Paquets logiciels dans « sid », Sous-section science
- 3depict (0.0.23-2+b4 [riscv64], 0.0.23-2+b3 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 0.0.23-2 [alpha, armel, armhf, hppa, m68k, sh4, sparc64, x32])
- visualisation et analyse pour des données de point à valeurs uniques
- abacas (1.3.1-9)
- fermeture d'espaces dans des alignements génomiques depuis des lectures courtes
- abacas-examples (1.3.1-9)
- données d’exemple pour abacas pour combler les trous dans les alignements génomiques
- abinit (9.10.4-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 9.10.4-3 [sh4], 9.10.4-2 [alpha, hppa, ppc64], 8.10.3-3 [ia64, x32])
- paquet pour les calculs de structure électronique
- abpoa (1.5.1-1)
- adaptive banded Partial Order Alignment
- abyss (2.3.7-3+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64], 2.3.5+dfsg-2 [alpha, ia64, x32], 2.3.3-2 [m68k, sh4], 2.2.2-1 [sparc64], 2.1.0-1 [hppa])
- assembleur de séquences de novo parallèles pour les lectures courtes
- acedb-other (4.9.39+dfsg.02-9+b1 [riscv64], 4.9.39+dfsg.02-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Récupération d'ADN ou de séquences de protéines
- aces3 (3.0.8-9+b2 [riscv64], 3.0.8-9+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 3.0.8-9 [sh4])
- concepts avancés en structure électronique III
- aces3-data (3.0.8-9)
- concepts avancés en structure électronique III
- achilles (2-12+b2 [riscv64], 2-12+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- simulateur de vie artificielle et d'évolution
- adapterremoval (2.3.3-2+b1 [riscv64], 2.3.3-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes
- adapterremoval-examples (2.3.3-2)
- découpe d'adaptateur rapide, identification et fusion de lectures de séquences de gènes – données d'exemple
- adms (2.3.7-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.3.7-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- synthétiseur automatique de modèle de périphérique pour Verilog-AMS
- adun-core (0.81-14+b5 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.81-14+b4 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- simulateur moléculaire
- aegean (0.16.0+dfsg-4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 0.15.1+dfsg-1 [hppa], 0.14.1+dfsg2-2 [m68k], 0.14.1+dfsg-1 [alpha])
- boîte d’amalgame d’outils d'analyse de génome
- aevol (5.0+ds-3+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 5.0+ds-3+b1 [hppa, ia64, m68k, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
- modèle numérique de génétique pour lancer des expériences d'évolution in silico
- aghermann (1.1.2-5+b2 [riscv64], 1.1.2-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1.2-5 [hppa])
- gestionnaire d'expérimentation de recherche sur le sommeil
- aladin (12.060+dfsg-3)
- atlas interactif du ciel pour des images et ensembles de données astronomiques
- alfa (2.2-1+b3 [alpha], 2.2-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- algorithme d'ajustement de ligne automatisé
- algotutor (0.8.6-6)
- programme d'observation des étapes intermédiaires d'un algorithme
- alien-hunter (1.7-10)
- Distribution des motifs d'ordre variable (IVOM) pour identifier l'ADN acquis par transfert horizontal
- allelecount (4.3.0-2+b2 [riscv64], 4.3.0-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- algorithmes pour le compte de copies NGS
- altree (1.3.2-2+b3 [riscv64], 1.3.2-2+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- programme pour faire de l'association basée sur la phylogénétique et l'analyse de localisation
- altree-examples (1.3.2-2)
- fichiers d'exemple pour ALTree
- amap-align (2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2+b1 [riscv64], 2.2+git20080214.600fc29+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- alignement multiple de séquences protéiques par appariement
- ampliconnoise (1.29-11 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.29-10+b1 [sh4, x32])
- suppression du bruit pour les amplicons PCR séquencés 454
- andi (0.14-3)
- estimation efficace de distances d'évolution
- anfo (0.98-9)
- aligneur/mappeur de lectures courtes à partir de MPG
- ants (2.1.0-5+b1 [amd64, i386], 1.9.2+svn680.dfsg-4 [alpha, ppc64, x32], 1.9+svn532-5 [hppa])
- outils de normalisation élaborés pour l'analyse d'images du cerveau
- any2fasta (0.4.2-2)
- convert various sequence formats to FASTA
- any2fasta-examples (0.4.2-2)
- convert various sequence formats to FASTA (example data)
- aoflagger (3.4.0-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.4.0-2+b1 [alpha, ia64, m68k, ppc64, x32], 3.4.0-2 [hppa, sh4])
- découverte des RFI dans les observations radioastronomiques
- apbs (3.4.1-5.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 3.4.1-5.1 [m68k], 3.4.1-5+b4 [sh4])
- solveur adaptatif de Poisson Boltzmann
- apbs-data (3.4.1-5.1)
- fichiers de données pour APBS (solveur adaptatif de Poisson Boltzmann)
- apbs-doc (3.4.1-5.1)
- solveur adaptatif de Poisson Boltzmann
- apertium-af-nl (0.3.0-3)
- paquet factice de transition pour apertium-afr-nld
- apertium-afr-nld (0.3.0-3)
- données Apertium pour les traductions entre l'afrikaans et le néerlandais
- apertium-all-dev (3.8.1-3)
- Metapackage for all tools required for Apertium development
- apertium-anaphora (1.1.1-1+b1)
- module de résolution d'anaphores pour Apertium
- apertium-apy (0.11.7-2.1)
- service APY d'Apertium
- apertium-arg-cat (0.3.0-2)
- données Apertium pour les traductions entre l'aragonais et le catalan
- apertium-bel-rus (0.2.1-2)
- données d’Apertium pour les traductions entre le biélorusse et le russe
- apertium-br-fr (0.5.1-1)
- données linguistiques Apertium pour les traductions entre le breton et le français
- apertium-ca-it (1.1.0-1)
- paquet factice de transition pour apertium-cat-ita
- apertium-cat-ita (1.1.0-1)
- données Apertium pour les traductions entre le catalan et l'italien
- apertium-cat-srd (1.2.0-1)
- données d'Apertium pour les traductions entre le catalan et le sarde
- apertium-crh-tur (0.3.0-2)
- données Apertium pour les traductions entre le tatar de Crimée et le turc
- apertium-cy-en (0.1.1~r57554-9)
- données linguistiques Apertium pour les traductions entre le gallois et l'anglais
- apertium-dan-nor (1.5.0-2)
- données Apertium pour les traductions entre le danois et le norvégien
- apertium-dev (3.9.4-1)
- outils et bibliothèque de développement pour Apertium
- apertium-en-gl (0.5.4-2)
- données Apertium pour les traductions entre l'anglais et le galicien
- apertium-eng-cat (1.0.1-5)
- données Apertium pour les traductions entre l'anglais et le catalan
- apertium-eng-spa (0.8.1-2)
- données Apertium pour les traductions entre l'anglais et l'espagnol
- apertium-eo-en (1.0.2-1)
- données Apertium pour les traductions entre l'espéranto et l'anglais
- apertium-eo-fr (0.9.1-1)
- données Apertium pour les traductions entre l'espéranto et le français
- apertium-es-ast (1.1.1-2)
- paquet factice de transition pour apertium-spa-ast
- apertium-es-it (0.2.1-3)
- paquet factice de transition pour apertium-spa-ita
- apertium-eu-en (0.3.3-1)
- données Apertium pour les traductions entre le basque et l'anglais
- apertium-eval-translator (1.2.1-3)
- évaluation de sortie de traduction automatique par rapport à une référence
- apertium-fra-cat (1.10.0-1)
- données Apertium pour les traductions entre le français et le catalan
- apertium-fra-frp (1.1.0-1)
- données d’Apertium pour les traductions entre le français et l'arpitan
- apertium-get (1.0.0-3)
- assistant pour les langues et les pairs d'Apertium et Giellateckno
- apertium-hbs-eng (0.5.1-2)
- données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et l'anglais
- apertium-hbs-mkd (0.1.1-1)
- données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et le macédonien
- apertium-hbs-slv (0.5.1-2)
- données Apertium pour les traductions entre le serbo-croate et le slovénien
- apertium-hin (0.1.0~r59158-4)
- données simples Apertium pour le hindi
- apertium-id-ms (0.1.2-3)
- paquet factice de transition pour apertium-ind-zlm
- apertium-ind-zlm (0.1.2-3)
- données Apertium pour les traductions entre l'indonésien et le malais
- apertium-is-sv (0.1.1-2)
- Transitional dummy package for apertium-isl-swe
- apertium-isl-eng (0.1.2-1)
- données Apertium pour les traductions entre l'islandais et l'anglais
- apertium-isl-swe (0.1.1-2)
- données Apertium pour les traductions entre l'islandais et le suédois
- apertium-kaz-tat (0.2.1-1)
- données Apertium pour les traductions entre le kazakh et le tatar
- apertium-lex-tools (0.4.2-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.4.2-2+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Constraint-based lexical selection module
- apertium-lex-tools-dev (0.4.2-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.4.2-2+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Development library for Apertium lexical selection module
- apertium-mk-bg (0.2.1-2)
- Transitional dummy package for apertium-mkd-bul
- apertium-mk-en (0.1.3-2)
- Transitional dummy package for apertium-mkd-eng
- apertium-mkd-bul (0.2.1-2)
- données Apertium pour les traductions entre le macédonien et le bulgare
- apertium-mkd-eng (0.1.3-2)
- données Apertium pour les traductions entre le macédonien et l'anglais
- apertium-mlt-ara (0.2.0~r62623-3)
- données Apertium pour les traductions entre le maltais et l'arabe
- apertium-nno-nob (1.5.0-1)
- données linguistiques Apertium pour les traductions entre le norvégien Nynorsk et le norvégien Bokmål
- apertium-oci-fra (1.0.0-1)
- données de traduction d’Apertium pour la paire occitan-français
- apertium-pol-szl (0.2.1-3)
- données d’Apertium pour les traductions entre le polonais et le silésien
- apertium-por-cat (0.10.1-2)
- données Apertium pour les traductions entre le portugais et le catalan
- apertium-recursive (1.1.2-1+b1)
- module de transfert structural récursif pour Apertium
- apertium-regtest (0.9.1-3)
- Regression test suite for Apertium languages and pairs
- apertium-rus-ukr (0.2.1-4)
- données d’Apertium pour les traductions entre le russe et l'ukrainien
- apertium-separable (0.6.1-1+b1)
- réordonnancement de multimots séparables ou non contigus
- apertium-sme-nob (0.6.1+ds.1-2)
- données Apertium pour les traductions entre le sámi et le bokmål
- apertium-spa-arg (0.6.0-2)
- données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'aragonais
- apertium-spa-ast (1.1.1-2)
- données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'asturien
- apertium-spa-ast
- paquet virtuel fourni par apertium-spa-ast
- apertium-spa-cat (2.2.0-3)
- données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et le catalan
- apertium-spa-ita (0.2.1-3)
- données Apertium pour les traductions entre l'espagnol et l'italien
- apertium-srd-ita (1.3.0-1)
- données Apertium pour les traductions entre le sarde et l'italien
- apertium-swe-dan (0.8.1-3)
- données linguistiques Apertium pour les traductions entre le suédois et le danois
- apertium-swe-nor (0.4.0-1)
- données Apertium pour les traductions entre le suédois et le norvégien
- apertium-urd (0.1.0~r61311-3)
- données simples Apertium pour l’ourdou
- apertium-urd-hin (0.1.0~r64379-4)
- données Apertium pour les traductions entre l'ourdou et le hindi
- aragorn (1.2.41-3)
- détection ARNt et ARNtm dans les séquences de nucléotides
- arb (6.0.6-7+b2 [riscv64], 6.0.6-7+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, s390x]) [non-free]
- phylogenetic sequence analysis suite - main program
- arb-common (6.0.6-7) [non-free]
- phylogenetic sequence analysis suite - common files
- arden (1.0-5)
- contrôle de spécificité pour les alignements de lecture utilisant une référence artificielle
- ariba (2.14.7+ds-2 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64], 2.14.6+ds-2+b1 [m68k])
- identification de résistance antibiotique par assemblage
- art-nextgen-simulation-tools (20160605+dfsg-5+b1 [riscv64], 20160605+dfsg-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outils de simulation pour créer des lectures de séquençage synthétiques de nouvelle génération
- art-nextgen-simulation-tools-profiles (20160605+dfsg-5)
- profils pour les outils de simulation ART
- artemis (18.2.0+dfsg-3)
- navigateur de génome et outil d'annotation
- artfastqgenerator (0.0.20150519-5)
- création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence
- artfastqgenerator-examples (0.0.20150519-5)
- création de fichiers FASTQ artificiels dérivés d'un génome de référence –⋅exemples
- asdftool (3.2.0-1)
- outil en ligne de commande pour manipuler les fichiers de données scientifiques ASDF
- ase (3.22.1-4)
- environnement de simulation atomique
- assembly-stats (1.0.1+ds-6+b1 [riscv64], 1.0.1+ds-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64])
- obtention des statistiques d'assemblage à partir de fichiers FASTA et FASTQ
- assemblytics (1.2.1+dfsg-2)
- détection et analyse de variantes structurelles à partir d’un assemblage de génome
- astap (2024.01.16-1)
- solveur astrométrique, empilement d'images, photométrie et visionneur FITS
- astap-cli (2024.01.17-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el], 2022.12.09-1 [m68k])
- solveur astrométrique, version en ligne de commande
- astro-tasks (4.1)
- mélange exclusif Debian Astronomy (tâches de tasksel)
- astromatic (1.3)
- collection logicielle d'infrastructure astronomique
- astrometry-data-2mass (1.1) [contrib]
- Astrometry.net 2MASS index files downloader
- astrometry-data-2mass-00 (1.1) [contrib]
- Astrometry.net 2MASS index files downloader (2'-2.8')
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- Astrometry.net 2MASS index files downloader (4'-5.6')
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- Astrometry.net 2MASS index files downloader (5.6'-8')
- astrometry-data-2mass-04 (1.1) [contrib]
- Astrometry.net 2MASS index files downloader (8'-11')
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- Astrometry.net 2MASS index files downloader (11'-16')
- astrometry-data-2mass-06 (1.1) [contrib]
- Astrometry.net 2MASS index files downloader (16'-22')
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- Astrometry.net 2MASS index files downloader (22'-30')
- astrometry-data-2mass-08-19 (1.1) [contrib]
- Astrometry.net 2MASS index files downloader (30'-2000')
- astrometry-data-tycho2 (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net
- astrometry-data-tycho2-07 (2-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2-4 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-07-bigendian (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-07-littleendian (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 22 à 30 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-08 (2-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2-4 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-08-bigendian (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-08-littleendian (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 30 à 44 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-09 (2-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2-4 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-09-bigendian (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-09-littleendian (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 44 à 60 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-10-19 (2-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2-4 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- fichiers d'index Tycho-2 d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-10-19-bigendian (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 gros-boutistes d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
- astrometry-data-tycho2-10-19-littleendian (2-4)
- fichiers d'index Tycho-2 petits-boutistes d'Astrometry.net − de 60 à 2000 arcminutes
- astrometry.net (0.93+dfsg-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.93+dfsg-1.1 [sh4])
- solveur de plaque photographique astrométrique
- astronomical-almanac (5.6-7+b1 [riscv64], 5.6-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- almanach astronomique - calcul de positions d'étoiles et de planètes
- astropy-utils (6.0.1-3)
- outils en ligne de commande d'astropy
- atac (0~20150903+r2013-8+b3)
- comparaison de génomes d'assemblage en assemblage
- ataqv (1.3.1+ds-2+b3 [alpha], 1.3.1+ds-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4, x32], 1.3.0+ds-1 [hppa])
- contrôle de qualité et visualisation pour ATAC-seq
- atomes (1.1.14-1.1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.1.14-1 [alpha, x32], 1.1.12+repack-1 [ia64])
- atomic-scale 3D modeling toolbox
- atomes-data (1.1.14-1.1)
- atomic-scale 3D modeling toolbox (data)
- atropos (1.1.32+dfsg-1+b1 [riscv64], 1.1.32+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, sh4, x32])
- Outil de taille de lecture NGS spécifique, sensible et rapide
- augur (24.2.3-1)
- composants pipeline pour l'analyse de virus en temps réel
- augustus (3.5.0+dfsg-4+b5 [riscv64], 3.5.0+dfsg-4+b4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 3.5.0+dfsg-4+b3 [m68k, sh4], 3.5.0+dfsg-4+b2 [x32], 3.4.0+dfsg2-3+b2 [hppa, ppc64, sparc64], 3.4.0+dfsg2-3 [ia64])
- prédiction de gènes dans les génomes eucaryotes
- augustus-data (3.5.0+dfsg-4)
- fichiers de données pour AUGUSTUS
- autodock (4.2.6-9+b1 [riscv64], 4.2.6-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Analyse de liaison de ligand à la structure d'une protéine
- autodock-getdata (4.2.6-9)
- instructions pour collecter des données pour getData
- autodock-test (4.2.6-9)
- fichiers de test pour AutoDock
- autodock-vina (1.2.5-2+b1 [alpha], 1.2.5-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- chargement de petites molécules jusqu'aux protéines
- autogrid (4.2.6-9+b1 [riscv64], 4.2.6-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Pré-calculer les liaisons de ligands à leur récepteur
- autogrid-test (4.2.6-9)
- fichiers de test pour AutoGrid
- avce00 (2.0.0-9+b1 [riscv64], 2.0.0-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- conversion de couverture vectorielle Arcinfo d’ESRI (binaire) au format E00
- avogadro (1.99.0-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.99.0-1 [sh4], 1.97.0-1 [m68k, x32])
- système de modélisation et d'imagerie moléculaire
- avogadro-utils (1.99.0-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.99.0-5 [alpha, hppa], 1.99.0-3 [sh4], 1.97.0-3+b1 [m68k], 1.97.0-3 [x32])
- système de modélisation et d'imagerie moléculaire –⋅bibliothèque
- axe-demultiplexer (0.3.3+dfsg-4)
- démultiplexeur de lecture de séquence ADN basé sur les arbres préfixes
- bagel (1.2.2-7)
- paquet de chimie computationnelle
- baitfisher (1.2.7+git20211020.de26d5c+dfsg-1+b2 [riscv64], 1.2.7+git20211020.de26d5c+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- paquet logiciel de conception de sondes d'enrichissement hybrides
- bali-phy (3.6.1+dfsg-2+b3 [riscv64], 3.6.1+dfsg-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 3.6.1+dfsg-2 [m68k], 3.6.1+dfsg-1 [hppa, ia64], 3.5.0.1+dfsg-1 [x32])
- inférence bayésienne d’alignement et de phylogénie
- ballview (1.5.0+git20180813.37fc53c-11+b4 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.5.0+git20180813.37fc53c-11+b3 [sparc64], 1.5.0+git20180813.37fc53c-11+b2 [ia64, ppc64], 1.5.0+git20180813.37fc53c-11+b1 [alpha, hppa, sh4], 1.5.0+git20180813.37fc53c-11 [m68k], 1.5.0+git20180813.37fc53c-10+b2 [x32])
- modélisation moléculaire (libre) et outil graphique moléculaire
- bamclipper (1.0.0-3)
- Remove gene-specific primer sequences from SAM/BAM alignments
- bamkit (0.0.1+git20170413.ccd079d-3)
- tools for common BAM file manipulations
- bamtools (2.5.2+dfsg-5)
- boîte à outils de manipulation de fichiers BAM (alignement de génomes)
- bandage (0.9.0-2+b3 [riscv64], 0.9.0-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- application de bio-informatique pour navigation simple dans les graphes d’assemblage De novo
- bandage-examples (0.9.0-2)
- Bioinformatics Application for Navigating De novo Assembly Graphs Easily (data)
- barrnap (0.9+dfsg-4)
- prédiction ribosomale rapide d'ARN
- bart (0.9.00-2+b1)
- outils pour l'imagerie par résonance magnétique computationnelle
- bart
- paquet virtuel fourni par bart-cuda
- bart-cuda (0.8.00-2+b1) [contrib]
- tools for computational magnetic resonance imaging
- bart-view (0.3.00-1+b1)
- visualisateur de données multidimensionnelles et de valeur complexe
- bbmap (39.06+dfsg-1)
- BBTools genomic aligner and other tools for short sequences
- bbmap-jni (39.06+dfsg-1+b2 [riscv64], 39.06+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- short read aligner and other bioinformatic tools - JNI library
- bcalm (2.2.3-5+b1 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 2.2.3-3 [hppa])
- de Bruijn compaction in low memory
- bcbio (1.2.9-2) [contrib]
- toolkit for analysing high-throughput sequencing data
- bcftools (1.19-1+b3 [riscv64], 1.19-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, sh4, x32])
- appel de variantes génomiques et manipulation de fichiers VCF et BCF
- beads (1.1.22-1+b3 [armel, armhf, riscv64], 1.1.22-1+b2 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.1.22-1+b1 [alpha, hppa], 1.1.20-3 [m68k], 1.1.20-2 [x32])
- détection par électrophorèse bidimensionnelle de tache d’images de gel
- beagle (220722-1)
- appel de génotype, phasage de génotype et attribution de marqueurs non génotypés
- beast-mcmc (1.10.4+dfsg-5)
- inférence phylogénétique bayésienne MCMC
- beast2-mcmc (2.7.6+dfsg-1)
- inférence phylogénétique bayésienne MCMC
- bedops (2.4.41+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.4.26+dfsg-1 [sh4])
- opérations génomiques à haute performance
- bedtools (2.31.1+dfsg-2+b2 [riscv64], 2.31.1+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2.26.0+dfsg-5 [sparc64])
- suite d'utilitaires pour la comparaison des caractéristiques de génomes
- bedtools-test (2.31.1+dfsg-2)
- données de test pour le paquet bedtools
- belvu (4.44.1+dfsg-7.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 4.44.1+dfsg-7.1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- visualisateur d’alignements de séquences multiples et outil phylogénétique
- berkeley-express (1.5.3+dfsg-3+b4 [hppa], 1.5.3+dfsg-3+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.5.3+dfsg-3+b2 [riscv64])
- quantification de streaming pour le séquençage à taux élevé
- bio-eagle (2.4.1-3+b3)
- phasage d'haplotype au sein d'une cohorte génotypée ou grâce à un panel phasé de référence
- bio-eagle-examples (2.4.1-3)
- exemples pour bio-eagle
- bio-rainbow (2.0.4+dfsg-2+b2 [riscv64], 2.0.4+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- partitionnement et assemblage de séquences courtes pour la bio-informatique
- bio-vcf (0.9.5-3)
- domain specific language (DSL) for processing the VCF format
- bioawk (1.0-5)
- extension d’awk pour l’analyse de séquences biologiques
