Package: edlib-aligner (1.2.7-5) [debports]

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strumento edlib per allineamento di sequenze usando la distanza di modifica

Edlib è una libreria C/C++ leggera e super-veloce per l'allineamento di sequenze usando la distanza di modifica. Questo pacchetto fornisce uno strumento per allineamento che usa tale libreria.

Funzionalità di libedlib:

 * Calcolo della distanza di modifica (distanza di Levehnstein).
 * Può trovare il percorso ottimale di allineamento (istruzioni su come
   trasformare la prima sequenza nella seconda sequenza).
 * Può trovare solo le posizioni iniziali o quelle finali, o entrambe, di
   un percorso di allineamento (può essere utile quando la velocità è più
   importante che avere un percorso di allineamento esatto).
 * Gestisce più metodi di allineamento: globale(NW), prefisso(SHW) e
   infisso(HW), ciascuno utile per differenti scenari.
 * Si può estendere la definizione dell'uguaglianza dei caratteri,
   abilitando ad esempio i metacaratteri, per ottenere un allineamento
   indifferente a maiuscole e minuscole o per lavorare con nucleotidi
   degenerati.
 * Può gestire sequenze piccole o molto grandi, anche per la ricerca del
   percorso di allineamento, consumando pochissima memoria.
 * Super-veloce grazie all'algoritmo di Myers per vettori di bit.

Other Packages Related to edlib-aligner

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libedlib1 (= 1.2.7-5)

  libreria per allineamento di sequenze usando la distanza di modifica

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

Download edlib-aligner

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
hppa (unofficial port)	22.6 kB	58.0 kB	[list of files]