Package: golang-github-gogetdata-ggd-utils-dev (1.0.0+ds-1)

[ Source: ggd-utils  ]

libreria per l'uso in ggd

Accetta un file di genoma e (attualmente) un .vcf.gz o un .bed.gz e verifica che:

    * sia presente un .tbi;
    * il VCF abbia ""##fileformat=VCF" come prima riga;
    * il VCF abbia un'intestazione #CHROM;
    * i cromosomi siano nell'ordine specificato dal file del genoma (e
      presenti);
    * le posizioni siano ordinate;
    * le posizioni siano <= delle lunghezze dei cromosomi definiti nel file
      del genoma.

Come risultato, ogni nuovo genoma passato a GGD ha un file .genome che detta l'ordine di ordinamento e la presenza o assenza del prefisso "chr" per i cromosomi.

Questo è il pacchetto della libreria per ggd-utils.

Download golang-github-gogetdata-ggd-utils-dev

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Architecture	Package Size	Installed Size	Files
all	5.6 kB	27.0 kB	[list of files]