- biobambam2 (2.0.185+ds-1+b2 [riscv64], 2.0.185+ds-1 [alpha, amd64, arm64, i386, ia64, mips64el, ppc64el, x32])
- tools for early stage alignment file processing
- biogenesis (0.8-3.1)
- programme de vie artificielle pour simuler l’évolution d’organismes
- bioperl (1.7.8-1)
- outils en Perl pour la bio-informatique
- bioperl-run (1.7.3-10)
- scripts d'enveloppe BioPerl
- biosig-tools (2.6.0-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.6.0-1+b1 [ppc64, sparc64], 2.6.0-1 [alpha, sh4], 2.5.0-1+b2 [hppa], 2.5.0-1+b1 [m68k], 2.4.0-2 [x32])
- outils de conversion entre différents formats de données médicales
- biosquid (1.9g+cvs20050121-15.1)
- utilitaire d'analyse de séquences biologiques
- biosyntax (1.0.0b-6)
- coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – métapaquet
- biosyntax-common (1.0.0b-6)
- coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – fichiers communs
- biosyntax-example (1.0.0b-6)
- coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – exemple
- biosyntax-gedit (1.0.0b-6)
- coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon gedit
- biosyntax-less (1.0.0b-6)
- coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon less
- biosyntax-vim (1.0.0b-6)
- coloration syntaxique pour la biologie computationnelle – greffon vim
- bitseq (0.7.5+dfsg-6+b2 [riscv64], 0.7.5+dfsg-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- inférence bayésienne de transcripts à partir de données de séquençage
- bitwise (0.50-1+b1)
- opérations bit à bit interactives en ncurses
- bkchem (0.14.0~pre4+git20211228-3)
- éditeur de structures chimiques
- blasr (5.3.5+dfsg-6+b4 [alpha, ia64], 5.3.5+dfsg-6+b3 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el], 5.3.5+dfsg-6+b1 [riscv64], 5.3.3+dfsg-1+b1 [m68k, sh4], 5.3-1+b1 [x32], 0~20150724+git3ca7fe8-1+b2 [hppa, ppc64])
- correspondance de lectures de séquençage de molécules simples
- blimps-utils (3.9+ds-2) [non-free]
- blocks database improved searcher
- blixem (4.44.1+dfsg-7.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 4.44.1+dfsg-7.1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- navigateur interactif d’alignements de séquences
- bluebrain-hpc-coding-conventions (1.0.0+git20221201-2)
- BlueBrain HPC Team C++ Development Guidelines
- bmt (0.6-1.1)
- boîte à outils de mesure de performances d'analyse logicielle
- bodr (10-3)
- dépôt de données Blue Obelisk
- boinc-app-eah-brp (0.20170426+dfsg-10+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 0.20170426+dfsg-10 [hppa], 0.20170426+dfsg-2+b2 [sh4])
- extension BOINC pour la recherche de pulsars binaires Einstein@Home
- bolt-lmm (2.4.1+dfsg-2)
- test efficace d’association de modèles mixtes bayésiens sur tout le génome de grandes cohortes
- bolt-lmm-example (2.4.1+dfsg-2)
- exemples pour bolt-lmm
- boolector (1.5.118.6b56be4.121013-1.3+b2 [riscv64], 1.5.118.6b56be4.121013-1.3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- solveur SMT pour les vecteurs de bits et les tableaux
- bornagain (21.1+ds3-4 [amd64, mips64el, sparc64], 1.19.0-4 [hppa, ppc64, riscv64], 1.19.0-3+b5 [alpha, m68k])
- simulation et adaptation GISAS de rayons X et de neutrons – binaire
- bowtie (1.3.1-3 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.0.1-2 [x32], 1.0.0-6 [hppa, sh4])
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
- bowtie-examples (1.3.1-3)
- exemples pour bowtie, l'aligneur de lectures courtes ultra rapide et efficace en mémoire
- bowtie2 (2.5.3-1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64], 2.5.1-1 [ia64], 2.4.5-1 [ppc64, sparc64], 2.4.2-2+b1 [m68k, sh4], 2.3.5.1-6 [alpha])
- aligneur ultra-rapide de lectures courtes avec une faible empreinte mémoire
- bowtie2-examples (2.5.3-1)
- exemples pour bowtie2
- boxshade (3.3.1-14+b2 [riscv64], 3.3.1-14 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Rendu élégant d'alignements multiples de séquences
- bppphyview (0.6.1-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.6.1-4 [m68k])
- afficheur phylogénétique pour Bio++
- bppsuite (2.4.1-7)
- suite de programmes Bio++
- bppsuite-examples (2.4.1-7)
- exemples pour la suite de programmes Bio++
- brain2mesh-demos (0.7.9-3)
- sample files and demo scripts for Brain2Mesh
- brig (0.95+dfsg-3+b2 [riscv64], 0.95+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- générateur d'images circulaires BLAST
- btllib-tools (1.4.10+dfsg-1+b2 [riscv64], 1.4.10+dfsg-1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el])
- Bioinformatics Technology Lab common code library tools
- busco (5.5.0-2)
- benchmarking sets of universal single-copy orthologs
- bustools (0.43.2+dfsg-1)
- manipulation de fichiers BUS pour des ensembles de données de séquençage d’ADN de cellule unique
- bwa (0.7.17-7+b5 [alpha], 0.7.17-7+b4 [ia64], 0.7.17-7+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- dispositif d'alignement Burrows-Wheeler
- c-munipack (2.1.36-2+b2 [riscv64], 2.1.36-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- reduction of images carried out by CCD camera
- c-munipack-share (2.1.36-2)
- reduction of images carried out by CCD camera (share)
- c2x (2.41.b+ds-2)
- conversion entre formats de code de structure électronique DFT
- cafeobj (1.6.0-2)
- langage de spécification et programmation algébrique de nouvelle génération
- cafeobj-mode (1.6.0-2)
- mode majeur Emacs pour modifier du code source CafeOBJ
- calculix-ccx (2.21-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.20-1 [sh4])
- programme d'éléments finis structurels en trois dimensions
- calculix-cgx (2.21+dfsg-1+b1)
- pré et postprocesseur tridimensionnel pour les modèles à éléments finis
- callisto (1.1.0-2+b4 [alpha], 1.1.0-2+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- démon pour le matériel e-Callisto
- camitk-actionstatemachine (5.2.0-1+b1 [amd64], 3.4.0-2+b1 [sparc64], 3.4.0-2 [hppa, x32], 3.4.0-1 [alpha], 3.2.2-2 [ppc64])
- application pour rejouer les flux d'actions pour la bibliothèque CamiTK
- camitk-config (5.2.0-1+b1)
- boîte à outils d'intervention médicale assistée par ordinateur – configuration
- camitk-imp (5.2.0-1+b1 [amd64], 3.4.0-2+b1 [sparc64], 3.4.0-2 [hppa, x32], 3.4.0-1 [alpha], 3.2.2-2 [ppc64])
- banc de test pour la bibliothèque CamiTK
- canu (2.2+dfsg-5+b1 [riscv64], 2.2+dfsg-5 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 2.0+dfsg-2 [alpha, m68k, sh4])
- assembleur de séquences de molécules simples pour les génomes
- casacore-data-igrf (12-1)
- données de champ de référence géomagnétique international pour casacore
- casacore-data-jpl-de200 (2007.07.05+ds.1-1)
- éphéméride de développement DE200 du Jet Propulsion Laboratory pour casacore
- casacore-data-jpl-de405 (2007.07.05+ds.1-1)
- éphéméride de développement DE405 du Jet Propulsion Laboratory pour casacore
- casacore-data-lines (0+git2016.11.26-2.1)
- table de fréquences de ligne spectrale pour casacore
- casacore-data-observatories (0+git2018.12.08-2)
- table des coordonnées d'observatoires radio
- casacore-data-sources (2-4)
- table de coordonnées de sources de référence ICRF2 pour casacore
- casacore-data-tai-utc (1.3)
- table de différente entre TAI et UTC pour casacore
- casacore-tools (3.5.0-4.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 3.5.0-4.1 [m68k, sh4], 3.5.0-4 [hppa])
- outils construits avec CASA
- cassbeam (1.1-4+b2 [riscv64], 1.1-4+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.1-4 [sh4])
- modélisation des antennes Cassegrain
- cassiopee (1.0.9-4+b1)
- outil d'indexation et de recherche dans les séquences génomiques
- cat-bat (5.3-2)
- taxonomic classification of contigs and metagenome-assembled genomes (MAGs)
- catfishq (1.4.0+ds-1)
- concatenates fastq files
- cba (0.3.6-6+b5 [mips64el], 0.3.6-6+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 0.3.6-6+b3 [riscv64], 0.3.6-6+b2 [alpha, hppa, sh4], 0.3.6-6 [ia64, m68k, x32])
- analyse de poutres continues
- cbflib-bin (0.9.7+dfsg1-3.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.9.7+dfsg1-3.1 [m68k], 0.9.7+dfsg1-3 [sh4])
- utilitaires de manipulation de fichiers CBF
- cbmc (5.95.1-4)
- vérificateur de modèle borné pour les programmes C et C++
- cclib (1.8-1)
- analyseurs et algorithmes pour la chimie computationnelle
- cclib-data (1.6.2-2) [non-free]
- Parsers and algorithms for computational chemistry (data files)
- cct (1:1.0.3-1)
- comparaison visuelle de séquences bactériennes, de plasmides, de chloroplastes ou mitochondriales
- cct-examples (1:1.0.3-1)
- données d’exemple pour tester le paquet cct
- cd-hit (4.8.1-4+b1 [riscv64], 4.8.1-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- suite de programmes conçus pour grouper rapidement des séquences
- cdbfasta (1.00+git20230710.da8f5ba+dfsg-1+b1 [riscv64], 1.00+git20230710.da8f5ba+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- indexation avec Constant DataBase et outils de recherche pour les fichiers multi-FASTA
- centrifuge (1.0.3-12 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64], 1.0.3-11 [hppa])
- système rapide et économe en mémoire de classification de séquences ADN
- cg3 (1.4.6-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.4.6-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- outils pour utiliser la troisième édition de Constraint Grammar (CG-3)
- cg3-dev (1.4.6-1)
- Metapackage providing both CG-3 CLI dev tools and dev library
- cgns-convert (3.4.0-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 3.4.0-3 [sh4])
- système de notation générale CFD — outils de conversion
- cgview (0.0.20100111-7)
- visionneuse de génome circulaire
- ch5m3d (1.2.5+dfsg-3)
- création et visualisation de dessins en 3D de molécules simples
- changeo (1.3.0-1)
- boîte à outils d’affectation clonale de répertoire – Python 3
- checkit-tiff (1.4.4-1+b1 [riscv64], 1.4.4-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- vérificateur de conformité pour les images au format TIFF élémentaire
- chemical-structures (2.2.dfsg.0-20)
- service web fournissant des structures moléculaires dans des formats ouverts
- chemical-structures-data (2.2.dfsg.0-20)
- jeu de structures moléculaires dans des formats ouverts
- chemonomatopist (0.6.1-1)
- derive IUPAC systematic names for chemical structures
- chemps2 (1.8.12-3.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.8.12-3 [sh4])
- Executable to call libchemps2-3t64 from the command line
- chemtool (1.6.14-6+b2 [riscv64], 1.6.14-6+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- programme de dessin de structures chimiques
- chimeraslayer (20101212+dfsg1-6)
- détecte les simili-chimères dans les ADN amplifiés via réaction en chaîne par polymérase
- chip-seq (1.5.5-3+b1 [riscv64], 1.5.5-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outils pour des tâches d’analyse des données ordinaires de ChIP-Seq
- chip-seq-data (1.5.5-3)
- tools performing common ChIP-Seq data analysis tasks (data)
- chromhmm (1.25+dfsg-1)
- découverte et caractérisation d’état de chromatine
- chromimpute (1.0.3+dfsg-5)
- attribution d’épigénome systématique à grande échelle
- cif-linguist (0.4.2-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.4.2-5 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sparc64, x32], 0.4.2-2 [sh4])
- transform CIF data among CIF formats and dialects
- cif-tools (1.0.7-1+b1 [riscv64, sparc64], 1.0.7-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32])
- Suite of tools to manipulate, validate and query mmCIF files
- cif2hkl (1.4.3+ds1-1+b1 [riscv64], 1.4.3+ds1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.4.2+ds1-1 [ia64])
- Convert crystallographic descriptions into HKL F^2 reflection lists
- circlator (1.5.6-11)
- circularisation d'assemblages de génomes
- circos (0.69.9+dfsg-2)
- outil de dessin pour visualiser des données
- circos-tools (0.23-1)
- Traceur pour visualisation de données — utilitaires auxiliaires
- ckon (0.7.1-5+b5 [alpha], 0.7.1-5+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, sparc64, x32], 0.7.1-5+b3 [riscv64, s390x], 0.7.1-5+b2 [sh4])
- outil de compilation automatique pour le logiciel d'analyse de données ROOT
- clearcut (1.0.9+git20211013.b799afe-1+b1 [riscv64], 1.0.9+git20211013.b799afe-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- reconstruction d'arbre phylogénétique extrêmement efficace
- clonalframe (1.2-11+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.2-11+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- inférence de microévolution bactérienne en utilisant des données de séquence multilocus
- clonalframeml (1.13-1)
- inférence efficace de recombinaison de génomes de bactéries entières
- clonalorigin (1.0-8)
- inférence de recombinaison homologue dans les bactéries grâce à des séquences de génomes entiers
- clustalo (1.2.4-8)
- General-purpose multiple sequence alignment program for proteins
- clustalw (2.1+lgpl-7+b1 [riscv64], 2.1+lgpl-7 [alpha, amd64, arm64, hppa, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- alignement de séquences de nucléotides ou de peptides
- clustalx (2.1+lgpl-9+b2 [riscv64], 2.1+lgpl-9+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 2.1+lgpl-9 [alpha, m68k, x32])
- alignement multiple de séquences d'acides nucléiques et de protéines - interface graphique
- cluster3 (1.59+ds-5) [non-free]
- Reimplementation of the Eisen-clustering software
- cmor-tables (3.3-1.1)
- tables MIP pour la bibliothèque de réécriture de sortie de modèle de climat
- cmtk (3.3.1p2+dfsg-2+b2)
- boîte à outils de morphométrie computationnelle
- cnvkit (0.9.10-2)
- Copy number variant detection from targeted DNA sequencing
- cod-tools (3.9.0+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 3.8.1+dfsg-1+b1 [hppa], 3.7.0+dfsg-1 [sparc64], 3.4.0+dfsg-1 [ia64], 3.1.0+dfsg-3 [alpha])
- tools for manipulating CIF format files
- code-saturne (6.0.2-2+b1 [m68k, riscv64, sh4], 6.0.2-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 5.2.1+repack-1 [ia64])
- logiciel généraliste de dynamique des fluides informatique (CFD)
- code-saturne-bin (6.0.2-2+b1 [m68k, riscv64, sh4], 6.0.2-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 5.2.1+repack-1 [ia64])
- logiciel généraliste de dynamique des fluides informatique (CFD) – exécutables
- code-saturne-data (6.0.2-2)
- logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – données
- code-saturne-doc (6.0.2-2)
- logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – documentation
- code-saturne-include (6.0.2-2+b1 [m68k, riscv64, sh4], 6.0.2-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 5.2.1+repack-1 [ia64])
- logiciel généraliste de dynamique des fluides computationnelle (CFD) – fichiers d'inclusion
- codonw (1.4.4-8)
- analyse de correspondance d'utilisation de codon
- coinor-cbc (2.10.11+ds1-2)
- solveur de programmes en variables mixtes par branch-and-cut COIN-OR
- coinor-clp (1.17.9+ds-1)
- solveur de programmation linéaire COIN-OR
- coinor-csdp (6.2.0-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 6.2.0-5 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Software package for semidefinite programming (binaries)
- coinor-libbonmin4 (1.8.9-1+b1)
- COIN-OR mixed integer programming
- coinor-libbonmin4t64 (1.8.9-1.1)
- COIN-OR mixed integer programming
- coinor-libcbc3.1 (2.10.11+ds1-2)
- solveur de programmes en variables mixtes par branch-and-cut COIN-OR – bibliothèques partagées
- coinor-libcgl1 (0.60.8+ds-1)
- bibliothèque de génération de coupes COIN-OR
- coinor-libclp1 (1.17.9+ds-1)
- solveur de programmation linéaire COIN-OR – bibliothèques partagées
- coinor-libcoinutils3v5 (2.11.4+repack1-4)
- COIN-OR collection of utility classes (shared libraries)
- coinor-libosi1v5 (0.108.10+ds-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 0.108.9+ds-1 [x32])
- interface de solveur ouverte COIN-OR
- coinor-libsymphony3 (5.6.17+dfsg-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 5.6.17+dfsg-1 [sh4])
- solveur COIN-OR pour les programmes linéaires en nombres mixtes – bibliothèques partagées
- coinor-libvol1 (1.5.4-4+b1 [riscv64], 1.5.4-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Coin-or linear programming solver (libraries)
- coinor-symphony (5.6.17+dfsg-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 5.6.17+dfsg-1 [sh4])
- solveur COIN-OR pour les programmes linéaires en nombres mixtes
- colmap (3.9.1-2+b1)
- Structure-from-Motion et Multi-View Stereo
- comet-ms (2019015+cleaned1-4.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 2019015+cleaned1-4 [x32])
- moteur de recherche de spectrométrie de masse en tandem (MS/MS)
- concavity (0.1+dfsg.1-5+b1 [riscv64], 0.1+dfsg.1-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- prédicteur de sites de liaisons de ligands de la protéine à partir de la structure et de la conservation
- conda-package-handling (2.2.0-2)
- création et extraction de paquets conda de différents formats
- condor (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- distributed workload management system
- condor-annex-ec2 (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- distributed workload management system - single node configuration
- condor-kbdd (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- distributed workload management system - single node configuration
- condor-test (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- distributed workload management system - single node configuration
- condor-upgrade-checks (23.4.0+dfsg-1)
- distributed workload management system - single node configuration
- condor-vm-gahp (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- distributed workload management system - single node configuration
- connectome-workbench (1.5.0-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.5.0-2+b1 [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32], 1.5.0-2 [alpha, hppa])
- outil de visualisation du cerveau, d'analyse et de découverte
- conservation-code (20110309.0-8)
- outil de notation de la conservation des séquences de protéines
- covtobed (1.3.5+dfsg-2+b1 [riscv64], 1.3.5+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- conversion de « track » de couverture d’un fichier BAM dans un fichier BED
- covtobed-examples (1.3.5+dfsg-2)
- données d’exemple et scripts pour mindthegap
- cp2k (2023.2-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2023.1-2 [ia64, riscv64, sparc64], 5.1-3 [hppa])
- Ab Initio Molecular Dynamics
- cp2k-data (2023.2-2)
- Ab Initio Molecular Dynamics (data files)
- cpl-plugin-amber (4.4.3+dfsg-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 4.4.3+dfsg-1+b1 [sh4], 4.4.0+dfsg-1+b1 [x32])
- tuyauterie de réduction de données pour l’instrument AMBER de l’ESO
- cpl-plugin-amber-calib (4.4.3+dfsg-1) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for AMBER
- cpl-plugin-fors (5.5.7+dfsg-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 5.5.7+dfsg-2+b1 [alpha], 5.5.7+dfsg-2 [sh4], 5.5.6+dfsg-1 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the FORS1/2 instruments
- cpl-plugin-fors-calib (5.5.7+dfsg-2) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for FORS2
- cpl-plugin-giraf (2.16.10+dfsg-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 2.16.10+dfsg-1+b1 [sh4], 2.16.7+dfsg-1+b1 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the GIRAFFE instrument
- cpl-plugin-giraf-calib (2.16.10+dfsg-1) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for GIRAFFE
- cpl-plugin-hawki (2.4.11+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.4.11+dfsg-1 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4], 2.4.8+dfsg-1 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the HAWK-I instrument
- cpl-plugin-hawki-calib (2.4.11+dfsg-1) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for HAWK-I
- cpl-plugin-muse (2.8.7+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.8.7+dfsg-3 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4], 2.8.3+dfsg-1 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the MUSE instrument
- cpl-plugin-muse-calib (2.8.7+dfsg-3) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for MUSE
- cpl-plugin-naco (4.4.11+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 4.4.11+dfsg-1 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4], 4.4.9+dfsg-1 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the NaCo instrument
- cpl-plugin-naco-calib (4.4.11+dfsg-1) [contrib]
- ESO data reduction pipeline NaCo calibration data downloader
- cpl-plugin-uves (6.1.8+dfsg-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 6.1.8+dfsg-2+b1 [alpha, sh4], 6.1.3+dfsg-2+b1 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the UVES instrument
- cpl-plugin-uves-calib (6.1.8+dfsg-2) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for UVES
- cpl-plugin-vimos (4.1.7+dfsg-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 4.1.7+dfsg-2+b1 [alpha, sh4], 4.1.0+dfsg-1+b1 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the VIMOS instrument
- cpl-plugin-vimos-calib (4.1.7+dfsg-2) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for VIMOS
- cpl-plugin-visir (4.4.2+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 4.4.2+dfsg-1 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4], 4.3.10+dfsg-2 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the VISIR instrument
- cpl-plugin-visir-calib (4.4.2+dfsg-1) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for VISIR
- cpl-plugin-xshoo (3.5.3+dfsg-1+b4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.5.3+dfsg-1+b1 [sh4], 3.5.0+dfsg-1+b1 [x32])
- ESO data reduction pipeline for the XSHOOTER instrument
- cpl-plugin-xshoo-calib (3.5.3+dfsg-1) [contrib]
- ESO data reduction pipeline calibration data downloader for XSHOOTER
- cpptraj (5.1.0+dfsg-3+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 5.1.0+dfsg-3+b1 [sh4])
- fast, parallelized molecular dynamics trajectory data analysis
- cpuinfo (0.0~git20230113.6481e8b-2)
- CPU INFOrmation library (binary utilities)
- crac (2.5.2+dfsg-6)
- integrated RNA-Seq read analysis
- critterding (1.0-beta12.1-1.3+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.0-beta12.1-1.3+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- évolution de la vie artificielle
- ctdconverter (2.1-6)
- Convert CTD files into Galaxy tool and CWL CommandLineTool files
- ctffind (4.1.14-2+b3 [mips64el, riscv64], 4.1.14-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 4.1.14-2 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32])
- fast and accurate defocus estimation from electron micrographs
- ctsim (6.0.2-6+b6 [mips64el], 6.0.2-6+b5 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 6.0.2-6+b4 [riscv64], 6.0.2-6+b2 [hppa, sh4], 6.0.2-6 [alpha, ia64, m68k], 5.2.0-4 [x32])
- Simulateur de tomographie calculée
- ctsim-help (6.0.2-6)
- fichier d’aide en ligne pour CTSim
- cufflinks (2.2.1+dfsg.1-9+b1) [non-free]
- Transcript assembly, differential expression and regulation for RNA-Seq
- cutadapt (4.7-2)
