Package: tabix (1.20+ds-1)

[ Source: htslib  ]

indicizzatore generico per file di posizioni del genoma delimitate da TAB

Tabix indicizza i file in cui alcune colonne indicano coordinate di sequenze: nome (solitamente un cromosoma), inizio e fine. Il file di dati di input deve essere ordinato in base alla posizione e compresso con bgzip (fornito in questo pacchetto), che ha un'interfaccia simile a gzip. Dopo l'indicizzazione, tabix è in grado di recuperare velocemente righe di dati in base alle coordinate cromosomiche. Il veloce recupero dei dati funziona anche via rete se viene fornito un URI come nome di file.

Questo pacchetto è compilato dai sorgenti di HTSlib e fornisce gli strumenti bgzip, htsfile e tabix.

Tags: Implemented in: C, Role: Program, Science: science::calculation, use::calculating, Supports Format: HTML, Hypertext Markup Language, Works with: Text

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Download tabix

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	471.4 kB	2,249.0 kB	[list of files]
arm64	438.8 kB	2,249.0 kB	[list of files]
armel	401.4 kB	2,062.0 kB	[list of files]
armhf	404.8 kB	1,494.0 kB	[list of files]
i386	517.3 kB	2,566.0 kB	[list of files]
mips64el	430.6 kB	2,618.0 kB	[list of files]
ppc64el	508.1 kB	3,017.0 kB	[list of files]
riscv64	488.8 kB	1,893.0 kB	[list of files]
s390x	462.5 kB	2,465.0 kB	[list of files]