Package: probcons (1.12-12)

[ Source: probcons  ]

allineamenti multipli di sequenze probabilistici basati sulla coerenza

Strumento per generare allineamenti multipli di sequenze proteiche che usa una combinazione di modelli probabilistici e di tecniche di allineamento basate sulla coerenza. PROBCONS ha ottenuto dei livelli di accuratezza più alti di tutti i metodi di allineamento usati fino ad oggi. Nei test con il database degli allineamenti di riferimento BAliBASE, gli allineamenti prodotti con PROBCONS mostrano un significativo miglioramento rispetto ai programmi attuali poiché contengono in media il 7% in più di colonne correttamente allineate rispetto a T-Coffee, l'11% in più rispetto a CLUSTAL W ed il 14% in più rispetto a DIALIGN.

Tags: Field: Biology, Bioinformatics, Implemented in: implemented-in::c++, interface::commandline, Role: Program, Scope: Utility, Purpose: use::comparing, works-with-format::plaintext, Works with: Need an extra tag

Other Packages Related to probcons

• dep: libc6 (>= 2.27)

  Libreria C GNU: librerie condivise
  also a virtual package provided by libc6-udeb

• dep: libgcc1 (>= 1:3.0)

  libreria di supporto a GCC

• dep: libstdc++6 (>= 5.2)

  libreria GNU Standard C++, versione 3

• sug: probcons-extra

  programmi aggiuntivi per il pacchetto probcons

• enh: t-coffee

  allineamento di sequenze multiple

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
i386	101.5 kB	341.0 kB	[list of files]