- Clean biological sequences from high-throughput sequencing reads
- cutesv (2.1.0-2)
- comprehensive discovery of structural variations of genomic sequences
- cwl-upgrader (1.2.11-1)
- Common Workflow Language standalone document upgrader
- cwlformat (2022.02.18-2)
- code formatter for Common Workflow Language
- cwltest (2.5.20240304113812-1)
- Common Workflow Language testing framework
- cwltool (3.1.20240404144621-2)
- implémentation de la référence du langage Common Workflow
- cwltool-doc (3.1.20240404144621-2)
- Common Workflow Language reference implementation -- docs
- daligner (1.0+git20240119.335105d-2)
- alignements locaux parmi des lectures longues de séquençages de nucléotide
- damapper (0.0+git20210330.ab45103-2)
- long read to reference genome mapping tool
- darknet (0.0.0+git20180914.61c9d02e-2+b5 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 0.0.0+git20180914.61c9d02e-2+b4 [alpha], 0.0.0+git20180914.61c9d02e-2+b3 [m68k], 0.0.0+git20180914.61c9d02e-2+b2 [hppa], 0.0.0+git20180914.61c9d02e-2+b1 [sparc64], 0.0.0+git20180914.61c9d02e-2 [x32])
- réseaux neuronaux au code source ouvert en C
- dascrubber (1.1-4+b1 [riscv64], 1.1-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- alignment-based scrubbing pipeline for DNA sequencing reads
- datalad (0.19.6-2)
- data files management and distribution platform
- datalad-container (1.2.5-1)
- DataLad extension for working with containerized environments
- dawg (1.2-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.2-4 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- simulate the evolution of recombinant DNA sequences
- dazzdb (1.0+git20230919.414ad05-2)
- manage nucleotide sequencing read data
- dcl-f77 (7.5.1-2)
- GFD-DENNOU Club Library (DCL) – version FORTRAN 77
- dcm2niix (1.0.20220720-1+b2 [hppa, riscv64], 1.0.20220720-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- convertisseur de dernière génération DICOM vers NIfTI
- dcmtk (3.6.7-13 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.6.7-9.1 [ia64])
- utilitaires en ligne de commande de la boîte à outils OFFIS DICOM
- debian-astro-logo (4.1)
- logo du mélange exclusif Debian Astronomie
- deblur (1.1.1-1)
- deconvolution for Illumina amplicon sequencing
- delly (1.1.8-1+b3 [alpha], 1.1.8-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- découverte de variantes structurelles par analyse des lectures
- density-fitness (1.0.8-4+b1 [riscv64, sparc64], 1.0.8-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 1.0.0-4 [hppa])
- Calculates per-residue electron density scores
- (1.0-6+b2 [riscv64], 1.0-6+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.0-6 [sh4])
- (d)extractor and compression command library
- dh-r (20231212)
- outils d’aide de Debian pour empaqueter les bibliothèques R
- dialign (2.2.1-12)
- alignement de plusieurs séquences par segments
- dialign-tx (1.0.2-15)
- alignement séquentiel multiple basé sur les segments
- dialign-tx-data (1.0.2-15)
- alignement de plusieurs séquences par segments – fichiers de données
- dials (3.17.0+dfsg3-3)
- Diffraction Integration for Advanced Light Sources
- diamond-aligner (2.1.9-1 [amd64, arm64, ia64, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.9.32-2 [sh4], 0.9.31-2 [alpha, m68k], 0.9.31-1 [hppa, sparc64])
- aligneur de séquence locale accéléré compatible avec BLAST
- dicomnifti (2.33.1-5+b2 [riscv64], 2.33.1-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sh4], 2.33.1-5 [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32])
- Convertit les fichiers DICOM au format NIfTI
- dimbl (0.15-2.1+b2)
- apprentissage automatique distribué
- discosnp (1:2.6.2-3+b1 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 1:2.6.2-1 [hppa], 1.2.6-2 [m68k, sh4])
- détection du polymorphisme d'un seul nucléotide pour des ensembles bruts de lectures
- disulfinder (1.2.11-12+b1 [riscv64], 1.2.11-12 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- prédiction de pont disulfure et de leur connectivité
- disulfinder-data (1.2.11-12)
- fichiers de données pour la prédiction de pont disulfure dans les protéines
- dlmodelbox (1.1.1-1)
- Swiss Army Knife of Deep Learning Models
- dmrgpp (6.06-2)
- algorithme de Groupe de Renormalisation de la Matrice Densité (DMRG)
- dnaclust (3-7+b4 [alpha], 3-7+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outil de regroupement de millions de séquences courtes d’ADN
- dnapi (1.1-3)
- prédiction d’adaptateur pour de petits séquençages d’ARN – outils
- dnarrange (1.5.3-1)
- Method to find rearrangements in long DNA reads relative to a genome seq
- doris (5.0.3~beta+dfsg-17) [contrib]
- Delft object-oriented radar interferometric software
- dotter (4.44.1+dfsg-7.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 4.44.1+dfsg-7.1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- comparaison détaillée de deux séquences génétiques
- dozzaqueux (3.51-4)
- simulateur pour des mélanges chimiques
- dozzaqueux-data (3.51-4)
- databases for chemical mixtures
- dpuser (4.1+dfsg-2+b2 [riscv64], 4.1+dfsg-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 4.1+dfsg-2 [m68k])
- Interactive language for handling numbers, strings, and matrices
- drawxtl (5.5-6.1+b2 [riscv64], 5.5-6.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- visionneur de structures cristallographiques
- drop-seq-testdata (2.5.4+dfsg-1)
- analyzing Drop-seq data (testdata)
- drop-seq-tools (2.5.4+dfsg-1)
- analyzing Drop-seq data
- drs4eb (5.0.6+git20211217+ds-3+b3 [mips64el], 5.0.6+git20211217+ds-3+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 5.0.6+git20211217+ds-3 [alpha, hppa, m68k, x32], 5.0.6+git20211217+ds-2+b2 [sh4], 5.0.6+git20211217+ds-2 [ia64])
- logiciel pour la carte d’évaluation de DSR4
- drslib (0.3.1.p3-2.1)
- Command-line tools for the Data Reference Syntax library
- dsdp (5.8-10.1)
- logiciel pour la programmation semi-définie positive
- dssp (4.2.2-2+b1 [riscv64, sparc64], 4.2.2-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32])
- protein secondary structure assignment based on 3D structure
- dwgsim (0.1.14-2+b1 [riscv64], 0.1.14-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- simulateur de lectures courtes de séquençage
- dx (1:4.4.4-15.1+b1 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64el], 1:4.4.4-15.1 [ia64, ppc64, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1:4.4.4-15+b1 [alpha, armel, armhf, hppa, m68k, sh4])
- OpenDX (IBM Visualization Data Explorer) : paquet principal
- dxf2gcode (20191025-2)
- dessins de pièces pour des machines-outils à commande numérique
- dxsamples (4.4.0-5)
- Programmes d'exemples pour OpenDX Data Explorer
- dyssol (1.1.1+ds1-2.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.1.1+ds1-2.1+b1 [ppc64, sparc64], 1.1.1+ds1-2.1 [alpha], 1.1.1+ds1-2 [m68k, sh4], 1.1.1+ds1-1 [hppa, ia64, x32])
- Tool for dynamic flowsheet simulation. Command line tool
- dyssol-data (1.1.1+ds1-2.1)
- Tool for dynamic flowsheet simulation. Data files
- dyssol-gui (1.1.1+ds1-2.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.1.1+ds1-2.1+b1 [ppc64, sparc64], 1.1.1+ds1-2.1 [alpha], 1.1.1+ds1-2 [m68k, sh4], 1.1.1+ds1-1 [hppa, ia64, x32])
- outil pour la simulation dynamique de schéma de procédé – interface graphique
- e-mem (1.0.1-5+b1 [riscv64], 1.0.1-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- calcul efficace des MEM pour de très grands génomes
- e00compr (1.0.1-7+b1 [riscv64], 1.0.1-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- programme de lecture et écriture de fichiers compressés E00 d’Arcinfo
- ea-utils (1.1.2+dfsg-9+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.1.2+dfsg-9+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- command-line tools for processing biological sequencing data
- easychem (0.6-9+b2 [riscv64], 0.6-9+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- trace des molécules et des formules chimiques 2D de haute qualité
- ecaccess (4.0.1-1.1)
- clients pour accéder aux fonctions du CEPMMT
- ecflow-client (5.12.3-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 5.11.4-1+b1 [sh4], 5.8.4-2+b1 [x32], 5.8.4-2 [m68k])
- outils client pour des flux de travaux météorologiques
- ecflow-server (5.12.3-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 5.11.4-1+b1 [sh4], 5.8.4-2+b1 [x32], 5.8.4-2 [m68k])
- contrôleur de flux de travaux météorologiques – serveur
- ecopcr (1.0.1+dfsg-4+b1 [riscv64], 1.0.1+dfsg-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- estimate PCR barcode primers quality
- ectrans-utils (1.3.1-1)
- Spherical Harmonics Transforms library - utilities
- edfbrowser (2.07+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 2.06+dfsg-1 [alpha], 1.97+dfsg-1 [x32], 1.95+dfsg-1 [hppa, m68k, ppc64, sparc64])
- visualisateur pour les fichiers de stockage biomédicaux tels que BDF et EDF
- edlib-aligner (1.2.7-5)
- edlib sequence alignment tool using edit distance
- edtsurf (0.2009-10+b1 [riscv64], 0.2009-10 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- surfaces de maillage triangulaire pour les structures de protéines
- eigensoft (8.0.0+dfsg-2)
- reduction of population bias for genetic analyses
- elastix (5.1.0-1 [amd64], 4.5-4 [alpha, ppc64, x32], 4.4-2 [hppa])
- Boîte à outils pour le recalage rigide et non-rigide d'images
- elk-lapw (9.2.12-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 9.2.12-1 [sh4])
- All-Electron Density-Functional Electronic Structure Code
- elki (0.7.1-10.1)
- cadriciel de développement pour des algorithmes d’exploration de données
- elki-dev (0.7.1-10.1)
- Data mining algorithm development framework - development files
- elph (1.0.1-5+b1 [riscv64], 1.0.1-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- DNA/protein sequence motif finder
- embassy-domainatrix (0.1.660-5 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64], 0.1.660-4 [hppa, m68k, sh4, x32])
- commandes supplémentaires EMBOSS pour manipuler un fichier de classification de domaines
- embassy-domalign (0.1.660-5 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64], 0.1.660-4 [hppa, m68k, sh4, x32])
- commandes EMBOSS additionnelles pour l'alignement dans le domaine des protéines
- embassy-domsearch (1:0.1.660-4 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64], 1:0.1.660-3 [hppa, m68k, sh4, x32])
- commandes supplémentaires EMBOSS pour la recherche dans les domaines de la protéine
- emboss (6.6.0+dfsg-15 [amd64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, sparc64], 6.6.0+dfsg-14 [alpha, arm64, ppc64], 6.6.0+dfsg-13 [x32], 6.6.0+dfsg-12 [hppa, m68k, sh4])
- ensemble de logiciels libres pour la biologie moléculaire européenne
- emboss-data (6.6.0+dfsg-15)
- fichiers de données pour le paquet EMBOSS
- emboss-explorer (2.2.0-12)
- interface web graphique pour EMBOSS
- emboss-lib (6.6.0+dfsg-15 [amd64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, sparc64], 6.6.0+dfsg-14 [alpha, arm64, ppc64], 6.6.0+dfsg-13 [x32], 6.6.0+dfsg-12 [hppa, m68k, sh4])
- EMBOSS Libraries
- emmax (0~beta.20100307-5+b1 [riscv64], 0~beta.20100307-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- cartographie génétique en fonction de la structure de la population
- engauge-digitizer (12.1+ds.1-1+b2 [riscv64], 12.1+ds.1-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 12.1+ds.1-1 [alpha, m68k, x32])
- extraction interactive des valeurs depuis des images bitmap ou des cartes
- ent (1.2debian-3+b1 [riscv64], 1.2debian-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- programme de test de séquences de nombres pseudo-aléatoires
- epics-base (7.0.8+dfsg1-1)
- EPICS tools
- epigrass (3.0.3+dfsg-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 3.0.3+dfsg-2 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64], 2.6.0+dfsg-1 [x32], 2.4.7-2 [ia64])
- Outil scientifique pour la simulation et l'analyse de sénarios dans des réseaux épidémiologiques
- ergo (3.8-1+b1 [riscv64], 3.8-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 3.5-1 [sh4], 3.2.1-1 [x32])
- Quantum chemistry program for large-scale calculations
- ergo-data (3.8-1)
- Quantum chemistry program for large-scale calculations - data package
- eso-midas (23.02pl1.0-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 13.09pl1.4-1 [sparc64])
- ESO-Midas (European Southern Observatory — Munich Image Data Analysis System)
- eso-midas-testdata (23.02pl1.0-2)
- Test data files for ESO-MIDAS
- eso-pipelines (1.3)
- ESO VLT Instrument pipeline collection
- esorex (3.13.7+ds-1+b1 [riscv64], 3.13.7+ds-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 3.12.3-1 [sparc64])
- outils d’exécution pour des automatismes de l’Observatoire européen austral
- estscan (3.0.3-6+b1 [riscv64], 3.0.3-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- détecteur indépendant du cadre de lecture ouvert pour les séquences codantes d’ADN
- esys-particle (2.3.5+dfsg2-6+b4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.3.5+dfsg2-6+b2 [hppa], 2.3.5+dfsg2-6+b1 [sh4], 2.3.5+dfsg2-6 [m68k], 2.3.5+dfsg2-1+b2 [x32])
- Software for particle-based numerical modelling (MPI version)
- etsf-io (1.0.4-5+b2 [riscv64], 1.0.4-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.0.4-5 [sh4])
- Binary tools to check, merge and read ETSF files
- examl (3.0.22-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.0.22-4 [sh4, x32])
- code Exascale Maximum Likelihood (ExaML) pour l’inférence phylogénétique
- exonerate (2.4.0-5+b2 [riscv64], 2.4.0-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outil générique pour la comparaison de deux séquences
- expeyes (5.3.1+repack-6)
- infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques
- expeyes-clib (5.3.1+repack-6 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 5.3.1+repack-5 [alpha, hppa, sh4], 5.3.0+repack-3 [m68k], 4.9.2+repack-2 [x32], 4.4.3+dfsg-1 [ia64])
- infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques
- eye (22.1201.1601~ds-1)
- semantic web reasoning engine
- eyes17 (5.3.1+repack-6)
- infrastructure logicielle et matérielle pour développer des expériences scientifiques
- eyes17-manuals-en (5.3.1+repack-1)
- manuel d’utilisation d’EYES17 – version anglaise
- eyes17-manuals-es (5.3.1+repack-1)
- Eyes17 User Manuals (Spanish version)
- eyes17-manuals-fr (5.3.1+repack-1)
- manuel d’utilisation d’EYES17 – version française
- eyes17-manuals-ml (5.3.1+repack-1)
- Eyes17 User Manuals (Malayalam version)
- facet-analyser (0.0~git20221121142040.6be10b8+ds1-3+b1)
- ParaView plugin for facet detection and angles measurement
- fast5 (0.6.5-7)
- utilities for manipulating Oxford Nanopore Fast5 files
- fasta3 (36.3.8i.14-Nov-2020-1+b1 [riscv64], 36.3.8i.14-Nov-2020-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- tools for searching collections of biological sequences
- fastahack (1.0.0+dfsg-11+b1 [riscv64], 1.0.0+dfsg-11 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- utility for indexing and sequence extraction from FASTA files
- fastani (1.33-3+b1 [riscv64], 1.33-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Fast alignment-free computation of whole-genome Average Nucleotide Identity
- fastaq (3.17.0-6)
- outils de manipulation de fichiers FASTA ou FASTQ
- fastdnaml (1.2.2-16)
- outil pour la construction d'arbres phylogénétiques de séquences d'ADN
- fastlink (4.1P-fix100+dfsg-5)
- version plus rapide des programmes de généalogie génétique Linkage
- fastml (3.11-4)
- reconstruction d’ancestrales séquences d’acide aminé par maximum de vraisemblance
- fastp (0.23.4+dfsg-1+b1 [riscv64], 0.23.4+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 0.22.0+dfsg-2 [hppa, x32])
- Ultra-fast all-in-one FASTQ preprocessor
- fastq-pair (1.0-3+b1 [riscv64], 1.0-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- réécriture des appairages fastq pour que toutes les lectures aient une partenaire et éviter les singletons
- fastqc (0.12.1+dfsg-3)
- contrôle qualité pour les données de séquences à haut débit
- fastqtl (2.184+v7+dfsg-4+b3 [alpha], 2.184+v7+dfsg-4+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- mappage de LCQ (locus de caractères quantitatifs) dans cis pour les phénotypes moléculaires
- fasttext (0.9.2+ds-7)
- bibliothèque pour l’apprentissage efficace de représentation de mots et de classification de phrases
- fasttree (2.1.11-2+b1 [riscv64], 2.1.11-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- arbres phylogénétiques à partir d'alignements de nucléotides ou des séquences de protéines
- fcc (2.16-1+b1 [riscv64], 2.16-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Script to compile C/C++ programs and link to Fortran libraries
- feedgnuplot (1.62-1)
- frontal pour Gnuplot orienté tuyauterie (pipe)
- feff85exafs (0.2+dfsg-2+b1 [riscv64], 0.2+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Open Source theoretical EXAFS calculations
- ffindex (0.9.9.9-6.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.9.9.9-6.1 [sh4])
- index/base de données simple pour d'énormes quantités de petits fichiers
- fiat-utils (1.3.0-1)
- Fortran IFS and Arpege Toolkit - utilities
- figtree (1.4.4-6)
- visionneuse d'arbres phylogénétiques sous forme graphique
- filtlong (0.2.1-4+b1 [riscv64], 0.2.1-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- quality filtering tool for long reads of genome sequences
- filtlong-data (0.2.1-4)
- filtrage de lectures longues selon leur qualité de séquences de génome – données de test
- finalcif (134+dfsg-1)
- editor for Crystallographic Information Format
- firm-phoenix-ware (4.7.5+repack-2)
- microprogramme nécessaires pour les systèmes publiés par le projet PHOENIX
- fitgcp (0.0.20150429-5)
- fitting genome coverage distributions with mixture models
- fitscut (1.4.4-6)
- Extract cutouts from FITS image format files
- fitsh (0.9.4-1+b1 [riscv64], 0.9.4-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Software package for astronomical image processing
- fitspng (2.0-2+b1)
- FITS to PNG converter
- fitsverify (4.22-1+b2 [riscv64], 4.22-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outil de vérification de format d’un fichier FITS
- fityk (1.3.2-3+b5 [armhf, mips64el, riscv64], 1.3.2-3+b4 [amd64, arm64, armel, i386, ppc64, ppc64el, s390x], 1.3.2-3+b3 [sparc64], 1.3.2-3 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32], 1.3.2-2 [ia64])
- ajustement de courbes et analyse de données non linéaires d’usage général
- flash (1.2.11-2+b1 [riscv64], 1.2.11-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Fast Length Adjustment of SHort reads
- flexbar (1:3.5.0-5+b1 [riscv64], 1:3.5.0-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- code-barres flexible et suppression de l'adaptation pour les plateformes de séquençage
- (5.0-17+b1 [riscv64], 5.0-17 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el], 5.0-16 [hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- modèle de trajectoire pour tracer les phénomènes de transport aérien
- flye (2.9.3+dfsg2-1)
- assembleur de novo pour les lectures de séquençage de molécule unique utilisant un graphe de répétitions
- fml-asm (0.1+git20190320.b499514-1+b1)
- outil pour l’assemblage Illumina de lectures courtes pour de petites régions
- foma (1:0.10.0+s311-1.2+b1)
- outils pour construire des automates à états finis
- foma-bin (1:0.10.0+s311-1.2)
- paquet de transition pour foma
- form (4.3.1+git20240409+ds-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 4.3.0+git20230104+ds-1 [sh4, x32])
- système de manipulation symbolique
- fractalnow (0.8.2-5+b2 [riscv64], 0.8.2-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.8.2-5 [alpha])
- générateur rapide et avancé de fractales
- free42-nologo (3.1.7+ds-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.4.77-1.2 [alpha, hppa])
- Free42 est une réimplémentation du calculateur HP-42S
- freebayes (1.3.7-1+b1 [riscv64], 1.3.7-1 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el], 1.3.6-2+b1 [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64])
- détection bayésienne de polymorphismes basée sur les haplotypes et génotypage
- freecad (0.21.2+dfsg1-1 [all], 0.16.6712+dfsg1-3 [alpha, m68k, x32], 0.16.6712+dfsg1-1+b1 [sh4, sparc64], 0.16+dfsg2-3 [hppa])
- programme extensible et au code source ouvert de CFAO
- freecad-common (0.21.2+dfsg1-1)
- Extensible Open Source CAx program - common files
- freecad-python3 (0.21.2+dfsg1-1+b5 [armel, armhf], 0.21.2+dfsg1-1+b3 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x])
- programme extensible et au code source ouvert de CFAO – binaires en Python 3
- freecontact (1.0.21-13.1+b2 [sparc64], 1.0.21-13.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.0.21-13.1 [hppa, sh4])
- prédicteur rapide de contact de protéine
- freesasa (2.1.2-4+b1 [riscv64], 2.1.2-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Solvent Accessible Surface Area of biomolecules
- frog (0.20-2.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.20-2.1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- analyseur et étiqueteur pour les langages naturels – environnement d’exécution
- frogdata (0.18-2)
- Data files for Frog
- fsa (1.15.9+dfsg-6+b1 [riscv64], 1.15.9+dfsg-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64])
- Fast Statistical Alignment of protein, RNA or DNA sequences
- fsm-lite (1.0-8+b1 [riscv64], 1.0-8 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32])
- frequency-based string mining (lite)
- ftools-fv (5.5.2+dfsg-3)
- outil pour afficher et éditer des fichiers au format FITS
- ftools-pow (5.5.2+dfsg-3)
- Curve plotting and image display interface tool
- funtools (1.4.8-1.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 1.4.8-1.1 [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32])
- Minimal buy-in FITS utility package
- fxt-tools (0.3.13-4.1)
- bibliothèque de traçage multifil
- gabedit (2.5.1+ds-1+b3 [s390x], 2.5.1+ds-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, x32], 2.5.1+ds-1+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64])
- interface utilisateur graphique pour paquets Ab Initio
- galileo (0.5.1-9.1)
- utilitaire pour synchroniser solidement un périphérique Fitbit avec le service web de Fitbit
- galileo-daemon (0.5.1-9.1)
- utilitaire pour synchroniser solidement un périphérique Fitbit – démon
- gamgi (0.17.5-1+b2 [riscv64], 0.17.5-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- interface graphique de modélisation atomique générale (GAMGI)
- gamgi-data (0.17.5-1)
- General Atomistic Modelling Graphic Interface (data)
- garli (2.1-7+b2 [riscv64], 2.1-7+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 2.1-7 [sh4])
- phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood
- garli-examples (2.1-7)
- phylogenetic analysis of molecular sequence data (examples)
- garli-mpi (2.1-7+b2 [riscv64], 2.1-7+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 2.1-7 [sh4])
- phylogenetic analysis of molecular sequence data using maximum-likelihood (MPI)
