Package: r-bioc-rtracklayer (1.58.0-1)

[ Source: r-bioc-rtracklayer  ]

interfaccia GNU R per navigatori di genomi e loro tracce di annotazione

Infrastruttura estensibile per interagire con più navigatori di genomi (attualmente incorporato UCSC) e manipolare tracce di annotazioni in vari formati (attualmente incorporati GFF, BED, bedGraph, BED15, WIG, BigWig e 2bit). L'utente può esportare e importare tracce verso e dai navigatori gestiti, così come interrogare e modificare lo stato del navigatore, come l'attuale porzione visualizzata.

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  Libreria C GNU: librerie condivise
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• dep: r-base-core (>= 4.2.2.20221110-1)

  nocciolo del sistema per calcoli e grafici statistici GNU R

• dep: r-bioc-biocgenerics (>= 0.35.3)

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• dep: r-bioc-biocio

  standard input and output for Bioconductor packages

• dep: r-bioc-biostrings (>= 2.47.6)

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  allineamento binario (BAM), variant call (BCF) o importazione di file tabix per GNU R

• dep: r-bioc-s4vectors (>= 0.23.18)

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• dep: r-cran-xml (>= 1.98-0)

  pacchetto GNU R per l'analisi e la generazione di XML

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)

  libreria di compressione - runtime

• sug: r-bioc-bsgenome (>= 1.33.4)

  infrastruttura BioConductor per pacchetti di dati genomici basati su Biostrings

• sug: r-bioc-genefilter

  metodi per filtrare geni da esperimenti con microarray

• sug: r-bioc-genomicfeatures

  strumenti per GNU R per fare annotazioni centrate su trascritti e manipolarle

• sug: r-bioc-limma

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• sug: r-bioc-org.hs.eg.db

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
amd64	4,984.3 kB	6,693.0 kB	[list of files]
arm64	4,973.1 kB	6,729.0 kB	[list of files]
armel	4,954.4 kB	6,596.0 kB	[list of files]
armhf	4,955.6 kB	6,532.0 kB	[list of files]
i386	5,004.7 kB	6,748.0 kB	[list of files]
mips64el	4,959.4 kB	6,776.0 kB	[list of files]
mipsel	4,963.7 kB	6,771.0 kB	[list of files]
ppc64el	5,006.5 kB	6,921.0 kB	[list of files]
s390x	4,975.1 kB	6,733.0 kB	[list of files]