Paquet : mindthegap-examples (2.3.0-3)
Liens pour mindthegap-examples
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
- Journal des modifications Debian
- Fichier de licence
- Suivis des correctifs pour Debian
Télécharger le paquet source mindthegap :
Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
optional scripts and example resources for mindthegap
Designed to call insertions of any size, whether they are novel or duplicated, homozygous or heterozygous in the donor genome. it takes as input a set of reads and a reference genome. It outputs two sets of FASTA sequences: one is the set of breakpoints of detection insertion sites, the other is the set of assembled insertions for each breakpoint. MindTheGap can also be used as a genome assembly finishing tool. It can fill the gap between a set of input contigs without any a priori on their relative order and orientation. It outputs the results in gfa file. Please note that this package is meant to accommodate the mindthegap package and only acts as example to how this package can be utilised.
Autres paquets associés à mindthegap-examples
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- dep: bsdextrautils
- utilitaires supplémentaires de 4.4BSD-Lite
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- dep: python3
- langage orienté objet interactif de haut niveau – version par défaut de Python 3
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- rec: mindthegap
- détection et assemblage de variantes d’insertion d’ADN dans les ensembles de lectures NGS
Télécharger mindthegap-examples
Architecture | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
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all | 632,9 ko | 730,0 ko | [liste des fichiers] |