- garlic (1.6-3+b1 [amd64, riscv64], 1.6-3 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- logiciel de visualisation de biomolécules
- gasic (0.0.r19-8)
- genome abundance similarity correction
- gasic-examples (0.0.r19-8)
- genome abundance similarity correction (example data)
- gatb-core (1.4.2+dfsg-13+b1 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 1.4.2+dfsg-13 [alpha], 1.4.2+dfsg-10 [hppa])
- Genome Analysis Toolbox with de-Bruijn graph
- gatb-core-testdata (1.4.2+dfsg-13)
- Genome Analysis Toolbox with de-Bruijn graph (test data)
- gausssum (3.0.2-2)
- analyse et affichage de sorties Gaussian, GAMESS…
- gbrowse (2.56+dfsg-12)
- navigateur de génome générique GMOD
- gbrowse-calign (2.56+dfsg-12+b2)
- outil auxiliaire CAlign
- gbrowse-data (2.56+dfsg-12)
- données d’échantillon pour utiliser GBrowse
- gbutils (6.3-1+b1 [riscv64], 6.3-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- utilities for command line econometrics
- gchempaint (0.14.17-6.2+b2 [riscv64], 0.14.17-6.2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, s390x, sparc64], 0.14.17-6.2 [hppa, m68k, sh4], 0.14.17-1+b1 [ppc64], 0.14.15-1 [x32])
- éditeur 2D de structures chimiques pour le bureau GNOME2
- gcrystal (0.14.17-6.2+b2 [riscv64], 0.14.17-6.2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, s390x, sparc64], 0.14.17-6.2 [hppa, m68k, sh4], 0.14.17-1+b1 [ppc64], 0.14.15-1 [x32])
- visualiseur léger de structures cristallines
- gcu-bin (0.14.17-6.2+b2 [riscv64], 0.14.17-6.2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, s390x, sparc64], 0.14.17-6.2 [hppa, m68k, sh4], 0.14.17-1+b1 [ppc64], 0.14.15-1 [x32])
- outils GNOME pour la chimie – applications auxiliaires
- gcu-plugin (0.14.17-1+b1 [ppc64], 0.14.15-1 [x32]) [debports]
- GNOME chemistry utils (browser plugin)
- gdal-bin (3.8.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.8.4+dfsg-3+b1 [ppc64], 3.8.4+dfsg-3 [alpha], 3.8.4+dfsg-1 [sh4], 3.6.1+dfsg-1+b1 [x32])
- Bibliothèque d'abstraction de données géospatiales - outils
- gdal-data (3.8.5+dfsg-1)
- Geospatial Data Abstraction Library - Data files
- gdal-plugins (3.8.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.8.4+dfsg-3+b1 [ppc64], 3.8.4+dfsg-3 [alpha], 3.8.4+dfsg-1 [sh4], 3.6.1+dfsg-1+b1 [x32])
- Geospatial Data Abstraction Library - Plugins
- gdis (0.90-6+b2 [ppc64, riscv64, s390x, x32], 0.90-6+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, sh4, sparc64])
- visualisateur de modèle de molécule et de cristal
- gdis-data (0.90-6)
- visualisateur de modèle de molécule et de cristal — fichiers de données
- gdl-astrolib (2022.09.12+dfsg-1)
- Low-level astronomy software for GDL
- gdl-coyote (2022.04.12-1)
- GDL library from D. Fannings IDL courses
- gdl-mpfit (1.85+2017.01.03-4)
- Robust non-linear least squares curve fitting for GDL
- gdpc (2.2.5-16+b2 [riscv64], 2.2.5-16+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, x32], 2.2.5-11 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64])
- Visualisateur de simulations de dynamique moléculaire
- gdpc-examples (2.2.5-16)
- fichiers d’exemples pour le programme gdpc
- gelemental (2.0.2-1.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.0.2-1.1 [alpha, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- visionneuse de tableau périodique des éléments
- gemma (0.98.5+dfsg-2+b1 [riscv64], 0.98.5+dfsg-2 [amd64, arm64, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64])
- Genome-wide Efficient Mixed Model Association
- gemma-doc (0.98.5+dfsg-2)
- Example folder for GEMMA
- gemmi (0.6.4+ds-1+b1 [riscv64], 0.6.4+ds-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.4.9+ds-1 [ia64])
- bibliothèque pour la biologie structurale – exécutable
- genometester (4.0+git20200511.91cecb5+dfsg-1+b1 [riscv64], 4.0+git20200511.91cecb5+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- boîte à outils pour réaliser des opérations d’ensembles sur des listes de k-mères
- genomethreader (1.7.3+dfsg-10+b2 [mips64el], 1.7.3+dfsg-10+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 1.7.3+dfsg-10 [alpha, ppc64])
- outil logiciel pour le calcul de prédictions de structure de gène
- genometools (1.6.5+ds-2.1+b1 [riscv64], 1.6.5+ds-2.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32])
- boîte à outils polyvalente d'analyse du génome
- genometools-common (1.6.5+ds-2.1)
- shared data files for GenomeTools
- genomicsdb-tools (1.5.0-2+b1 [alpha, amd64, m68k, mips64el], 1.5.0-2 [sh4])
- sparse array storage library for genomics (tools)
- gentle (1.9.5~alpha1+dfsg-1+b3 [amd64, riscv64], 1.9.5~alpha1+dfsg-1+b2 [arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.9.5~alpha1+dfsg-1 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32], 1.9+cvs20100605+dfsg1-10 [ia64])
- ensemble de logiciels pour planifier le clonage génétique
- geographiclib-tools (2.3-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.3-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- bibliothèque C++ pour résoudre des problèmes géodésiques –⋅outils
- geotiff-bin (1.7.1-5+b1 [riscv64], 1.7.1-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- bibliothèque GeoTIFF (geografic enabled TIFF) – outils
- gerris (20131206+dfsg-19.1+b1 [alpha, amd64, arm64, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 20131206+dfsg-19.1 [armel, armhf, hppa, m68k], 20131206+dfsg-19+b1 [sh4])
- solveur hydrodynamique Gerris
- getdata (0.2-4)
- management of external databases
- gff2aplot (2.0-15)
- tracés d'alignements par paires pour les séquences génomiques avec PostScript
- gff2ps (0.98l-6)
- Produit des graphiques PostScript à partir de fichiers GFF
- gffread (0.12.7-4+b1 [riscv64], 0.12.7-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- GFF/GTF format conversions, region filtering, FASTA sequence extraction
- gfsview (20121130+dfsg-7) [debports]
- visualisateur graphique de fichiers de simulation avec Gerris
- gfsview-batch (20121130+dfsg-8.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 20121130+dfsg-8.1 [hppa, m68k], 20121130+dfsg-8 [ia64, sh4])
- visualisateur graphique de fichiers de simulation avec Gerris – traitement par lot
- gftl-dev (1.3.0+is-really-1.2.7-1)
- Containers and iterators for Fortran
- gftl-shared-dev (1.0.7-2+b1 [riscv64], 1.0.7-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Common gFTL containers of Fortran intrinsic types
- ggd-utils (1.0.0+ds-1+b9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 1.0.0+ds-1+b8 [sparc64], 1.0.0+ds-1+b6 [riscv64])
- programs for use in ggd
- ghkl (5.0.0.3381-1+b1 [riscv64], 5.0.0.3381-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4], 5.0.0.3001-1 [hppa, sparc64], 5.0.0.2661-1+b1 [x32])
- application de contrôle de calculs de diffractomètre
- ghmm (0.9~rc3-6)
- General Hidden-Markov-Model library - tools
- ginga (5.0.1-1)
- Astronomical image viewer
- gjh-asl-json (0.0+git20210628.867c5da-1+b1 [riscv64], 0.0+git20210628.867c5da-1 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64])
- gjh solver, like solver from AMPL Library
- glam2 (1064-9+b1 [riscv64], 1064-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- motifs de protéines lacunaires de séquences non alignées
- glgrib-data (1.0-3)
- Display GRIB2 fields using OpenGL (data for glgrib)
- glgrib-egl (1.0-3+b3 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 1.0-3+b2 [alpha, hppa, m68k, sh4])
- Render geophysical fields encoded in GRIB edition 2 using OpenGL
- glgrib-glfw (1.0-3+b3 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 1.0-3+b2 [alpha, hppa, m68k, sh4])
- Interactive display for geophysical fields encoded in GRIB2
- glgrib-shaders (1.0-3)
- Display GRIB2 fields using OpenGL (shaders for glgrib)
- glgrib-testdata (1.0-3)
- Display GRIB2 fields using OpenGL (test data for glgrib)
- glgrib-tk (1.0-3+b3 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 1.0-3+b2 [alpha, hppa, m68k, sh4])
- Display GRIB2 fields using OpenGL (Perl/Tk interface)
- gliese (3.0.95-3) [non-free]
- stellar data set from the Third Catalogue of Nearby Stars
- glueviz (1.17.1+dfsg-1)
- Linked data visualization
- gmap (2024-02-22+ds-1)
- alignement d’épissage et tolérante sur les SNP pour les lectures courtes et mNRA
- gmt (6.5.0+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 6.4.0+dfsg-2+b1 [ia64, sh4], 6.4.0+dfsg-2 [x32])
- outils de cartographie générique
- gmt-common (6.5.0+dfsg-3)
- outils de cartographie générique – fichiers indépendants de l’architecture
- gmt-dcw (2.1.2-1)
- Digital Chart of the World (DCW) for GMT
- gmt-gshhg (2.3.7-6)
- Global Self-consistent Hierarchical High-resolution Geography (GSHHG)
- gmt-gshhg-full (2.3.7-6)
- trait de côte de haute résolution pour GMT (Generic Mapping Tools)
- gmt-gshhg-high (2.3.7-6)
- traits de côte dans une haute résolution pour GMT (Generic Mapping Tools)
- gmt-gshhg-low (2.3.7-6)
- Low resolution coastlines for the Generic Mapping Tools
- gnuastro (0.22-3.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.22-3.1 [hppa, m68k, sh4])
- GNU Astronomy Utilities programs
- goby-java (3.3.1+dfsg2-10)
- next-generation sequencing data and results analysis tool
- gpaw (24.1.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 23.9.1-1+b1 [sh4], 20.1.0-2 [x32])
- DFT and beyond within the projector-augmented wave method
- gpaw-data (24.1.0-1)
- gpaw datasets/setups
- gperiodic (3.0.3-1+b2 [riscv64], 3.0.3-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Table périodique des éléments
- gpx (2.6.8-1+b1 [riscv64], 2.6.8-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- post-traitement de conversion gcode vers x3g
- grabix (0.1.7-4+b1 [riscv64], 0.1.7-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- wee tool for random access into BGZF files
- graphlan (1.1.3-4)
- circular representations of taxonomic and phylogenetic trees
- grass (8.3.2-1)
- système de gestion et d’analyse de ressources géographiques – SIG GRASS
- grass-core (8.3.2-1+b1 [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 8.3.2-1 [armel, armhf], 8.3.1-2 [hppa, sh4], 8.3.0-1 [m68k], 8.2.0-3 [x32], 7.8.3-1+b1 [ia64])
- composants centraux du SIG GRASS
- grass-gui (8.3.2-1+b1 [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 8.3.2-1 [armel, armhf], 8.3.1-2 [hppa, sh4], 8.3.0-1 [m68k], 8.2.0-3 [x32], 7.8.3-1+b1 [ia64])
- interfaces utilisateur graphiques pour le SIG GRASS
- gravit (0.5.1+dfsg-6+b2 [riscv64], 0.5.1+dfsg-6+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- simulateur de gravité à couper le souffle
- gravit-data (0.5.1+dfsg-6)
- fichiers de données pour Gravit
- gri (2.12.27-1.2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.12.27-1.1 [sh4])
- langage pour l'illustration scientifique
- grinder (0.5.4-6)
- simulateur polyvalent de lecture de séquençage global et d'amplicon omiques
- gromacs (2024.1-1+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2023.1-2 [ia64], 2021.4-2 [hppa, m68k, sh4, x32], 2020.5-4 [alpha])
- Simulateur de dynamique moléculaire avec outils d'analyse et de préparation
- gromacs-data (2024.1-1)
- simulateur de dynamique moléculaire GROMACS – données et documentation
- gromacs-mpi (2021.4-2) [debports]
- Molecular dynamics sim, binaries for MPI parallelization
- gromacs-mpich (2020.5-4) [debports]
- simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec MPICH
- gromacs-openmpi (2020.5-4) [debports]
- simulation de dynamique moléculaire, binaires pour la parallélisation avec OpenMPI
- groops (0+git20230516+ds-3+b1) [non-free]
- software toolkit for gravity field recovery and GNSS processing
- groops-gui (0+git20230516+ds-3+b1) [non-free]
- software toolkit for gravity field recovery and GNSS processing (GUI)
- gsort (0.1.4-3+b15 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 0.1.4-3+b10 [ppc64, x32], 0.1.4-3+b9 [alpha, riscv64], 0.1.4-3+b8 [sparc64])
- sort genomic data
- gubbins (3.3.3-1 [amd64, i386], 2.3.5-1 [alpha, m68k, ppc64, riscv64])
- phylogenetic analysis of genome sequences
- gvb (1.4-1.1)
- visual simulator of 1 and 2-dimensional vibrations
- gwama (2.2.2+dfsg-5+b1 [riscv64], 2.2.2+dfsg-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Genome-Wide Association Meta Analysis
- gwyddion (2.64-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.64-1.1 [m68k, sh4])
- outil d'analyse et de visualisation de données SPM (« Scanning Probe Microscopy »)
- gwyddion-common (2.64-1.1)
- fichiers indépendants de l’architecture pour Gwyddion, outil d’analyse SPM
- gyoto (2.0.2-1.1)
- General relativistic geodesic integration and ray-tracing
- gyoto-bin (2.0.2-1.1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.0.2-1 [hppa], 1.4.4-8+b4 [sh4], 1.4.4-8+b3 [alpha], 1.2.0-4+b5 [x32])
- General relativistic ray-tracing command-line interface
- h5utils (1.13.2-1+b2 [riscv64], 1.13.2-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.13.2-1 [sh4])
- outils de visualisation de fichiers HDF5
- harminv (1.4.2-1+b1 [riscv64], 1.4.2-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- extraction of complex frequencies and amplitudes from time series
- harvest-tools (1.3-8+b6 [armel, armhf], 1.3-8+b4 [alpha, amd64, arm64, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.3-8+b3 [hppa, riscv64])
- archivage et post-traitement d’alignements multiples génomiques « reference-compressed »
- hdf-compass (0.7~b8-3)
- visualisateur pour les formats HDF5 et apparentés
- hdf5-filter-plugin (0.0~git20221111.49e3b65-4+b2 [riscv64], 0.0~git20221111.49e3b65-4+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32], 0.0~git20221111.49e3b65-4 [sh4])
- external filters for HDF5: LZ4, BZip2, Bitshuffle
- hdf5-filter-plugin-blosc-serial (0.0~git20220616.9683f7d-5+b2 [riscv64], 0.0~git20220616.9683f7d-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 0.0~git20220616.9683f7d-5 [sh4])
- blocking, shuffling and lossless compression library
- hdf5-filter-plugin-zfp-serial (1.1.1-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, x32], 1.1.1-2 [sh4])
- Compression plugin for the HDF5 library using ZFP compression
- hdf5-helpers (1.10.10+repack-3.3 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.10.10+repack-3.1 [alpha], 1.10.10+repack-3 [sh4])
- HDF5 – assistants
- hdf5-plugin-zfp (1.1.0+git20221021-2) [debports]
- Compression plugin for the HDF5 library using ZFP compression
- hdf5-plugin-zfp
- paquet virtuel fourni par hdf5-filter-plugin-zfp-serial
- hdf5-tools (1.10.10+repack-3.3 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.10.10+repack-3.1 [alpha], 1.10.10+repack-3 [sh4])
- HDF5 – outils d'exécution
- herisvm (0.9.0-2)
- machine learning tools for classification algorithms
- heudiconv (0.11.6-1)
- DICOM converter with support for structure heuristics
- hfst (3.16.0-5+b2 [riscv64], 3.16.0-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.16.0-5 [alpha])
- technologie des transducteurs finis Helsinki
- hfst-ospell (0.5.4-1+b1)
- Spell checker library and tool based on HFST
- hhsuite (3.3.0+ds-8+b1 [riscv64], 3.3.0+ds-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, sh4, x32], 3.3.0+ds-2 [hppa, ppc64, sparc64])
- recherche de séquence de protéines basée sur l’alignement HMM-HMM
- hhsuite-data (3.3.0+ds-8)
- recherche de séquence de protéines basée sur l’alignement HMM-HMM – données
- hilive (2.0a-3+b3)
- alignement en temps réel des lectures Illumina
- hinge (0.5.0-7+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64], 0.5.0-7 [alpha], 0.5.0-6 [x32], 0.5.0-2 [hppa, ppc64, sparc64])
- assembleur de lectures longues de génome basé sur des « pivots »
- hisat2 (2.2.1-4+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.2.1-4+b2 [riscv64], 2.2.1-4 [m68k], 2.2.0-2 [x32])
- graph-based alignment of short nucleotide reads to many genomes
- hmmer (3.4+dfsg-2 [amd64, arm64, i386, ppc64, x32], 3.1b2-1 [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64])
- profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
- hmmer2 (2.3.2+dfsg-12 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 2.3.2+dfsg-11 [x32])
- profilage de modèles de Markov cachés pour la recherche de séquences
- hodie (1.5.0-4)
- affichage de la date en latin
- horae (071~svn537+ds1-1) [contrib]
- interactive graphical processing and analysis of EXAFS data
- hpcc (1.5.0-3+b2 [riscv64], 1.5.0-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.5.0-1 [sh4])
- mesureur de performance HPC Challenge
- htcondor (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32], 8.4.2~dfsg.1-1 [hppa])
- transitional dummy package
- htcondor-annex-ec2 (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- transitional dummy package
- htcondor-test (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- transitional dummy package
- htcondor-upgrade-checks (23.4.0+dfsg-1)
- transitional dummy package
- hts-nim-tools (0.2.1-1+b1 [riscv64], 0.2.1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, sparc64])
- tools biological sequences: bam-filter, count-reads, vcf-check
- hyphy-common (2.5.60+dfsg-1)
- test statistique en utilisant des phylogénies – fichiers communs
- hyphy-mpi (2.5.60+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.5.59+dfsg-1 [sh4])
- Hypothesis testing using Phylogenies (MPI version)
- hyphy-pt (2.5.60+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.5.59+dfsg-1 [sh4])
- Hypothesis testing using Phylogenies (pthreads version)
- i2masschroq (0.4.54-1)
- successeur de X!TandemPipeline
- i2masschroq-tools (0.4.54-1)
- utilitaires relatifs à X!Tandem pour timsTOF Pro et les données modernes mzML
- idba (1.1.3-8+b1 [riscv64], 1.1.3-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32])
- iterative De Bruijn Graph short read assemblers
- (1.1.3-8+b1 [riscv64], 1.1.3-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32])
- iterative De Bruijn Graph short read assemblers (extra tools)
- idseq-bench (0.0~git20210602.27fb6dc-1)
- Benchmark generator for the IDseq Portal
- ifeffit (2:1.2.11d-12.5+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2:1.2.11d-12.5 [x32])
- programme interactif d’analyse de XAFS
- igblast (1.19.0-1+b2 [riscv64], 1.19.0-1+b1 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32])
- Immunoglobulin and T cell receptor variable domain sequence analysis
- igdiscover (0.11-4)
- analyzes antibody repertoires to find new V genes
- ignition-common-cli (4.7.0+ds2-2.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64], 4.7.0+ds2-2.1 [m68k, sh4], 4.5.1+ds-2+b1 [alpha], 4.5.1+ds-2 [ia64])
- Collection of useful code used by robotics apps - CLI tools
- ignition-transport-cli (11.0.0+ds-4+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 11.0.0+ds-4+b2 [ia64])
- Ignition Robotics transport Library - CLI tools
- igor (1.4.0+dfsg-5)
- infers V(D)J recombination processes from sequencing data
- igv (2.17.3+dfsg-1)
- visualiseur génomique intégratif
- iitii (0.0+git20191030.85209e0-2+b1 [riscv64], 0.0+git20191030.85209e0-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, s390x, sh4, x32])
- Implicit Interval Tree with Interpolation Index
- illustrate (0.0+git20200923.217db48-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.0+git20200923.217db48-2 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- cartoonish representations of large biological molecules
- imagej (1.54g-1)
- programme de traitement d’image ciblant les images de microscopie
- imview (1.1.9h-4+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1.9h-4+b1 [hppa])
- Application de visualisation et d'analyse d'images
- indelible (1.03-6)
- powerful and flexible simulator of biological evolution
- indi-aagcloudwatcher-ng (1.7+20230106180155-1+b1 [riscv64], 1.7+20230106180155-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote INDI pour l’appareil Cloud Watcher d’AAG
- indi-aok (2.0+20221222093242-1+b2 [riscv64], 2.0+20221222093242-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sh4], 2.0+20221222093242-1 [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32])
- pilote INDI pour AOK Skywalker
- indi-apogee (1.9+20221223184417-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.9+20221223184417-1+b1 [x32])
- INDI driver for Apogee CCDs and Filter Wheels
- indi-armadillo-platypus (1.0+20221226082641-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0+20221226082641-2 [alpha])
- INDI driver for Lunatico Astronomia Armadillo and Platypus
- indi-asi (2.2+20221225102500-1) [contrib]
- INDI Driver for ZWO Optics ASI cameras
- indi-astrolink4 (0.1+20221223182627-1+b1 [riscv64], 0.1+20221223182627-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for Astrolink 4.0 devices
- indi-astromechfoc (0.2+20221223181816-1+b1 [riscv64], 0.2+20221223181816-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote INDI pour « Canon Lens Controller » d’Astromechanics
- indi-avalon (1.12+20221223132122-1+b1 [riscv64], 1.12+20221223132122-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote INDI pour les montures d’Avalon Instruments
- indi-beefocus (0.1+20221222010828-1+b1 [riscv64], 0.1+20221222010828-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote d’INDI pour Bee Focus
- indi-bresserexos2 (1.0+20221223130124-1+b2 [riscv64], 1.0+20221223130124-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sh4], 1.0+20221223130124-1 [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32])
- pilote INDI pour la monture de télescope Exos II GoTo
- indi-dreamfocuser (2.1+20221223125100-1+b1 [riscv64], 2.1+20221223125100-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for DeamFocuser focuser
- indi-dsi (0.4+20221223123028-1+b1 [riscv64], 0.4+20221223123028-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for Meade DSI Pro I/II/III
- indi-eqmod (1.0+20230126190232-1+b2 [riscv64], 1.0+20230126190232-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sh4], 1.0+20230126190232-1 [alpha, ia64, ppc64, x32], 1.0+20220611123707-1 [sparc64])
- pilote INDI pour EQMod
- indi-ffmv (0.3+20221223120905-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.3+20221223120905-2 [alpha])
- pilote INDI pour les appareils photographiques « Point Grey Firefly MV »
- indi-fishcamp (1.1-1) [contrib]
- INDI driver for Fishcamp Engineering CCD
- indi-fli (1.5+20221225141318-1+b1 [riscv64], 1.5+20221225141318-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for FLI CCD & Focuser
- indi-gige (0.1+20221223115700-2)
- INDI driver for GigE machine vision cameras
- indi-gphoto (3.2+20221221172841-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.2+20221221172841-2+b1 [alpha])
- INDI driver for GPhoto (DSLR) Cameras
- indi-gpsd (0.5+20221222000619-1+b4 [sh4], 0.5+20221222000619-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.5+20221222000619-1+b2 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sparc64, x32])
- pilote INDI pour le démon GPS gpsd
- indi-gpsnmea (0.2+20221223114018-1+b1 [riscv64], 0.2+20221223114018-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote INDI pour les transmissions GPS NMEA
