Package: dnaclust (3-8 and others)

[ Source: dnaclust  ]

strumento per raggruppare in cluster milioni di corte sequenze di DNA

dnaclust è uno strumento per raggruppare in cluster un vasto numero di corte sequenze di DNA. I cluster vengono creati in un modo tale che il "raggio" di ogni cluster è più piccolo di una soglia specificata.

Le sequenze di input da raggruppare in cluster devono essere in formato Fasta. L'ID di ogni sequenza è basato sulla prima parola della sequenza nel formato Fasta. La prima parola è il prefisso dell'intestazione fino alla prima occorrenza di caratteri vuoti di spazio nell'intestazione.

Tags: Biology: Fasta/Pearson, Nucleic Acids, Field: field::biology, field::biology:bioinformatics, Implemented in: C++, Role: role::program, works-with::biological-sequence

Other Packages Related to dnaclust

• dep: libboost-program-options1.90.0 (>= 1.90.0)

  libreria per opzioni di programma per C++

• dep: libc6 (>= 2.34)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, ppc64el]

  libreria di supporto a GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [i386, s390x]

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

Download dnaclust

Download for all available architectures

Architecture	Version	Package Size	Installed Size	Files
amd64	3-8+b1	112.7 kB	685.0 kB	[list of files]
arm64	3-8+b2	102.6 kB	733.0 kB	[list of files]
armhf	3-8+b1	98.0 kB	666.0 kB	[list of files]
i386	3-8+b1	113.6 kB	674.0 kB	[list of files]
ppc64el	3-8+b1	111.7 kB	797.0 kB	[list of files]
riscv64	3-8+b1	107.8 kB	609.0 kB	[list of files]
s390x	3-8+b1	113.1 kB	685.0 kB	[list of files]