Paquet : amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2)

[ Paquet source : amap-align  ]

alignement multiple de séquences protéiques par appariement

AMAP est un outil en ligne de commande pour effectuer des alignements multiples de séquences peptidiques. Il utilise le décodage a posteriori, et l'alignement par appariement de séquence, au lieu de la méthode traditionnelle d'alignement progressif. C'est le seul programme permettant le contrôle de la sensibilité et de la spécificité. Il est basé sur le code source de ProbCons mais utilise une métrique de précision et élimine la transformation de cohérence.

L'outil Java de visualisation d’AMAP 2.2 n'est pas encore disponible dans Debian.

Étiquettes: Domaine: Biologie, Bio-informatique, Mis en œuvre en: implemented-in::c++, interface::commandline, Rôle: Programme, Champ d'application: Utilitaire, But: use::analysing, use::comparing, Format pris en charge: Texte simple, Fonctionne avec: Étiquette supplémentaire nécessaire

Autres paquets associés à amap-align

• dep: libc6 (>= 2.27)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [non armel, armhf]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

• dep: libstdc++6 (>= 5.2) [armel, armhf, s390x]

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

  dep: libstdc++6 (>= 9) [non armel, armhf, s390x]

Télécharger amap-align

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
amd64	129,2 ko	1 214,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	121,6 ko	1 182,0 ko	[liste des fichiers]
armel	106,8 ko	1 174,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	107,2 ko	1 118,0 ko	[liste des fichiers]
i386	112,0 ko	1 186,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	128,3 ko	1 216,0 ko	[liste des fichiers]
mipsel	127,3 ko	1 218,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	140,3 ko	1 230,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	109,2 ko	1 202,0 ko	[liste des fichiers]