- indi-inovaplx (1.4+20221221105828-1) [contrib]
- INDI driver for iNova PLX Cameras
- indi-limesdr (1.4+20221223110308-1+b2 [riscv64], 1.4+20221223110308-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for LimeSDR (LMS7) Receiver
- indi-maxdomeii (1.3+20221223105522-1+b1 [riscv64], 1.3+20221223105522-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote INDI pour le système de contrôle MaxDome II
- indi-mgen (0.1+20221222184336-1+b1 [riscv64], 0.1+20221222184336-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for Lacerta MGen Autoguider
- indi-mi (1.8-1) [contrib]
- INDI driver for cameras made by Moravian Instruments
- indi-nexdome (1.5+20221222183051-1+b1 [riscv64], 1.5+20221222183051-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote INDI pour NextDome
- indi-nightscape (1.0.6+20221222181314-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0.6+20221222181314-2 [alpha])
- INDI driver for Celestron Nightscape 8300
- indi-orion-ssg3 (0.1+20221222180647-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1+20221222180647-2 [alpha])
- pilote INDI pour les appareils photographiques StarShoot G3 et G4 d’Orion
- indi-pentax (1.0+20221221102411-1+b1) [contrib]
- INDI driver for Pentax cameras
- indi-playerone (0.9+20230105184731-1) [contrib]
- INDI driver for cameras made by Playerone
- indi-rtklib (1.0+20221222172722-1+b1 [riscv64], 1.0+20221222172722-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for precise positioning with RTKLIB
- indi-sbig (2.1+20221220234924-1) [contrib]
- INDI driver for SBIG cameras
- indi-shelyak (1.0+20221222171819-1+b1 [riscv64], 1.0+20221222171819-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for Shelyak and Alpy Spectrograph
- indi-spectracyber (1.3+20221222164952-1+b2 [riscv64], 1.3+20221222164952-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sh4], 1.3+20221222164952-1 [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32])
- pilote INDI pour le spectromètre de raie à 21 cm
- indi-starbook (0.8+20221222163625-1+b2 [riscv64], 0.8+20221222163625-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote INDI pour les contrôleurs de télescope Starbook de Vixen
- indi-starbook-ten (0.1-2+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.1-2+b1 [hppa, m68k, sh4], 0.1-2 [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32])
- pilote INDI pour les contrôleurs de télescope Starbook Ten de Vixen
- indi-sx (1.16+20221222162728-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.16+20221222162728-2 [alpha])
- INDI driver for Starlight Xpress CCD and Filter Wheel
- indi-talon6 (2.0+20221222160901-1+b1 [riscv64], 2.0+20221222160901-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- INDI driver for Talon6 Roll Off Roof
- indi-webcam (1.0+20221222161740-1+b1)
- INDI Driver for web cameras
- indi-weewx-json (1.0-1+b2 [amd64, riscv64], 1.0-1+b1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pilote INDI pour la station météorologique WeeWX
- indigo-utils (1.2.3-3.1+b1 [m68k, riscv64, sh4], 1.2.3-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64])
- Organic Chemistry Toolkit Utilities
- infernal (1.1.5-2 [amd64, arm64, i386, x32], 1.0.2-2 [alpha, m68k, ppc64, sh4, sparc64], 1.0.2-1 [hppa])
- inférence d’alignements structurels secondaires d’ARN
- inhomog (0.1.9.2-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 0.1.9.2-1+b2 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32])
- kinematical backreaction and average scale factor evolution
- inkscape-speleo (1.8-4)
- Inkscape plugin to help draw surveys
- inkscape-survex-export (2.0-1)
- greffon d’Inkscape pour numériser les impressions de levé
- insilicoseq (2.0.0-1)
- sequencing simulator producing realistic Illumina reads
- ipig (0.0.r5-4+b1 [riscv64], 0.0.r5-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- intégration de PSM dans des visualisations de navigateur de génome
- iqtree (2.0.7+dfsg-1+b1)
- logiciel phylogénétique de maximum de vraisemblance
- iraf (2.18-1)
- Image Reduction and Analysis Facility
- iraf-dev (2.18-1)
- Image Reduction and Analysis Facility (development files)
- iraf-fitsutil (2018.07.06-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64], 2018.07.06-7 [x32])
- FITS utilities for IRAF
- iraf-mscred (5.05+2018.07.09-3+b1)
- CCD mosaic reduction package for IRAF
- iraf-noao (2.18-1)
- paquet d’IRAF du NOAO pour la réduction de données
- iraf-noao-dev (2.18-1)
- IRAF NOAO data reduction package (development files)
- iraf-rvsao (2.8.5-2+b1)
- IRAF package to obtain radial velocities from spectra
- iraf-sptable (1.0~pre20180612-3+b1)
- IRAF package for Tabular Spectra
- iraf-st4gem (1.0+ds-2+b1)
- Selected tools from the Space Telescope Science Data Analysis System
- iraf-wcstools (3.9.7-1.1)
- prise en charge du WCS d’une image FITS – paquet pour IRAF
- iraf-xdimsum (2003.01.24-2)
- Deep Infrared Mosaicing Software
- irstlm (6.00.05-4.1)
- boîte à outils de modélisation de langage IRST
- ismrmrd-schema (1.8.0-2)
- schema for ISMRMRD
- ismrmrd-tools (1.8.0-2+b4 [amd64, arm64, armel, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.8.0-2+b3 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, x32], 1.8.0-2+b2 [sh4], 1.3.2-2 [sparc64])
- command-line tools for ISMRMRD
- iso2mesh-demos (1.9.6+ds-10)
- fichiers d’échantillon et scripts de démo pour la boite à outils Iso2Mesh
- iso2mesh-tools (1.9.6+ds-10 [amd64, arm64, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.9.6+ds-9 [alpha], 1.9.6+ds-7 [hppa, m68k, x32])
- 3D mesh generation and repairing utilities
- iva (1.0.11+ds-5)
- assemblage itératif de séquences virales
- ivar (1.4.2+dfsg-3+b2 [riscv64], 1.4.2+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, sh4, sparc64, x32])
- fonctions largement utiles pour le séquençage de virus basé sur les amplicons
- jaligner (1.0+dfsg-11)
- algorithme de Smith-Waterman avec l'amélioration de Gotoh
- jalview (2.11.3.1+dfsg-1)
- multiple alignment editor
- jblas (1.2.5+dfsg-1+b1 [riscv64], 1.2.5+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.4-3 [m68k], 1.2.4-1 [hppa])
- bibliothèque rapide d'algèbre linéaire pour Java
- jbmc (5.95.1-4)
- bounded model checker for Java programs
- jellyfish (2.3.1-3+b4 [ppc64el, riscv64], 2.3.1-3+b3 [amd64, arm64, mips64el], 2.3.1-2+b1 [hppa], 2.3.0-12 [ia64])
- count k-mers in DNA sequences
- jellyfish-examples (2.3.1-3)
- count k-mers in DNA sequences (examples for testing)
- jellyfish1 (1.1.11-9+b1 [riscv64], 1.1.11-9 [amd64, arm64, hppa, ia64, mips64el, ppc64el], 1.1.11-7 [alpha, ppc64, sparc64, x32])
- count k-mers in DNA sequences
- jemboss (6.6.0+dfsg-15)
- interface graphique pour EMBOSS
- jmodeltest (2.1.10+dfsg-12)
- sélection par calculs intensifs de modèle de substitution de nucléotide
- jmol (14.32.83+dfsg-3)
- visualisateur moléculaire
- jnifti-demos (0.6-3)
- sample files and demo scripts for JNIfTI toolbox
- jsamp (1.3.8-1)
- Java Simple Application Messaging Protocol tool for VO
- jube (2.6.1-1)
- JUBE Benchmarking Environment
- jupyter-notebook (6.4.12-2.2)
- notebook interactif de Jupyter
- kalign (1:3.4.0-1)
- Alignement séquentiel multiple global et progressif
- kallisto (0.48.0+dfsg-4+b3 [mips64el], 0.48.0+dfsg-4+b2 [riscv64], 0.48.0+dfsg-4+b1 [amd64, arm64, ppc64, ppc64el, s390x], 0.48.0+dfsg-4 [alpha, sparc64], 0.48.0+dfsg-2 [ia64], 0.46.2+dfsg-3 [hppa, m68k, sh4, x32])
- quantification RNA-seq presque optimale
- kallisto-examples (0.48.0+dfsg-4)
- near-optimal RNA-Seq quantification (example data)
- kalzium (4:23.08.5-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 4:22.12.3-1 [hppa, m68k, sh4], 4:22.12.0-2 [x32], 4:19.08.1-1 [sparc64])
- outil de table périodique et de chimie
- kalzium-data (4:23.08.5-1)
- fichiers de données pour Kalzium
- kaptive (2.0.8-1)
- obtain information about K and O types for Klebsiella genome assemblies
- kaptive-data (2.0.8-1)
- reference data for kaptive for Klebsiella genome assemblies
- kaptive-example (2.0.8-1)
- données d’exemples pour kaptive pour des assemblages du génome de klebsiella
- khmer (3.0.0~a3+dfsg-8 [amd64], 2.1.2+dfsg-9 [ia64], 2.0+dfsg-5 [sparc64])
- comptage k-mer, filtrage et parcours de graphe de séquences d’ADN en mémoire vive
- khmer-common (3.0.0~a3+dfsg-8)
- fichiers communs pour les outils du projet khmer
- kineticstools (0.6.1+git20220223.1326a4d+dfsg-2)
- détection de modification d’ADN
- kineticstools-data (0.6.1+git20220223.1326a4d+dfsg-2)
- détection de modifications d’ADN – fichiers de données
- king-probe (02.21-1+b1 [riscv64], 02.21-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- évaluation et visualisation de compacité interatomique de protéines
- kissplice (2.6.2-3 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64], 2.5.3-1 [x32], 2.2.1-1 [alpha, m68k], 2.1.0-1 [hppa, sh4])
- détection de diverses sortes de polymorphismes dans les données du séquençage de l'ARN
- kleborate (2.4.1-3 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 2.1.0-2 [m68k])
- tool to screen Klebsiella genome assemblies
- kleborate-examples (2.4.1-3)
- outil pour filtrer des assemblages de génome de klebsiella – exemple de données
- klustakwik (3.0.2+ds-2+b1 [riscv64], 3.0.2+ds-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- classement automatique des échantillons (pics) dans des regroupements
- kma (1.4.14-2+b1 [riscv64], 1.4.14-2 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.3.23-1 [hppa, m68k, sh4])
- mapping genomic sequences to raw reads directly against redundant databases
- kmc (3.2.4+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 3.1.1+dfsg-4 [ia64], 2.3+dfsg-10 [x32])
- décompte de k-mers dans des séquences de génome
- kmer (0~20150903+r2013-8)
- suite of tools for DNA sequence analysis
- kmer-examples (0~20150903+r2013-8)
- sample data for kmer suite of tools for DNA sequence analysis
- kmerresistance (2.2.0-4+b1 [riscv64], 2.2.0-4 [alpha, amd64, arm64, hppa, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- correlates mapped genes with the predicted species of WGS samples
- kokkos (3.7.01-2.1+b1 [riscv64], 3.7.01-2.1 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, sparc64], 3.7.01-1 [s390x])
- C++ Performance Portability Programming
- konclude (0.7.0+1138+git20220514~dfsg-1+b2 [riscv64], 0.7.0+1138+git20220514~dfsg-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.7.0+1138+git20220514~dfsg-1 [alpha])
- raisonneur de logique descriptive basé sur les tableaux pour le web sémantique
- kraken (1.1.1-4+b1 [riscv64], 1.1.1-4 [alpha, amd64, arm64, hppa, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, sparc64, x32], 0.10.5~beta-4 [m68k, sh4])
- assigning taxonomic labels to short DNA sequences
- kraken2 (2.1.3-1+b1 [riscv64], 2.1.3-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- taxonomic classification system using exact k-mer matches
- kst (2.0.8-5+b6 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 2.0.8-5+b5 [hppa, ia64, ppc64, sparc64], 2.0.8-5+b4 [riscv64], 2.0.8-5+b2 [m68k, sh4], 2.0.8-5+b1 [alpha, x32])
- outil scientifique de tracé de données
- kstars (5:3.6.2-2+b6 [armel, armhf], 5:3.6.2-2+b4 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 5:3.6.2-2+b3 [riscv64], 5:3.6.2-2+b2 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4], 5:3.5.9-1 [x32], 4:16.08.3-2 [sparc64])
- planétarium de bureau, planification d’observations et contrôle de télescope
- kstars-data (5:3.6.2-2)
- fichiers de données pour le planétarium KStars
- (1.1r1-9.1) [non-free]
- Tycho-2 star catalog for KStars
- lagan (2.0-10)
- highly parametrizable pairwise global genome sequence aligner
- lamarc (2.1.10.1+dfsg-7+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.1.10.1+dfsg-7+b3 [riscv64], 2.1.10.1+dfsg-7+b2 [alpha, hppa, sh4], 2.1.10.1+dfsg-7 [ia64, m68k, x32])
- analyse de vraisemblance avec l’algorythme de Metropolis en utilisant la théorie de la coalescence
- lamassemble (1.7.1-1)
- fusion de lectures « longues » d’ADN chevauchantes en séquences consensus
- lambda-align (1.0.3-6+b1 [riscv64], 1.0.3-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Local Aligner for Massive Biological DatA
- lambda-align2 (2.0.1-1 [amd64], 2.0.0-6 [hppa, m68k, ppc64, riscv64, sparc64], 2.0.0-5 [alpha])
- Local Aligner for Massive Biological DatA - v2
- lammps (20240207+dfsg-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 20240207+dfsg-1.1 [armhf], 20240207+dfsg-1 [hppa, sh4], 20220106.git7586adbb6a+ds1-2 [m68k], 20200303+dfsg1-3+b1 [x32], 0~20180510.gitaa1d815fe-4 [ia64])
- Molecular Dynamics Simulator
- last-align (1542-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1179-1 [x32])
- comparaison de séquences biologiques à l'échelle du génome
- lastz (1.04.22-2+b1 [riscv64], 1.04.22-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- pairwise aligning DNA sequences
- lastz-examples (1.04.22-2)
- pairwise aligning DNA sequences (examples and test scripts)
- lbt (1.2.2-7+b1 [riscv64], 1.2.2-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Convertit des formules LTL en automates Büchi
- leaff (0~20150903+r2013-8+b3)
- biological sequence library utilities and applications
- lefse (1.1.2-1)
- determine features of organisms, clades, taxonomic units, genes
- lexd (1.3.1-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4, x32], 1.3.1-1 [m68k], 1.1.0-1+b2 [hppa])
- Lexicon compiler for non-suffixational morphologies
- libadios-bin (1.13.1-36 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 1.13.1-34 [sh4], 1.13.1-6 [sparc64])
- ADIOS système flexible d'entrées-sorties — exécutables
- libadios-examples (1.13.1-36)
- exemples pour le système flexible d'entrées-sorties ADIOS
- libatlas-ecmwf-utils (0.36.0-2 [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 0.20.0-1 [alpha], 0.19.0-8+b2 [x32])
- Numerical weather prediction and climate modelling library - utilities
- libball1.5-data (1.5.0+git20180813.37fc53c-11)
- bibliothèque d'algorithmes de biochimie –⋅fichiers de données
- libbio-db-hts-perl (3.01-4+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.01-4+b2 [riscv64])
- Perl interface to the HTS library
- libbio-tools-phylo-paml-perl (1.7.3-4)
- Bioperl interface to the PAML suite
- libbio-tools-run-alignment-clustalw-perl (1.7.4-4)
- Bioperl interface to Clustal W
- libbio-tools-run-alignment-tcoffee-perl (1.7.4-3)
- Bioperl interface to T-Coffee
- libca4.14.2 (7.0.8+dfsg1-1)
- EPICS channel access client library
- libcamitk3 (3.4.0-2+b1 [sparc64], 3.4.0-2 [hppa, x32], 3.4.0-1 [alpha], 3.2.2-2 [ppc64]) [debports]
- boîte à outils d'intervention médicale assistée par ordinateur – exécutable
- libcg3-1 (1.4.6-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.4.6-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Runtime for CG-3
- libchemicaltagger-java (1.6.2-3)
- tool for semantic text-mining in chemistry
- libclblas-bin (2.6-3) [debports]
- OpenCL BLAS library (executables)
- libclblas-bin
- paquet virtuel fourni par clblas-client
- libcom3.22.0 (7.0.8+dfsg1-1)
- EPICS common library
- libdbcsr-dev (2.6.0-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2.5.0-1 [ia64], 2.3.0-1 [hppa])
- Distributed Block Compressed Sparse Row matrix library
- libdlpack-dev (0.6-1+b1 [amd64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.6-1 [alpha, arm64, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Open In Memory Tensor Structure
- libdyssol1.0 (1.1.1+ds1-2 [m68k, sh4], 1.1.1+ds1-1 [hppa, ia64, riscv64, x32]) [debports]
- Tool for dynamic flowsheet simulation. Shared libraries
- libdyssol1.0t64 (1.1.1+ds1-2.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.1.1+ds1-2.1+b1 [ppc64, sparc64], 1.1.1+ds1-2.1 [alpha])
- Tool for dynamic flowsheet simulation. Shared libraries
- libeccodes-data (2.35.0-1)
- GRIB and BUFR enecoding/encoding software library - data
- libeckit-utils (1.26.1-2 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.24.4-1 [alpha], 1.16.3-1+b1 [m68k, sh4], 1.16.3-1 [hppa, x32])
- C++ toolkit for ECMWF tools and applications - development files
- libfaiss-dev (1.8.0-1 [amd64, arm64, ia64, m68k, mips64el, ppc64el], 1.7.4-3+b1 [riscv64], 1.7.4-3 [alpha, armel, armhf, hppa, i386, ppc64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- efficient similarity search and clustering of dense vectors
- libfckit-utils (0.12.1-1)
- Library Fortran toolkit for interoperating Fortran with C/C++
- libgfsgl0 (20121130+dfsg-8 [ia64, sh4], 20121130+dfsg-7 [riscv64]) [debports]
- graphical viewer for Gerris simulation files. Shared library
- libghemical-data (3.0.0-4.4)
- Molecular Modelling Library (data files)
- libgoby-io-java (3.3.1+dfsg2-10)
- IO API for goby
- libgyoto6 (1.2.0-4+b5) [debports]
- Gyoto framework main library an standard plug-in
- libhdf5-jni (1.10.10+repack-3.3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.10.10+repack-3.1 [alpha], 1.10.10+repack-3 [sh4])
- native library used by libhdf5-java
- libideep-dev (0.0~git20230825.6f4d653-2)
- Intel's mkldnn/dnnl wrapper for pytorch
- libinchi-bin (1.03+dfsg-4+b2 [amd64], 1.03+dfsg-4+b1 [riscv64], 1.03+dfsg-4 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- International Chemical Identifier (InChI) algorithm (executable)
- libismrmrd1.3 (1.3.2-2) [debports]
- ISMRM Raw Data format (ISMRMRD) - shared library
- libjgrapht-java (1.5.2-1)
- Java library of graph theory data structures and algorithms
- libjgrapht-java
- paquet virtuel fourni par libjgrapht0.8-java
- liblammps-dev (20240207+dfsg-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 20240207+dfsg-1.1 [armhf], 20240207+dfsg-1 [hppa, sh4], 20220106.git7586adbb6a+ds1-2 [m68k], 20200303+dfsg1-3+b1 [x32])
- Molecular Dynamics Simulator (dev files)
- liblammps0 (20240207+dfsg-1 [hppa, sh4], 20220106.git7586adbb6a+ds1-2+b2 [riscv64], 20220106.git7586adbb6a+ds1-2 [m68k], 20200303+dfsg1-3+b1 [x32]) [debports]
- Molecular Dynamics Simulator (shared library)
- liblammps0t64 (20240207+dfsg-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 20240207+dfsg-1.1 [armhf])
- Molecular Dynamics Simulator (shared library)
- liblemon-utils (1.3.1+dfsg-6+b1 [riscv64], 1.3.1+dfsg-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32])
- Library for Efficient Modeling and Optimization in Networks (utilities)
- libliggghts3 (3.8.0+repack1-9+b2 [hppa, m68k, riscv64], 3.8.0+repack1-9 [sh4], 3.8.0+repack1-7 [x32]) [debports]
- Open Source DEM Particle Simulation Software. Shared library
- liblinear-tools (2.3.0+dfsg-5+b1 [riscv64], 2.3.0+dfsg-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- applications autonomes pour LIBLINEAR
- libmcpl-dev (1.3.2-3.1+b1 [riscv64], 1.3.2-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Monte Carlo Particle Lists - development files
- libmcpl1 (1.3.2-3.1+b1 [riscv64], 1.3.2-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Monte Carlo Particle Lists - library
- libmstoolkit-tools (82-7.2)
- libraries for manipulating mass spectrometry data - tools
- libncarg-bin (6.6.2.dfsg.1-6 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 6.6.2.dfsg.1-4 [alpha, hppa])
- NCAR command-language library - development tools
- libncarg-data (6.6.2.dfsg.1-6)
- NCAR command-language library - Data
- libngram-tools (1.3.2-3)
- OpenGRM n-gram Language Modeling toolkit
- libocas-tools (0.97+dfsg-8+b1 [riscv64], 0.97+dfsg-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Standalone applications implementing the OCAS solver
- libonnx-dev (1.14.1-2.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.14.1-2.1 [hppa], 1.12.0-2+b3 [alpha], 1.7.0+dfsg-2 [ia64])
- Open Neural Network Exchange (ONNX) (dev)
- libonnx-testdata (1.14.1-2.1)
- Open Neural Network Exchange (ONNX) (test data)
- libonnx1 (1.14.1-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.12.0-2+b3 [alpha], 1.7.0+dfsg-2 [ia64])
- Open Neural Network Exchange (ONNX) (libs)
- libonnx1t64 (1.14.1-2.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.14.1-2.1 [hppa])
- Open Neural Network Exchange (ONNX) (libs)
- libonnxifi (1.12.0-2+b4 [riscv64], 1.12.0-2+b3 [alpha], 1.7.0+dfsg-2 [ia64]) [debports]
- Open Neural Network Exchange (ONNX) (ONNXIFI)
- libopm-simulators-bin (2023.10+ds-3)
- Parallel porous media / reservoir simulators -- applications
- libopm-upscaling-bin (2023.10+ds-3+b1)
- Porous media upscaling tools -- applications
- liboscar4-java (5.2.0+dfsg-2)
- automated annotation of chemistry in scientific articles
- libphitsmcpl1 (1.3.2-3.1+b1 [riscv64], 1.3.2-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Monte Carlo Particle Lists - PHITS library
- libpluto-jpl-eph-dev (0.0~git20180228-1.1+b1 [riscv64], 0.0~git20180228-1.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- development files to interact with JPL ephemeres data
- libpluto-lunar-dev (0.0~git20180825.e34c1d1-1+b1 [amd64, riscv64], 0.0~git20180825.e34c1d1-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- development files for astronomical Lunar library
- libpwiz-tools (3.0.18342-4.1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.0.18342-4+b2 [alpha])
- ProteoWizard command line tools
- libqgis-customwidgets (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64])
- composants graphiques personnalisés de QGIS pour QT Designer
- libqtpropertybrowser3 (3.4.0-2+b1 [sparc64], 3.4.0-2 [hppa, x32], 3.4.0-1 [alpha], 3.2.2-2 [ppc64]) [debports]
- Qt Property Browser Library - runtime
- libsigmf (1.0.2-2+b1 [riscv64], 1.0.2-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- SigMF data format handling library
- libsilo-bin (4.11-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 4.11-3+b3 [sh4])
- Utilities to manipulate libsilo files
- libsimgrid3.11 (3.11.1-10) [debports]
- Toolkit for scalable simulation of distributed applications
- libsmiles-scripts-java (0.2.0+dfsg1-5)
- command line tools to handle SMILES descriptors - Java libraries
- libsmiles-scripts-perl (0.2.0+dfsg1-5)
- command line tools to handle SMILES descriptors - Perl libraries
- libssm-bin (1.4.0-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.4.0-2 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- macromolecular superposition library - binaries
- libssu-tools (0.10.0-3) [debports]
- high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)
- libssu-tools
- paquet virtuel fourni par unifrac-tools
- libsswmcpl1 (1.3.2-3.1+b1 [riscv64], 1.3.2-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Monte Carlo Particle Lists - SSW library
- libstxxl1 (1.3.1-5) [debports]
- C++ STL drop-in replacement for extremely large datasets
- libtorch-test (2.1.2+dfsg-2+b2 [amd64, arm64, s390x], 2.0.1+dfsg-5+b1 [ppc64el], 1.13.1+dfsg-4 [riscv64], 1.8.1-2 [hppa])
- Tensors and Dynamic neural networks in Python (Test Binaries)
- libtrexio0 (2.2.3-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.2.3-3 [sh4])
- TREX I/O library for efficient data I/O in quantum chemistry.
