 生物学, バイオインフォマティクス, 実装言語: implemented-in::c++, interface::commandline, 役割: プログラム, 対象範囲: ユーティリティ, 目的: use::analysing, use::comparing, サポート形式: プレーンテキスト, 取り扱い対象: 追加のタグが必要

その他の amap-align 関連パッケージ

• dep: libc6 (>= 2.27)

  GNU C ライブラリ: 共有ライブラリ
  以下のパッケージによって提供される仮想パッケージでもあります: libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [armel, armhf 以外]

  GCC 共有ライブラリ

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  GNU 標準 C++ ライブラリ v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [armel, armhf, s390x 以外]

amap-align のダウンロード

すべての利用可能アーキテクチャ向けのダウンロード

アーキテクチャ	パッケージサイズ	インストールサイズ	ファイル
amd64	129.2 kB	1,214.0 kB	[ファイル一覧]
arm64	121.6 kB	1,182.0 kB	[ファイル一覧]
armel	106.8 kB	1,174.0 kB	[ファイル一覧]
armhf	107.2 kB	1,118.0 kB	[ファイル一覧]
i386	112.0 kB	1,186.0 kB	[ファイル一覧]
mips64el	128.3 kB	1,216.0 kB	[ファイル一覧]
mipsel	127.3 kB	1,218.0 kB	[ファイル一覧]
ppc64el	140.3 kB	1,230.0 kB	[ファイル一覧]
s390x	109.2 kB	1,202.0 kB	[ファイル一覧]