Package: python3-biopython (1.83+dfsg1-2) [debports]

[ Source:  ]

libreria Python 3 per bioinformatica

Il progetto Biopython è un'associazione internazionale di sviluppatori di strumenti Python disponibili liberamente per i calcoli biologici molecolari.

È uno sforzo collaborativo distribuito per sviluppare librerie e applicazioni Python 3 che si rivolgono verso i bisogni dei lavori in bioinformatica attuali e futuri. Il codice sorgente è reso disponibile sotto la licenza Biopython, che è estremamente liberale e compatibile con pressoché qualsiasi licenza esistente. Il progetto lavora accanto alla Open Bioinformatics Foundation, che generosamente fornisce lo spazio web e CVS per il progetto.

Other Packages Related to python3-biopython

• dep: libc6 (>= 2.4)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: python3

  linguaggio interattivo di alto livello orientato agli oggetti (versione python3 predefinita)

  dep: python3 (<< 3.13)

  dep: python3 (>= 3.11~)

• dep: python3-numpy (>= 1:1.25.0)

  veloce funzionalità per array per il linguaggio Python (Python 3)

• dep: python3-numpy-abi9

  virtual package provided by python3-numpy

• dep: python3-reportlab (>= 4.0.4-1~)

  libreria ReportLab per creare documenti PDF usando Python3

• dep: w3c-sgml-lib

  file di catalogo e DTD di w3.org

• rec: ncbi-blast+ (>= 2.10.1-3)

  suite di prossima generazione degli strumenti di ricerca di sequenze BLAST

• rec: python-biopython-doc (= 1.83+dfsg1-2)

  documentazione per la libreria Biopython

• sug: bwa

  Burrows-Wheeler Aligner

• sug: clustalo

  programma generico di allineamento di sequenze multiple per proteine

• sug: clustalw

  allineamento globale per sequenze multiple di nucleotidi o peptidi

• sug: dialign

  allineamenti multipli di sequenze basati su segmenti

• sug: dssp

  assegnazione della struttura secondaria di una proteina in base alla struttura 3D

• sug: emboss

  suite software open source europea per la biologia molecolare

• sug: fasttree

  phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences

• sug: mafft

  programma per allineamenti multipli per sequenze aminoacidiche o nucleotidiche

• sug: muscle3

  programma per allineamenti multipli di sequenze proteiche

• sug: phylip

  pacchetto di programmi per inferire alberi filogenetici

• sug: phyml

  stime filogenetiche usando il metodo della massima verosimiglianza

• sug: prank

  kit per allineamenti probabilistici di sequenze di DNA, codoni e amminoacidi

• sug: probcons

  allineamenti multipli di sequenze probabilistici basati sulla coerenza

• sug: python3-matplotlib

  sistema di tracciamento grafici basato su Python in uno stile simile a Matlab (Python 3)

• sug: python3-mmtf

  codifica binaria di strutture biologiche (Python 3)

• sug: python3-mysqldb

  interfaccia Python per MySQL

• sug: python3-pil

  Python Imaging Library (Python3)

• sug: python3-psycopg2

  modulo Python 3 per PostgreSQL

• sug: python3-rdflib

  libreria Python 3 contenente un triplestore RDF e un analizzatore/serializzatore RDF

• sug: python3-scipy

  strumenti scientifici per Python 3

• sug: python3-tk

  Tkinter - scrittura di applicazioni Tk con Python 3.x

• sug: raxml

  RAxML (Randomized Axelerated Maximum Likelihood) di alberi filogenetici

• sug: samtools

  elaborazioni di allineamenti di sequenze nei formati SAM, BAM e CRAM

• sug: t-coffee

  allineamento di sequenze multiple

• sug: wise

  confronto tra biopolimeri, come DNA e sequenze proteiche

Download python3-biopython

Download for all available architectures

Architecture	Package Size	Installed Size	Files
ppc64 (unofficial port)	1,613.6 kB	12,655.0 kB	[list of files]