- libuhd4.6.0-dpdk-tests (4.6.0.0+ds1-5.1+b1)
- universal hardware driver for Ettus Research products - DPDK tests
- libvcflib-tools (1.0.9+dfsg1-3+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64], 1.0.9+dfsg1-3 [alpha], 1.0.3+dfsg-2 [ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- C++ library for parsing and manipulating VCF files (tools)
- libvdjtools-java (1.2.1+git20190311+repack-2) [non-free]
- Java library of vdjtools
- libwannier90-dev (3.1.0+ds-8)
- Maximally Localized Wannier Functions - development library
- libxgboost-dev (2.0.3-1+b1)
- Scalable and Flexible Gradient Boosting (Development)
- libxgboost-predictor-java (0.3.1+dfsg-2)
- Java implementation of XGBoost predictor for online prediction tasks
- libxgboost0 (2.0.3-1+b1)
- Scalable and Flexible Gradient Boosting (Shared lib)
- libxy-bin (1.6-3.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.6-3.1 [x32], 1.6-3 [alpha, hppa, m68k, sh4], 1.6-2 [ia64])
- xylib – utilitaires
- libyade (2024.02a-1+b2 [amd64, arm64], 2018.02b-5 [ppc64], 2018.02b-1 [x32], 2018.02a-2 [hppa], 2017.01a-9 [sparc64], 1.00.0-2 [alpha])
- plateforme pour la méthode des éléments distincts — bibliothèques
- liggghts (3.8.0+repack1-9.1+b1 [amd64, arm64, armel, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 3.8.0+repack1-9.1 [alpha, armhf, ppc64, sparc64], 3.8.0+repack1-9+b2 [hppa, m68k], 3.8.0+repack1-9 [sh4], 3.8.0+repack1-7 [x32])
- Open Source DEM Particle Simulation Software.
- lighter (1.1.2-7+b1 [riscv64], 1.1.2-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- fast and memory-efficient sequencing error corrector
- litl-tools (0.1.9-13+b1 [riscv64], 0.1.9-13 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Lightweight Trace Library - tools
- loki (2.4.7.4-10+b1 [riscv64], 2.4.7.4-10 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- analyse de déséquilibre de liaison avec des chaînes de Markov
- looktxt (1.4.1-3+b1 [riscv64], 1.4.1-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- conversion de fichier de format libre en format de données scientifiques
- looptools (2.16-1+b1 [riscv64], 2.16-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- évaluation d’intégrale de diagramme de Feynman à une boucle
- lorene (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1.3)
- framework for numerical relativity
- lorene-codes-src (0.0.0~cvs20161116+dfsg-1.3)
- source files of LORENE-based codes
- ltrsift (1.0.2-10)
- post-traitement et classification de rétrotransposons LTR
- lttoolbox-dev (3.7.6-1)
- Development tools and library for lttoolbox
- lucy (1.20-4)
- DNA sequence quality and vector trimming tool
- lumpy-sv (0.3.1+dfsg-7+b2 [riscv64], 0.3.1+dfsg-7+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, sh4, x32], 0.3.1+dfsg-1 [hppa, ppc64, sparc64])
- general probabilistic framework for structural variant discovery
- lumpy-sv-examples (0.3.1+dfsg-7)
- cadriciel probabiliste générique pour la découverte de variations structurelles – données
- lutefisk (1.0.7+dfsg-7+b1 [riscv64], 1.0.7+dfsg-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- interprétation de novo d’un spectre de CID de peptide
- lxi-tools (2.7-1+b2 [riscv64], 2.7-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.7-1 [hppa], 2.1-1 [alpha])
- interface logicielle pour LXI (LAN eXtensions for Instrumentation)
- macs (3.0.1-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 2.2.9.1-1+b1 [alpha, hppa, ppc64, sparc64], 2.2.9.1-1 [x32], 2.2.6-3+b1 [ia64])
- analyse basée sur modèles de ChIP-Seq venant de séquenceurs de lectures courtes
- macsyfinder (2.1.3-1)
- detection of macromolecular systems in protein datasets
- maffilter (1.3.1+dfsg-6)
- process genome alignment in the Multiple Alignment Format
- maffilter-examples (1.3.1+dfsg-6)
- process genome alignment in the Multiple Alignment Format (example data)
- mafft (7.505-1+b1 [riscv64], 7.505-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- programme d'alignement multiple pour des séquences de nucléotides ou d'acides aminés
- malt (0.5.2-3)
- sequence alignment and analysis tool to process sequencing data
- mandelbrot-solver (3.2.1-10.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 3.2.1-10.1 [ia64, sh4, sparc64])
- Solver for Mandelbrot polynomials based on MPSolve
- mapdamage (2.2.1+dfsg-3)
- tracking and quantifying damage patterns in ancient DNA sequences
- mapsembler2 (2.2.4+dfsg1-4 [amd64, arm64, ppc64el, s390x], 2.2.3+dfsg-1 [alpha, hppa, ppc64, x32], 2.1.6+dfsg-1 [m68k, sh4, sparc64])
- bioinformatics targeted assembly software
- maq (0.7.1-9+b1 [riscv64], 0.7.1-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- correspondance de lectures de séquences d'ADN polymorphique de longueur courte à des séquences de référence
- maqview (0.2.5-11+b1 [riscv64], 0.2.5-11 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- graphical read alignment viewer for short gene sequences
- mash (2.3+dfsg-6+b1 [riscv64], 2.3+dfsg-6 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 2.2.2+dfsg-1+b1 [hppa, m68k, sh4, sparc64, x32])
- estimation rapide de distance entre génomes et métagénomes utilisant MinHash
- massxpert (8.3.0-1 [all], 7.0.0-2 [ppc64, riscv64, sparc64], 6.0.3-1 [alpha, m68k, sh4, x32])
- paquet de transition pour massxpert -> massxpert2
- massxpert-data (7.0.0-2)
- modélisation pour la chimie des polymères et simulation de données de spectrométrie de masse – données
- massxpert2 (8.3.0-1+b1 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 8.3.0-1 [armel, armhf])
- polymer chemistry modelling and mass spectrometry data simulation (runtime)
- massxpert2-data (8.3.0-1)
- polymer chemistry modelling and mass spectrometry data simulation (data)
- matlab-brain2mesh (0.7.9-3) [contrib]
- automated brain tetrahedral mesh generation toolbox for MATLAB
- matlab-gdf (0.1.3-11.1) [contrib]
- IO library for the GDF -- Matlab interface
- matlab-iso2mesh (1.9.6+ds-10) [contrib]
- 3D surface and volumetric mesh generator for MATLAB
- matlab-jnifti (0.6-3) [contrib]
- fast NIfTI-1/2 reader and NIfTI-to-JNIfTI converter for MATLAB
- matlab-jsonlab (2.9.8-1) [contrib]
- native JSON/UBJSON/MassagePack encoder/decoder for MATLAB
- matlab-zmat (0.9.9+ds.1-2) [contrib]
- in-memory data compression for MATLAB
- maude (3.4-1 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.2-2 [alpha, m68k], 3.1-2 [x32], 2.7-2+b1 [hppa, sh4])
- cadriciel logique de haute performance
- mauve-aligner (2.4.0+4736-6)
- multiple genome alignment
- mayavi2 (4.8.1-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 4.8.0-2 [m68k], 4.7.1-2+b1 [x32])
- paquet de visualisation scientifique de données 2D ou 3D
- mbdyn (1.7.3-1)
- code pour l’analyse multicorps
- mbpoll (1.4.11+dfsg-2+b1 [riscv64], 1.4.11+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32])
- command line utility to communicate with ModBus slave (RTU or TCP)
- mbt (3.6-3.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 3.6-3.1 [sh4])
- générateur d’étiquetage basé sur la mémoire et étiqueteur
- mbtserver (0.14-2.1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.14-2.1 [sh4])
- extensions de serveur pour l’étiqueteur MBT
- mcaller (1.0.3+git20210624.b415090-3)
- recherche de méthylation dans les lectures de nanopore
- mcpl (1.3.2-3.1+b1 [riscv64], 1.3.2-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Monte Carlo Particle Lists - libraries and tools
- mecat2 (0.0+git20200428.f54c542+ds-4)
- ultra-fast and accurate de novo assembly tools for SMRT reads
- meep (1.25.0-2+b3 [armel, armhf], 1.25.0-2+b2 [riscv64], 1.25.0-2+b1 [alpha, amd64, arm64, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.25.0-2 [hppa, sh4], 1.12.0-3 [x32], 1.7.0-3 [ia64])
- paquet logiciel pour la simulation FDTD
- meep-mpi-default (1.25.0-2+b3 [riscv64], 1.25.0-2+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.25.0-2 [hppa, ia64, sh4, x32])
- paquet logiciel pour la simulation FDTD – autre version (OpenMPI)
- meep-openmpi (1.25.0-2+b3 [riscv64], 1.25.0-2+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.25.0-2 [hppa, ia64, sh4, x32])
- software package for FDTD simulation, parallel (OpenMPI) version
- megadepth (1.2.0-4+b2 [riscv64], 1.2.0-4+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- computes coverage from BigWig and BAM sequencing files
- megahit (1.2.9-5)
- ultra-fast and memory-efficient meta-genome assembler
- megan-ce (6.21.1+dfsg-3)
- interactive tool to explore and analyse microbiome sequencing data
- melting (5.2.0-2)
- calcule la température de fusion de duplex d'acide nucléique
- merkaartor (0.19.0+ds-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 0.19.0+ds-5 [armhf, hppa], 0.19.0+ds-3+b1 [x32], 0.18.4+ds-5+b1 [m68k, sh4])
- éditeur de carte pour OpenStreetMap.org
- meryl (0~20150903+r2013-8+b3)
- in- and out-of-core kmer counting and utilities
- metabat (2.15-4+b1)
- robust statistical framework for reconstructing genomes from metagenomic data
- metaeuk (6-a5d39d9+ds-5)
- sensitive, high-throughput gene discovery and annotation for metagenomics
- metaeuk-examples (6-a5d39d9+ds-5)
- optional resources for the metaeuk package
- metaphlan (4.0.4-1)
- Metagenomic Phylogenetic Analysis
- metaphlan2-data (2.6.0+ds-4)
- paquet de données pour l’analyse phylogénétique métagénomique
- metastudent (2.0.1-9)
- predictor of Gene Ontology terms from protein sequence
- metastudent-data (2.0.1-8)
- predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data files
- metastudent-data-2 (1.0.0-6)
- predictor of Gene Ontology terms from protein sequence - data #2
- metview (5.21.2-1+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el], 5.7.0-1 [hppa], 5.6.1-3 [m68k], 5.3.0-3 [ppc64, riscv64], 5.3.0-1 [sh4], 5.0.0~beta.1-1+b1 [alpha], 4.9.1-1 [sparc64])
- visualisation des données et environnement d’analyse interactifs
- metview-data (5.21.2-1)
- données nécessaires à l’environnement d’analyse de données, Metview
- mhap (2.1.3+dfsg-3)
- locality-sensitive hashing to detect long-read overlaps
- mia-doctools (2.4.7-13)
- Helper scripts for run-time document creation
- mia-tools (2.4.7-13+b4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.4.7-13+b1 [hppa, m68k, sh4], 2.4.7-1+b2 [x32])
- outils en ligne de commande pour le traitement d’images en échelle de gris
- mialmpick (0.2.15-2+b2 [riscv64], 0.2.15-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outils pour le choix de points de repère dans des ensembles de données de volumes en 3D
- microbegps (1.0.0-6)
- outil d’investigation pour le profilage taxonomique de données métagénomiques
- microbiomeutil (20101212+dfsg1-6)
- utilitaires d'analyse de microbiome
- microbiomeutil-data (20101212+dfsg1-6)
- Reference 16S sequences and NAST-alignments used by microbiomeutil tools
- microhope (5.3.1+repack-6 [all], 4.4.3+dfsg-1 [ia64])
- cadriciel matériel et logiciel pour apprendre les microcontrôleurs
- minc-tools (2.3.00+dfsg-10+b2 [riscv64], 2.3.00+dfsg-10+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 2.3.00+dfsg-10 [sh4])
- Outils pour le format MNI d'imagerie médicale
- mindthegap (2.3.0-3+b1 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 2.3.0-1 [hppa])
- détection et assemblage de variantes d’insertion d’ADN dans les ensembles de lectures NGS
- mindthegap-examples (2.3.0-3)
- optional scripts and example resources for mindthegap
- minexpert2 (9.3.1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 8.2.0-1 [alpha, m68k, sh4, x32])
- visualisation et fouille de données de spectrométrie de masse MS^n – exécutable
- minia (3.2.6-4+b1 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64, x32], 3.2.6-2 [hppa], 1.6906-2 [m68k, sh4])
- short-read biological sequence assembler
- miniasm (0.3+dfsg-4+b1 [riscv64], 0.3+dfsg-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- assembleur de novo très rapide pour des lectures longues de séquences d’ADN bruitées
- minicondor (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- distributed workload management system - single node configuration
- minihtcondor (23.4.0+dfsg-1+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 23.4.0+dfsg-1+b2 [ppc64], 23.4.0+dfsg-1 [alpha, m68k, sh4, sparc64, x32])
- transitional dummy package
- minimac4 (4.1.6-1)
- Fast Imputation Based on State Space Reduction HMM
- minimap (0.2-8+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.2-8 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- correspondances approximatives de longues séquences biologiques telles que les lectures d’ADN
- minimap2 (2.27+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.26+dfsg-1 [alpha], 2.24+dfsg-3+b2 [hppa, sh4], 2.24+dfsg-3+b1 [ia64], 2.24+dfsg-2+b1 [x32])
- versatile pairwise aligner for genomic and spliced nucleotide sequences
- minisat (1:2.2.1-8)
- solveur SAT rapide et léger
- minisat+ (1.0-4+b1 [riscv64], 1.0-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- solveur de contraintes pseudo booléennes
- minisat2 (1:2.2.1-5+b1) [debports]
- paquet de transition pour minisat
- minisat2
- paquet virtuel fourni par minisat
- mipe (1.1-9)
- Outil de sauvegarde de données dérivées de PCR
- mira-assembler (4.9.6-11)
- assembleur de séquences génomiques exprimées utilisant la méthode globale
- mira-rfam-12s-rrna (4.9.6-11)
- extract of RFAM 12 rRNA database
- mirtop (0.4.25-5)
- annotate miRNAs with a standard mirna/isomir naming
- missfits (2.8.0-5+b1 [riscv64], 2.8.0-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Basic maintenance and packaging tasks on FITS files
- mitools (2.0.5-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 2.0.5-5 [alpha, hppa, sh4], 2.0.5-3 [m68k], 2.0.2-0.3 [sparc64])
- visualisation, conversion et opérations basiques pour des données d’images médicales
- mldemos (0.5.1+git.1.ee5d11f-4+b1 [amd64], 0.5.1+git.1.ee5d11f-4 [alpha, arm64, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.5.1+git.1.ee5d11f-1 [sh4, sparc64])
- MLDemos (Machine Learning Demos) avec visualisation
- mlpack-bin (4.3.0-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 3.4.2-7 [hppa], 3.2.2-3 [x32], 3.2.2-1 [ia64])
- intuitive, fast, scalable C++ machine learning library (binaries)
- mlv-smile (1.47-8+b1 [riscv64], 1.47-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Find statistically significant patterns in sequences
- mmb (4.0.0+dfsg-3.1+b1 [amd64, arm64], 4.0.0+dfsg-3 [armhf])
- model the structure and dynamics of macromolecules
- mmb-common (4.0.0+dfsg-3.1)
- model the structure and dynamics of macromolecules (common files)
- mmmulti (0.1-3)
- memory backed multimap
- mmseqs2 (15-6f452+ds-2+b1 [riscv64], 15-6f452+ds-2 [amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el], 12-113e3+ds-3+b1 [alpha, sh4, x32], 12-113e3+ds-2+b1 [hppa, m68k, ppc64], 11-e1a1c+ds-4 [sparc64])
- recherche et partitionnement de protéines ultra rapide et sensible
- mmseqs2-examples (15-6f452+ds-2)
- optional resources for the mmseqs2 package
- mocassin (2.02.73.2-1+b1 [m68k, riscv64], 2.02.73.2-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- MOnte CArlo SimulationS of Ionised Nebulae
- mocassin-benchmarks (2.02.73.2-1)
- benchmarks for the photoionisation code MOCASSIN
- mocassin-data (2.02.73.2-1)
- atomic and optical data for the photoionisation code MOCASSIN
- mocassin-examples (2.02.73.2-1)
- Examples for the photoionisation code MOCASSIN
- molds (0.3.1-1+b11 [amd64, arm64, armhf, i386, ppc64], 0.3.1-1+b10 [ppc64el], 0.3.1-1+b6 [mips64el, s390x, sparc64], 0.3.1-1+b2 [riscv64])
- Semi-empirical electronic structure and molecular dynamics
- molequeue (0.9.0-1+b3 [amd64], 0.9.0-1+b2 [riscv64], 0.9.0-1+b1 [arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 0.9.0-1 [alpha, m68k, x32])
- intégration dans le bureau de ressources informatiques de haute performance
- mona (1.4-18-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.4-18-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- démonstration automatique de théorèmes
- montage (6.0+dfsg-9)
- Toolkit for assembling FITS images into mosaics
- montage-gridtools (6.0+dfsg-9)
- Create files to run montage on the grid
- mopac (22.1.1-2)
- Molecular Orbital PACkage (MOPAC)
- mopac7-bin (1.15-6+b4 [mips64el], 1.15-6+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, s390x], 1.15-6+b2 [alpha, hppa, m68k, sh4, sparc64, x32], 1.15-6+b1 [ia64, riscv64])
- bibliothèque de chimie quantique semi-empirique – fichiers binaires
- mosdepth (0.3.6+ds-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64], 0.3.3+ds-1 [sparc64])
- calcul de couverture BAM/CRAM de séquençage biologique
- mosdepth-examples (0.3.6+ds-1)
- données de test pour mosdepth
- mothur (1.48.0-2+b2 [riscv64], 1.48.0-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- ensemble pour analyse de séquences pour la recherche sur le microbiome
- mpb (1.11.1-5.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.11.1-5 [ia64, sh4, x32])
- Photonic-Bands du MIT
- mpb-mpi (1.11.1-5.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.11.1-5 [ia64, sh4, x32])
- programme Photonic-Bands du MIT, version parallèle (mpich)
- mpb-scm (1.11.1-5.1)
- programme Photonic-Bands du MIT – fichiers d’initialisation
- mpgrafic (0.3.19-1+b4 [s390x], 0.3.19-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el], 0.3.19-1+b2 [alpha, hppa, ppc64, riscv64, sparc64, x32], 0.3.19-1+b1 [ia64, sh4])
- MPI version of N-body initial conditions grafic package
- mpqc (2.3.1-22+b2 [riscv64], 2.3.1-22+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.3.1-22 [alpha, hppa, sh4, x32], 2.3.1-21 [ia64])
- programme de chimie quantique massivement parallèle
- mpqc-support (2.3.1-22+b2 [riscv64], 2.3.1-22+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.3.1-22 [alpha, hppa, sh4, x32], 2.3.1-21 [ia64])
- Massively Parallel Quantum Chemistry – outils d’assistance
- mpqc3 (0.0~git20170114-4.1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el], 0.0~git20170114-4 [alpha])
- Massively Parallel Quantum Chemistry Program
- mpqc3-data (0.0~git20170114-4.1)
- programme de chimie quantique massivement parallèle – fichiers de données
- mpsolve (3.2.1-10.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 3.2.1-10.1 [ia64, sh4, sparc64])
- résolveur de polynômes multiprécision – version en ligne de commande
- mptp (0.2.4-3+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.2.4-3+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32], 0.2.3-1 [ppc64])
- single-locus species delimitation
- mrbayes (3.2.7a-7+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.2.7a-7 [x32], 3.2.6+dfsg-1+b3 [alpha], 3.2.6+dfsg-1 [sh4])
- Bayesian Inference of Phylogeny
- mrbayes-mpi (3.2.7a-7+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.2.7a-7 [x32], 3.2.6+dfsg-1+b3 [alpha], 3.2.6+dfsg-1 [sh4])
- inférence bayésienne de phylogenèse – version MPI
- mricron (1.2.20211006+dfsg-5 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el], 0.20140804.1~dfsg.1-4 [ppc64])
- conversion, visualisation et analyse d’images de résonance magnétique
- mricron-data (1.2.20211006+dfsg-5)
- data files for MRIcron
- mrpt-apps (1:2.12.0+ds-1.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 1:2.11.6+ds-1 [m68k], 1:2.10.1+ds-2 [hppa], 1:2.1.4-1 [alpha], 1:1.5.8-1+b1 [x32], 1:1.4.0-7 [sparc64], 1:0.9.5svn2563-1 [sh4])
- boîte à outils pour la programmation robotique – applications graphiques et console
- mrpt-common (1:2.12.0+ds-1.1)
- boîte à outils pour la programmation robotique – exemples de fichier et d’ensembles de données
- mrpt-libs (1:0.9.5svn2563-1) [debports]
- Mobile Robot Programming Toolkit - All the libraries
- mrtrix3 (3.0.4-1+b1 [amd64, arm64], 3.0~rc3+git135-g2b8e7d0c2-3 [x32])
- tractographie de la substance blanche par IRM pondérée en diffusion
- mseed2sac (2.3+ds1-1+b1 [riscv64], 2.3+ds1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Convert MiniSEED time series data to SAC
- mssstest (3.0-7) [non-free]
- Normalisation of disease scores for patients with Multiple Sclerosis
- multiqc (1.18+dfsg-1)
- output integration for RNA sequencing across tools and samples
