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Package: aevol (5.0+ds-3 and others)

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modello digitale di genetica per condurre esperimenti di evoluzione in silico

Aevol è un modello digitale di genetica: popolazioni di organismi digitali sono sottoposti a un processo di selezione e variazione che crea una dinamica darwiniana.

Modificando le caratteristiche della selezione (es. dimensione della popolazione, tipo di ambiente, variazioni ambientali) o della variazione (es. tassi di mutazione, tassi di riarrangiamento cromosomico, tipi di riarrangiamento, trasferimento orizzontale), si può studiare sperimentalmente l'impatto di tali parametri sulla struttura degli organismi che si sono evoluti. In particolare Aevol, dal momento che integra un modello di genoma preciso e realistico, permette di studiare le variazioni strutturali del genoma (es. numero di geni, sintenia, proporzione di sequenze codificanti).

La piattaforma di simulazione è fornita con un insieme di strumenti per analizzare filogenie e misurare molte caratteristiche di organismi e popolazioni lungo l'evoluzione.

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