- mumax3 (3.10-8) [contrib]
- GPU-accelerated micromagnetic simulator
- mummer (3.23+dfsg-8+b1 [riscv64], 3.23+dfsg-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Alignement de séquence efficace de génomes complets
- munipack (0.6.1-1)
- Astronomical photometry software package
- munipack-cli (0.6.1-1+b8 [armhf], 0.6.1-1+b7 [armel], 0.6.1-1+b6 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 0.6.1-1+b4 [alpha, riscv64], 0.6.1-1+b3 [sh4, sparc64], 0.6.1-1 [m68k], 0.6.0-1 [x32], 0.5.14-2 [hppa], 0.5.11-2.1 [ia64])
- Command line interface of Munipack
- munipack-core (0.6.1-1+b8 [armhf], 0.6.1-1+b7 [armel], 0.6.1-1+b6 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 0.6.1-1+b4 [alpha, riscv64], 0.6.1-1+b3 [sh4, sparc64], 0.6.1-1 [m68k], 0.6.0-1 [x32], 0.5.14-2 [hppa], 0.5.11-2.1 [ia64])
- Core routines of Munipack
- munipack-gui (0.6.1-1+b8 [armhf], 0.6.1-1+b7 [armel], 0.6.1-1+b6 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 0.6.1-1+b4 [alpha, riscv64], 0.6.1-1+b3 [sh4, sparc64], 0.6.1-1 [m68k], 0.6.0-1 [x32], 0.5.14-2 [hppa], 0.5.11-2.1 [ia64])
- interface graphique pour Munipack
- murasaki (1.68.6-13+b5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, x32], 1.68.6-13+b4 [ppc64el, s390x], 1.68.6-13+b3 [riscv64, sh4], 1.68.6-11 [sparc64])
- homology detection tool across multiple large genomes
- murasaki-common (1.68.6-13)
- homology detection tool across multiple large genomes (common files)
- murasaki-mpi (1.68.6-13+b5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, x32], 1.68.6-13+b4 [ppc64el, s390x], 1.68.6-13+b3 [riscv64, sh4], 1.68.6-11 [sparc64])
- homology detection tool across multiple large genomes (MPI-version)
- muscle (1:5.1.0-1+b1 [riscv64], 1:5.1.0-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x])
- programme d'alignements multiples de séquences de protéine
- muscle3 (3.8.1551-3)
- multiple alignment program of protein sequences
- music-bin (1.2.1-0.3+b1 [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.2.1-0.3 [armel, armhf], 1.2.1-0.2 [hppa, m68k, sh4], 1.1.16-1.1+b2 [ia64])
- Multi-Simulation Coordinator for MPI -- Utilities
- mustang (3.2.4-1+b1 [riscv64], 3.2.4-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- alignement structurel multiple de protéines
- mustang-testdata (3.2.4-1)
- alignements structuraux multiples de protéines – données de test
- nanolyse (1.2.0-4+b1 [riscv64], 1.2.0-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- remove lambda phage reads from a fastq file
- nanook (1.33+dfsg-5)
- pre- and post-alignment analysis of nanopore sequencing data
- nanook-examples (1.33+dfsg-5)
- pre- and post-alignment analysis of nanopore sequencing data (examples)
- nanopolish (0.14.0-1+b2 [riscv64], 0.14.0-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, x32], 0.14.0-1 [sh4], 0.13.3-2 [ppc64], 0.5.0-1+b1 [sparc64])
- identification de consensus pour les données de séquençage par nanopore
- nanostat (1.4.0-3)
- statistics on long biological sequences
- nanosv (1.2.4+git20190409.c1ae30c-6)
- structural variant caller for nanopore data
- nast-ier (20101212+dfsg1-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 20101212+dfsg1-3 [m68k])
- NAST-based DNA alignment tool
- nastran (0.1.95-2) [non-free]
- NASA Structural Analysis System
- nautic (1.5-6+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.5-6+b3 [riscv64], 1.5-6+b2 [alpha, hppa, sh4], 1.5-6 [ia64, m68k, x32])
- calcul de la position de l’observateur en navigation astronomique
- ncbi-acc-download (0.2.8-2)
- download genome files from NCBI by accession
- ncbi-blast+ (2.12.0+ds-4+b2 [riscv64], 2.12.0+ds-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.12.0+ds-4 [alpha])
- suite d'outils de recherche de séquences BLAST de dernière génération
- ncbi-blast+-legacy (2.12.0+ds-4)
- script d’appel de legacy de BLAST du NCBI
- ncbi-cn3d (3.0.20170106+dfsg2-2)
- afficheur en trois dimensions de molécules biologiques
- ncbi-entrez-direct (19.2.20230331+dfsg-3+b1 [riscv64], 19.2.20230331+dfsg-3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 7.40.20170928+ds-1 [alpha, ppc64, sparc64], 6.90.20170705+ds-2 [hppa, m68k, sh4, x32])
- NCBI Entrez utilities on the command line
- ncbi-epcr (2.3.12-1-9+b1 [riscv64], 2.3.12-1-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outil pour vérifier la présence d'un marqueur dans une séquence d'ADN
- ncbi-rrna-data (6.1.20170106+dfsg2-2)
- grandes bases de données BLAST d'ARN ribosomique distribuées avec le kit de développement du NCBI
- ncbi-seg (0.0.20000620-6+b1 [riscv64], 0.0.20000620-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- tool to mask segments of low compositional complexity in amino acid sequences
- ncbi-tools-bin (6.1.20170106+dfsg2-2)
- bibliothèques du NCBI pour applications de biologie –⋅utilitaires en mode texte
- ncbi-tools-x11 (6.1.20170106+dfsg2-2)
- bibliothèques du NCBI pour applications de biologie –⋅utilitaires⋅X
- ncl-ncarg (6.6.2.dfsg.1-6 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 6.6.2.dfsg.1-4 [alpha, hppa])
- NCAR Command Language and NCAR graphics
- ncl-tools (2.1.21+git20210811.b1213a7-5+b1 [riscv64], 2.1.21+git20210811.b1213a7-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outil pour traiter avec les fichiers NEXUS
- nco (5.2.4-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 5.2.3-1 [alpha], 5.2.1-1 [sh4], 4.7.8-1 [hppa], 4.6.3-1 [x32])
- opérateurs en ligne de commandes pour analyser des fichiers netCDF
- ncoils (2002-9+b1 [riscv64], 2002-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- prédiction de structure secondaire de superhélice
- ncview (2.1.8+ds-5+b2 [riscv64], 2.1.8+ds-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 2.1.8+ds-5 [sh4])
- navigateur graphique X11 pour les fichiers au format NetCDF
- neat (2.3.2-2+b3 [amd64, armel, i386, mips64el, s390x], 2.3.2-2+b2 [alpha, arm64, armhf, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4, sparc64, x32])
- Nebular Empirical Analysis Tool – outil d’analyse empirique de nébuleuse
- neobio (0.0.20030929-6)
- calcul d'alignements de séquences d'acides aminés et de nucléotides
- netcdf-bin (1:4.9.2-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1:4.9.2-5 [hppa, m68k], 1:4.9.2-3 [sh4])
- Programmes pour lire et écrire des fichiers NetCDF
- neurodebian (0.42.1)
- neuroscience-oriented distribution - repository configuration
- neurodebian-archive-keyring (0.42.1)
- distribution orientée neurosciences – clés GnuPG d’archive
- neurodebian-desktop (0.42.1)
- neuroscience-oriented distribution - desktop integration
- neurodebian-dev (0.42.1)
- neuroscience-oriented distribution - development tools
- neurodebian-freeze (0.42.1)
- outil nd_freeze pour geler les sources APT à utiliser dans des instantanés
- neurodebian-popularity-contest (0.42.1)
- neuroscience-oriented distribution - popcon integration
- neuron (8.2.2-6+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 7.6.3-4 [x32])
- environnement de simulation pour des modèles de calcul de neurones
- neuron-dev (8.2.2-6+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 7.6.3-4 [x32])
- Neuron simulation environment - Development files
- nexus-tools (4.4.3-6+b2 [riscv64], 4.4.3-6+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 4.4.3-6 [sh4])
- NeXus scientific data file format - applications
- ngmlr (0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.2.7+git20210816.a2a31fb+dfsg-2 [alpha, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- CoNvex Gap-cost alignMents for Long Reads
- nim-kexpr-dev (0.0.2-3)
- kexpr math expressions for nim
- nim-lapper-dev (0.1.7-5)
- simple, fast interval searches for nim
- njplot (2.4-9+b2 [riscv64], 2.4-9+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- programme de dessin d’arbre phylogénétique
- nmodl (0.6-2+b1)
- Code generation engine for the NEURON modeling language
- norsnet (1.0.17-7)
- tool to identify unstructured loops in proteins
- norsp (1.0.6-7)
- predictor of non-regular secondary structure
- nrn-mod2c (0.9+git220919-2+b1 [riscv64], 0.9+git220919-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- NMODL to C converter for CoreNEURON
- ntcard (1.2.2+dfsg-8 [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 1.2.2+dfsg-4 [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32])
- Streaming algorithm to estimate cardinality in genomics datasets
- nthash (2.3.0+dfsg-1+b1 [riscv64], 2.3.0+dfsg-1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el], 2.2.0-2 [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32])
- Methods to evaluate runtime and uniformity tests for hashing methods
- numdiff (5.9.0-1+b1 [amd64, riscv64], 5.9.0-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- comparaison de fichiers similaires avec des champs numériques
- nutsqlite (2.0.6-4)
- Dietary nutrition analysis software
- nwchem (7.2.2-2)
- logiciel de calcul de haute performance pour la chimie numérique – MPI par défaut
- nwchem-data (7.2.2-2)
- High-performance computational chemistry software (data files)
- nwchem-mpich (7.2.2-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 7.2.2-1 [alpha], 7.2.1-3 [x32])
- High-performance computational chemistry software (MPICH build)
- nwchem-openmpi (7.2.2-2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 7.2.2-1 [alpha], 7.2.1-3 [x32])
- High-performance computational chemistry software (OpenMPI build)
- nxtrim (0.4.3+dfsg-3+b1 [riscv64], 0.4.3+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Optimized trimming of Illumina mate pair reads
- oar-common (2.5.10-2)
- paquet commun pour l’ordonnanceur OAR
- oar-node (2.5.10-2)
- OAR batch scheduler node package
- oar-server (2.5.10-2)
- OAR batch scheduler server package
- oar-server-mysql (2.5.10-2)
- OAR batch scheduler MySQL server backend package
- oar-server-pgsql (2.5.10-2)
- OAR batch scheduler PostgreSQL server backend package
- oar-user (2.5.10-2)
- OAR batch scheduler user package
- oar-user-mysql (2.5.10-2)
- OAR batch scheduler MySQL user backend package
- oar-user-pgsql (2.5.10-2)
- OAR batch scheduler PostgreSQL user backend package
- oar-web-status (2.5.10-2)
- OAR batch scheduler visualization tool package
- objcryst-fox (2022.1-1+b5 [amd64, arm64, ppc64, ppc64el, s390x], 2022.1-1+b3 [riscv64], 1.9.6.0-2.2 [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32])
- FOX – Free Objects for Xtallography
- occt-draw (7.6.3+dfsg1-7.1)
- Open CASCADE Technology command interpreter and graphical test system
- oce-draw (0.18.3-2+b1) [debports]
- OpenCASCADE Community Edition CAE platform shared library
- octave-bart (0.9.00-2)
- liaisons Octave pour BART
- octave-biosig (2.6.0-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.6.0-1+b1 [ppc64, sparc64], 2.6.0-1 [alpha, sh4], 2.5.0-1+b2 [hppa], 2.5.0-1+b1 [m68k], 2.4.0-2 [x32])
- liaisons Octave à la bibliothèque BioSig
- octave-brain2mesh (0.7.9-3)
- automated brain tetrahedral mesh generation toolbox for Octave
- octave-gdf (0.1.3-11.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 0.1.3-11+b2 [sh4], 0.1.3-11+b1 [hppa, m68k], 0.1.3-11 [x32])
- bibliothèque IO pour GDF – interface pour Octave
- octave-iso2mesh (1.9.6+ds-10)
- 3D surface and volumetric mesh generator for Octave
- octave-jnifti (0.6-3)
- lecteur rapide NIfTI-1/2 et convertisseur NIfTI vers JNIfTI
- octave-jsonlab (2.9.8-1)
- native JSON/UBJSON/MassagePack encoder/decoder for Octave
- octave-psychtoolbox-3 (3.0.19.9.dfsg1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.0.19.5.dfsg1-1 [alpha], 3.0.18.12.dfsg1-1.1 [hppa, m68k, sh4], 3.0.18.9.dfsg1-1 [x32])
- toolbox for vision research -- Octave bindings
- octave-zmat (0.9.9+ds.1-2 [amd64, i386], 0.9.8+ds-8+b1 [arm64, armel, armhf, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.9.8+ds-8 [alpha, hppa, m68k, ppc64, sh4, sparc64], 0.9.8+ds-7 [x32])
- in-memory data compression for Octave
- octomap-tools (1.9.7+dfsg-3.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.9.7+dfsg-3.1 [alpha, hppa, m68k, sh4])
- Tools for 3D occupancy grid mapping
- octovis (1.9.7+dfsg-3.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.9.7+dfsg-3.1 [alpha, hppa, m68k, sh4])
- outil de visualisation pour OctoMap
- odil (0.12.2-4.1)
- C++11 library for the DICOM standard (application)
- odin (2.0.5-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 2.0.5-5 [alpha, hppa, sh4], 2.0.5-3 [m68k], 2.0.2-0.3 [sparc64])
- développement, simulation et exécution de séquences de résonance magnétique
- ogdi-bin (4.1.1+ds-3+b1)
- bibliothèque OGDI ( interface de magasins de données géographiques libre) – utilitaires
- ompl-plannerarena (1.5.2+ds1-1.1)
- Open Motion Planning Library (OMPL) plannerarena
- ont-fast5-api (4.1.1+dfsg-3+b2 [riscv64], 4.1.1+dfsg-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, sh4], 4.1.1+dfsg-3 [x32], 4.1.1+dfsg-2 [ia64], 4.0.2+dfsg-1+b1 [hppa])
- simple interface to HDF5 files of the Oxford Nanopore .fast5 file format
- open3d-gui (0.18.0+ds-3.1 [all], 0.17.0+ds-6 [riscv64], 0.15.1+ds-6 [x32])
- Transitional dummy package for open3d-viewer
- open3d-tools (0.18.0+ds-3.1+b1 [amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, s390x], 0.18.0+ds-3 [armel, armhf], 0.17.0+ds-6 [riscv64], 0.15.1+ds-6 [x32])
- Library for 3D data processing - tools
- open3d-viewer (0.18.0+ds-3.1+b1 [amd64, arm64, i386, ppc64, ppc64el, s390x], 0.18.0+ds-3 [armel, armhf])
- Library for 3D data processing - viewer GUI
- open3d-viewer-data (0.18.0+ds-3.1)
- Library for 3D data processing - viewer GUI resources
- openbabel (3.1.1+dfsg-9+b8 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 3.1.1+dfsg-9+b5 [riscv64], 3.1.1+dfsg-9+b4 [alpha, hppa], 3.1.1+dfsg-9+b1 [m68k, x32], 3.1.1+dfsg-9 [ia64, sh4])
- boîte à outils de chimie – interface en ligne de commande
- openbabel-gui (3.1.1+dfsg-9+b8 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 3.1.1+dfsg-9+b5 [riscv64], 3.1.1+dfsg-9+b4 [alpha, hppa], 3.1.1+dfsg-9+b1 [m68k, x32], 3.1.1+dfsg-9 [ia64, sh4])
- boite à outils logicielle dans le domaine de la chimie − interface graphique
- opendrop (3.3.1-6+b2 [armel, armhf], 3.3.1-6+b1 [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.3.1-6 [m68k], 3.3.1-5 [hppa])
- fully-featured pendant drop tensiometry software
- openfoam (1912.200626-2+b5 [mips64el], 1912.200626-2+b3 [amd64, arm64, armhf, hppa, i386, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1912.200626-1+b1 [alpha], 1912.200626-1 [m68k])
- Open source toolbox for Computational Fluid Dynamics (CFD) - binaries
- openfoam-examples (1912.200626-2)
- Open source toolbox for Computational Fluid Dynamics (CFD) - examples
- openmolcas (23.10-1+b2 [riscv64], 23.10-1+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, s390x], 23.10-1 [ppc64], 22.02-6 [sparc64])
- Quantum chemistry software package
- openmolcas-data (23.10-1)
- Quantum chemistry software package (data files)
- openmotor (0.5.0-2)
- simulateur de balistique intérieure pour l’expérimentation des moteurs-fusées
- openms (2.6.0+cleaned1-4)
- package for LC/MS data management and analysis
- openms-common (2.6.0+cleaned1-4)
- package for LC/MS data management and analysis - shared data
- openmx (3.8.5+dfsg1-1)
- paquet de simulations nanométriques
- openmx-data (3.8.5+dfsg1-1)
- package for nano-scale material simulations (data)
- openrocket (15.03.6) [contrib]
- Model Rocket Simulator
- openstructure (2.5.0-1+b2 [alpha, amd64, mips64el], 2.5.0-1+b1 [sh4], 2.3.1-9+b1 [m68k], 2.1.0-1 [x32])
- cadriciel de calcul libre pour la bioinformatique structurale
- openturns-common (1.21.1-4)
- generic tool to treat and quantify uncertainties (common files)
- openturns-examples (1.14-1 [sh4], 1.10-5+b2 [sparc64], 1.10-5 [x32]) [debports]
- examples of OpenTURNS functionalities
- openuniverse (1.0beta3.1+dfsg-7.1+b2 [riscv64], 1.0beta3.1+dfsg-7.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sh4], 1.0beta3.1+dfsg-7.1 [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32])
- simulateur d'univers 3D
- openuniverse-common (1.0beta3.1+dfsg-7.1)
- fichiers de données du simulateur en 3D de l’univers
- optgeo (2.25-4)
- simulateur d'optique géométrique
- opticalraytracer (9.6-4)
- Virtual lens/mirror design workshop
- optimir (1.2-1)
- Integrating genetic variations in miRNA alignment
- origami (1.2.7+really0.7.4-1.1)
- command-line management tool for Folding @ Home clients
- orthanc (1.12.3+dfsg-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.12.2+dfsg-1+b1 [alpha], 1.12.2+dfsg-1 [sh4], 1.5.2+dfsg-1 [hppa])
- Lightweight, RESTful DICOM server for medical imaging
- orthanc-dicomweb (1.16+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 1.7+dfsg-5 [sparc64, x32], 0.5+dfsg-3 [alpha])
- greffon d’extension d’Orthanc avec prise en charge de WADO et DICOMweb
- orthanc-gdcm (1.6+dfsg-1+b2 [armel, armhf], 1.6+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64])
- DICOM transcoder/decoder for Orthanc using GDCM (notably for JPEG2k)
- orthanc-imagej (1.2+dfsg-4)
- ImageJ plugin to import images from Orthanc
- orthanc-mysql (5.0+dfsg-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 5.0+dfsg-1+b1 [sh4], 2.0-3+b2 [hppa])
- Plugins to use MySQL or MariaDB as a database back-end to Orthanc
- orthanc-neuro (1.1+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.0-2+b1 [sh4])
- Neuroimaging plugin for Orthanc
- orthanc-postgresql (5.0+dfsg-2+b3 [riscv64], 5.0+dfsg-2+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 5.0+dfsg-2+b1 [sh4], 3.2-3+b2 [hppa])
- Plugins to use PostgreSQL as a database back-end to Orthanc
- orthanc-python (4.1+ds-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 4.1+ds-2+b1 [sh4], 1.0+ds-2+b1 [hppa])
- Develop plugins for Orthanc using the Python programming language
- orthanc-webviewer (2.9+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.8-4+b1 [sh4], 1.2-1 [hppa])
- Web viewer of medical images for Orthanc
- orthanc-wsi (2.0+dfsg-2+b3 [riscv64], 2.0+dfsg-2+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 2.0+dfsg-2+b1 [sh4], 0.5-2+b2 [hppa])
- Whole-slide imaging support for Orthanc (digital pathology)
- ortools-examples (8.2+ds-6)
- Google Optimization Tools (examples)
- ortools-flatzinc (8.2+ds-6+b1)
- Google Optimization Tools (flatzinc)
- ortools-samples (8.2+ds-6+b1)
- Google Optimization Tools (samples)
- oscar (1.5.1-1+b2 [riscv64], 1.5.1-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 1.5.1-1 [alpha, hppa, sh4], 1.4.0-1 [ia64, m68k, x32])
- outil d’analyse du trouble du sommeil – OSCAR
- osra (2.1.3-3+b2 [riscv64], 2.1.3-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 2.1.3-2 [x32])
- optical structure recognition
- otf-trace (1.12.5+dfsg-8+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.12.5+dfsg-8+b1 [alpha, hppa, ia64, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Open Trace Format support library - development files
- otf2-tools (3.0.3-3.1)
- Open Trace Format support library - tools
- packmol (1:20.14.3-1)
- Initial configurations for Molecular Dynamics Simulations
- paje.app (1.98-1.1+b2 [riscv64], 1.98-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outil générique de visualisation (diagramme de GANTT et autres)
- pal2nal (14.1-3)
- converts proteins to genomic DNA alignment
- paleomix (1.3.8-1 [amd64, arm64], 1.3.7-3 [m68k, riscv64, sh4])
- pipelines and tools for the processing of ancient and modern HTS data
- paml (4.9j+dfsg-4+b1 [riscv64], 4.9j+dfsg-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- PAML – analyse de phylogenèse par maximum de vraisemblance
- pan-config (0.4)
- PAN Blend config package
- pan-tasks (0.4)
- PAN Blends tasks for tasksel
- paraclu (10-1+b1 [riscv64], 10-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Parametric clustering of genomic and transcriptomic features
- parafly (0.1.0-4+b1 [riscv64], 0.1.0-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- parallel command processing using OpenMP
- parallel-fastq-dump (0.6.7-3)
- parallel fastq-dump wrapper
- paraview (5.11.2+dfsg-6+b10 [riscv64], 5.11.2+dfsg-6+b9 [amd64, arm64, i386, ppc64el, s390x], 5.11.2+dfsg-6+b8 [ppc64], 5.11.0+dfsg-2 [sparc64], 5.9.0-2+b1 [alpha], 5.7.0-5+b1 [x32], 5.7.0-4 [hppa], 5.4.1+dfsg4-3.1+b1 [m68k], 3.14.1-1 [sh4])
- application parallèle de visualisation
- parsinsert (1.04-15+b1 [riscv64], 1.04-15 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.04-13 [alpha])
- Parsimonious Insertion of unclassified sequences into phylogenetic trees
- parsinsert-testdata (1.04-15)
- Test data for parsinsert
- parsnp (2.0.4+dfsg-1)
- rapid core genome multi-alignment
- patman (1.2.2+dfsg-8+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.2.2+dfsg-8 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- rapid alignment of short sequences to large databases
- pbbamtools (2.4.0+dfsg-1+b3 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64], 1.3.0+dfsg-2 [m68k, sh4])
- processing Pacific Biosciences binary alignment/map files
- pbdagcon (0.3+git20180411.c14c422+dfsg-8+b1 [riscv64], 0.3+git20180411.c14c422+dfsg-8 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64el], 0.3+git20161121.0000000+ds-1.1+b1 [m68k, sh4], 0~20160325+ds-1 [x32])
- sequence consensus using directed acyclic graphs
- pbhoney (15.8.24+dfsg-7)
- genomic structural variation discovery
- pbjelly (15.8.24+dfsg-7)
- genome assembly upgrading tool
- pbsim (1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3+b1 [riscv64], 1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0.3+git20180330.e014b1d+dfsg-2 [ia64])
- simulateur pour les lectures de séquences de PacBio
- pdb-tools (2.5.1-1)
- tools for manipulating and editing PDB files
- pdb2pqr (3.6.1+dfsg-1)
- Preparation of protein structures for electrostatics calculations
- perlprimer (1.2.4-2)
- Conception graphique d'amorce de PCR
- perm (0.4.0-8+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.4.0-8 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- efficient mapping of short reads with periodic spaced seeds
- persalys (15.0+ds-3+b2 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 15.0+ds-3+b1 [ppc64], 13.1.1+ds-1+b1 [hppa], 12.0.1+ds-2 [alpha])
- interface graphique pour le traitement d’incertitudes et la gestion de dispersions
- pftools (3.2.12-1)
- build and search protein and DNA generalized profiles
- phast (1.6+dfsg-5)
- phylogenetic analysis with space/time models
- phipack (0.0.20160614-5+b1 [riscv64], 0.0.20160614-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- PHI test and other tests of recombination
- phybin (0.3-6+b1 [riscv64], 0.3-6 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 0.3-5+b1 [x32])
- binning/clustering newick trees by topology
- phylip (1:3.697+dfsg-4)
- paquet de programmes pour déduire les phylogénies
- phylonium (1.7-3)
- Fast and Accurate Estimation of Evolutionary Distances
- phyml (3:3.3.20220408-3+b2 [riscv64], 3:3.3.20220408-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 3:3.3.20220408-3 [sh4])
- estimation phylogénétique utilisant la probabilité maximale
- physamp (1.1.0-5)
- sample sequence alignment corresponding to phylogeny
- phyutility (2.7.3+dfsg-4+b1 [riscv64], 2.7.3+dfsg-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.7.3-1 [hppa])
- simple analyses or modifications on both phylogenetic trees and data matrices
- phyx (1.3.1+ds-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, x32], 1.3.1+ds-2 [sparc64])
- UNIX-style phylogenetic analyses on trees and sequences
- picard-tools (3.1.1+dfsg-1)
- Command line tools to manipulate SAM and BAM files
- picopore (1.2.0-3)
- lossless compression of Nanopore files
- picosat (965-2+b1 [riscv64], 965-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- solveur SAT avec gestion de démonstrations et « core »
- pigx-rnaseq (0.1.0-1.1)
- pipeline for checkpointed and distributed RNA-seq analyses
- piler (0~20140707-4)
- genomic repeat analysis
- pilercr (1.06+dfsg-5+b1 [riscv64], 1.06+dfsg-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- software for finding CRISPR repeats
- pilon (1.24-3)
- automated genome assembly improvement and variant detection tool
- pinfish (0.1.0+ds-4)
- outils pour l’annotation de génomes en utilisant des données transcriptomiques de lectures longues
- pinfish-examples (0.1.0+ds-4)
- Examples and test data for pinfish
- pique (1.0-7)
- software pipeline for performing genome wide association studies
- pirs (2.0.2+dfsg-12+b1 [riscv64], 2.0.2+dfsg-12 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 2.0.2+dfsg-6 [x32])
- Profile based Illumina pair-end Reads Simulator
- pirs-examples (2.0.2+dfsg-12)
- profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (example data)
- pirs-profiles (2.0.2+dfsg-12)
- profile basd Illumina pair-end Reads Simulator (profile data)
- pizzly (0.37.3+ds-9+b1 [riscv64], 0.37.3+ds-9 [alpha, amd64, arm64, hppa, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- identification de fusions de gènes dans des données de séquençage d’ARN
- pkg-r-autopkgtest (20231212)
- Script for the automatic testing of R packages
- pktools (2.6.7.6+ds-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.6.7.6+ds-4+b1 [sh4], 2.6.7.6+ds-4 [x32])
- utilitaires complémentaires pour GDAL pour un traitement efficace d'images matricielles
- placnet (1.04-1)
- Plasmid Constellation Network project
- planetary-system-stacker (0.8.32~git20221019.66d7558-2)
- create a sharp image of a planetary system object (moon, sun, planets)
- planets (0.1.13-22)
- simulation gravitationnelle de corps planétaires
- plasmidid (1.6.5+dfsg-2)
- mapping-based, assembly-assisted plasmid identification tool
- plasmidseeker (1.3+dfsg-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.3+dfsg-3 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- identification of known plasmids from whole-genome sequencing reads
- plast (2.3.2+dfsg-10+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.3.2+dfsg-10+b2 [riscv64])
- Parallel Local Sequence Alignment Search Tool
- plast-example (2.3.2+dfsg-10)
- Parallel Local Sequence Alignment Search Tool (example data)
- plastimatch (1.9.4+dfsg.1-2+b1 [amd64], 1.6.2+dfsg-1 [hppa, sparc64, x32], 1.6.0+dfsg-1 [alpha], 1.5.15+dfsg-1 [ppc64])
- reconstruction d’images médicales et recalage
- plink (1.07+dfsg-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.07+dfsg-4 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- outils d'analyse d'associations sur le génome entier
- plink1.9 (1.90~b7.2-231211-1 [amd64, armel, armhf, i386, x32], 1.90~b3b-150117-1+b1 [hppa], 1.90~b3b-150117-1 [sh4])
- outils d'analyse d'associations sur le génome entier
- plink2 (2.00~a5.8-231123+dfsg-1+b1 [riscv64], 2.00~a5.8-231123+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32])
- whole-genome association analysis toolset
- pluto-jpl-eph (0.0~git20180228-1.1+b1 [riscv64], 0.0~git20180228-1.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- command line handling of JPL ephemeres data
- pluto-lunar (0.0~git20180825.e34c1d1-1+b1 [amd64, riscv64], 0.0~git20180825.e34c1d1-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- routines de prédictions de positions dans le système solaire
- pnetcdf-bin (1.12.3-2+b2 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.12.3-2+b1 [alpha, ia64, ppc64, sparc64], 1.9.0-1 [m68k, sh4], 1.8.1-3 [hppa, x32])
- Programs for reading and writing parallel NetCDF files
- poa (2.0+20060928-9)
- alignement d'ordre partiel pour les alignements multiples de séquences
- populations (1.2.33+svn0120106+dfsg-7 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.2.33+svn0120106+dfsg-6 [alpha, m68k, x32])
- logiciel de génétique de populations
- porechop (0.2.4+dfsg-5)
- adapter trimmer for Oxford Nanopore reads
- poretools (0.6.0+dfsg-6)
- toolkit for nanopore nucleotide sequencing data
- poretools-data (0.6.0+dfsg-6)
- toolkit for nanopore nucleotide sequencing data -- sample datasets
- pplacer (1.1~alpha19-6)
- phylogenetic placement and downstream analysis
- praat (6.4.07+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64], 6.3.17+dfsg-1 [ppc64], 6.3.14-1 [hppa], 6.3.11-3 [sparc64], 6.1.34-1 [sh4, x32], 6.1.14-3 [ia64])
- programme pour l'analyse et la synthèse de la parole
- prank (0.0.170427+dfsg-3+b1 [riscv64], 0.0.170427+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Probabilistic Alignment Kit for DNA, codon and amino-acid sequences
- predictnls (1.0.20-8)
- prédiction et analyse de signaux de localisation nucléaire de protéines
- prime-phylo (1.0.11-11 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.0.11-10+b1 [alpha, sh4, x32])
- bayesian estimation of gene trees taking the species tree into account
- primer3 (2.6.1-4+b1 [riscv64], 2.6.1-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outil de choix d'amorces l'amplification d'ADN
- primer3-examples (2.6.1-4)
- tool to design flanking oligo nucleotides for DNA amplification (examples)
- prinseq-lite (0.20.4-6)
- PReprocessing and INformation of SEQuence data (lite version)
- prinseq-lite-examples (0.20.4-6)
- PReprocessing and INformation of SEQuence data (example data)
- proalign (0.603-5+b1 [riscv64], 0.603-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.603-3 [hppa])
- logiciel d'alignements de multiples séquences probabilistes
- probabel (0.5.0+dfsg-6 [amd64, i386, m68k, sh4, x32], 0.5.0+dfsg-5 [hppa, ppc64, sparc64], 0.5.0+dfsg-4 [alpha, ia64])
- Toolset for Genome-Wide Association Analysis
- probabel-examples (0.5.0+dfsg-6)
- Example files for ProbABEL
- probalign (1.4-10+b1 [riscv64], 1.4-10 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- alignement de séquences multiples en utilisant les probabilités à postériori de la fonction de partition
- probcons (1.12-14+b1 [riscv64], 1.12-14 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- alignement de séquences multiples basé sur la cohérence probabiliste
- (1.12-14+b1 [riscv64], 1.12-14 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Programmes optionnels pour le paquets probcons
- proda (1.0-14)
- Alignement multiple de séquences protéiques
- prodigal (1:2.6.3-6+b1 [riscv64], 1:2.6.3-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Microbial (bacterial and archaeal) gene finding program
- profbval (1.0.22-8)
- prédicteur des résidus de protéine flexibles/rigides à partir d'une séquence
- profisis (1.0.11-7)
- prédiction des sites d'interaction protéine-protéine à partir d'une séquence
- profnet-bval (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- neural network architecture for profbval
- profnet-chop (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- neural network architecture for profchop
- profnet-con (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- neural network architecture for profcon
- profnet-isis (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- neural network architecture for profisis
- profnet-md (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- neural network architecture for metadisorder
- profnet-norsnet (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- neural network architecture for norsnet
- profnet-prof (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- neural network architecture for profacc
- profnet-snapfun (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- neural network architecture for snapfun
- profphd-net (1.0.22-8+b1 [riscv64], 1.0.22-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- architecture de réseaux de neurones pour le paquet profphd
- profphd-utils (1.0.10-7+b1 [riscv64], 1.0.10-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- profphd helper utilities convert_seq and filter_hssp
- proftmb (1.1.12-11+b1 [riscv64], 1.1.12-11 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- per-residue prediction of bacterial transmembrane beta barrels
- progressivemauve (1.2.0+4713+dfsg-5+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 1.2.0+4713+dfsg-5+b2 [alpha, ia64, ppc64, sparc64, x32])
- multiple genome alignment algorithms
- proj-bin (9.4.0-1+b2 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32], 9.4.0-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x])
- bibliothèque de projection cartographique (outils)
- prokka (1.14.6+dfsg-6)
- rapid annotation of prokaryotic genomes
- promod3 (3.4.0+ds-1)
- protein homology modelling engine
- promod3-data (3.4.0+ds-1)
- protein homology modelling engine - data files
- proteinortho (6.3.1+dfsg-1 [amd64, arm64, ia64, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 6.0.31+dfsg-2 [hppa, m68k, sh4], 6.0.31+dfsg-1 [alpha], 6.0.8+dfsg-1 [sparc64])
- Detection of (Co-)orthologs in large-scale protein analysis
- prottest (3.4.2+dfsg-8)
- selection of best-fit models of protein evolution
- provean (1.1.5+ds-2+b1 [riscv64], 1.1.5+ds-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Protein Variation Effect Analyzer
- pscan-chip (1.1-3+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.1-3+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- ChIP-based identifcation of TF binding sites
- pscan-chip-data (1.1-3)
- auxiliary data for PScan-ChIP
- pscan-tfbs (1.2.2-4+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.2.2-4+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- search for transcription factor binding sites
- psfex (3.24.2-1+b1 [riscv64], 3.24.2-1 [alpha, amd64, arm64, armel, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 3.17.1+dfsg-5+b1 [hppa])
- Point Spread Function model extractor
- psi3 (3.4.0-6+b5 [mips64el], 3.4.0-6+b4 [ppc64, sparc64], 3.4.0-6+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, ppc64el, s390x, sh4], 3.4.0-6+b1 [ia64, riscv64])
- suite de programme de chimie quantique
- psi4 (1:1.3.2+dfsg-5+b2 [riscv64], 1:1.3.2+dfsg-5+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 1:1.3.2+dfsg-5 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Quantum Chemical Program Suite
- psi4-data (1:1.3.2+dfsg-5)
- suite de programmes de chimie quantique – fichiers de données
- psortb (3.0.6+dfsg-3+b4)
- outil de prédiction de localisation bactérienne
- psychopy (2023.2.4+dfsg-3)
- environnement pour créer des stimuli psychologiques en Python
- psychtoolbox-3-common (3.0.19.9.dfsg1-1)
- toolbox for vision research -- arch/interpreter independent part
- psychtoolbox-3-lib (3.0.19.9.dfsg1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 3.0.19.5.dfsg1-1 [alpha], 3.0.18.12.dfsg1-1.1 [hppa, m68k, sh4], 3.0.18.9.dfsg1-1 [x32])
- toolbox for vision research -- arch-specific parts
- pullseq (1.0.2-5)
- Extract sequence from a fasta or fastq
- purify (2.0.0-6+b1)
- Collection of routines for radio interferometric imaging
- pycoqc (2.5.2+dfsg-3)
- computes metrics and generates Interactive QC plots
- pyensembl (2.3.11-1)
- installs data from the Ensembl genome database
- pyfai (2024.02-1)
- Fast Azimuthal Integration scripts
- pyfastx (2.1.0-1)
- fast random access to sequences from FASTA/Q file - command
- pyfr (1.5.0-3)
- flux reconstruction in Python
- pymca (5.9.2+dfsg-2)
- applications et boite à outils pour l’analyse de fluorescence de rayons X – scripts
- pymca-data (5.9.2+dfsg-2)
- fichiers de données indépendantes de l'architecture pour PyMca
- pymoctool (0.5.0-5)
- Python Multi-Order Coverage maps tool for Virtual Observatory
- pymol (2.5.0+dfsg-1)
- système de graphismes moléculaires
- pymol-data (2.5.0+dfsg-1)
- data files for PyMOL
- pyomop (4.2.0-1)
- OHSDI OMOP Common Data Model tools
- pysatellites (2.7-2)
- simulation de lancement de satellites
- python-drizzle-testdata (1.15.1-1)
- Dithered image combination for Python (Test data)
- python-escript-doc (5.6-7)
- Documentation for Escript/Finley
- python-pairix-examples (0.3.7-7)
- 1D/2D indexing and querying with a pair of genomic coordinates (examples)
- python3-adios4dolfinx (0.7.3-7)
- ADIOS2Wrappers for DOLFINx (Python 3)
- python3-airr (1.5.0-1)
- Data Representation Standard library for antibody and TCR sequences
- python3-alignlib (0.1.1+dfsg-2+b5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1.1+dfsg-2+b4 [riscv64])
- edit and Hamming distances for biological sequences
- python3-amp (0.6.1-1+b9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 0.6.1-1+b8 [m68k, riscv64], 0.6.1-1+b5 [sparc64], 0.6.1-1+b2 [x32], 0.6.1-1+b1 [sh4])
- Atomistic Machine-learning Package (python 3)
- python3-bioframe (0.4.1-1)
- library to enable flexible, scalable operations on genomic interval dataframes
- python3-bornagain (21.1+ds3-4 [amd64, mips64el, sparc64], 1.19.0-4 [hppa, ppc64, riscv64], 1.19.0-3+b5 [alpha, m68k])
- simulation et adaptation GISAS de rayons X et de neutrons – Python 3
- python3-cif2cell (2.1.0+dfsg-1)
- prepare CIF files for electronic structure calculations
- python3-cykhash (2.0.0-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 2.0.0-2 [x32])
- enveloppe de cython pour « khash-sets/maps » pour une implémentation efficace de « isin » et « unique »
- python3-cyvcf2 (0.30.28-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 0.30.22-1 [x32])
- VCF parser based on htslib (Python 3)
- python3-datacache (1.2.1-2)
- helpers for transparently downloading datasets
- python3-datalad-next (1.2.0-1)
- DataLad extension for new features and improved user experience
- python3-dcmstack (0.9-1)
- DICOM to NIfTI conversion - python3 package
- python3-deeptools (3.5.4+dfsg-1)
- platform for exploring biological deep-sequencing data
- python3-deeptoolsintervals (0.1.9-3+b8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1.9-3+b6 [riscv64])
- gestion de style GTF de séquences, intervalles associés, annotations
- python3-dials (3.17.0+dfsg3-3 [amd64], 3.12.1+dfsg3-4+b1 [riscv64])
- Diffraction Integration for Advanced Light Sources - Python3
- python3-dnapilib (1.1-3)
- adapter prediction for small RNA sequencing - library
- python3-emperor (1.0.3+ds-9)
- visualizing high-throughput microbial community data
- python3-escript (5.6-7+b1 [amd64, arm64, armel, m68k, ppc64el, riscv64, s390x], 5.6-7 [armhf], 5.6-6+b3 [ppc64], 5.6-6+b1 [sh4], 5.6-6 [alpha], 5.5-5 [x32], 5.4-1 [ia64], 5.2-1 [sparc64], 5.1-6 [hppa])
- Escript/Finley finite elements Python3 system (with OpenMP)
- python3-escript-mpi (5.6-7+b1 [amd64, arm64, armel, m68k, ppc64el, riscv64, s390x], 5.6-7 [armhf], 5.6-6+b3 [ppc64], 5.6-6+b1 [sh4], 5.6-6 [alpha], 5.5-5 [x32], 5.4-1 [ia64], 5.2-1 [sparc64], 5.1-6 [hppa])
- (OpenMP + MPI)
- python3-faiss (1.8.0-1 [amd64, arm64, ia64, m68k, mips64el, ppc64el], 1.7.4-3+b1 [riscv64], 1.7.4-3 [alpha, armel, armhf, hppa, i386, ppc64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Python 3 module for efficient similarity search and clustering of dense vectors
- python3-ffcv (1.0.0+git20240202+ds-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.0.0+git20240202+ds-1 [alpha, hppa, m68k, ppc64])
- Fast Forward Computer Vision (and other ML workloads)
- python3-freesas (0.9.0-6+b1 [riscv64], 0.9.0-6 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el])
- Python libraries for small angle scattering tools
- python3-geneimpacts (0.3.7-4)
- wraps command line tools to assess variants in gene sequences
- python3-gfapy (1.2.3+dfsg-2+b1 [riscv64], 1.2.3+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- flexible and extensible software library for handling sequence graphs
- python3-gffutils (0.13-1)
- Work with GFF and GTF files in a flexible database framework
- python3-gtfparse (1.3.0+ds-1)
- parser for gene transfer format (aka GFF2)
- python3-harmonypy (0.0.9-3)
- is a data integration algorithm
- python3-jupyter-sphinx (0.3.2-2)
- Jupyter Sphinx Extension - Python3
- python3-keras (2.3.1+dfsg2-1)
- deep learning framework running on Theano or TensorFlow
- python3-louvain (0.0+20181013git3fc1f575-2)
- community graph analysis implementing Louvain method
- python3-mmtf (1.1.3-1)
- binary encoding of biological structures (Python 3)
- python3-mpiplus (0.0.2+ds-1)
- cadriciel de Python avec GPU pour le calcul d’énergie libre alchimique – Python 3
- python3-nanostat (1.4.0-3)
- statistics on long biological sequences
- python3-navarp (1.6.0-2)
- outil de navigation pour les données ARPES – Python 3
- python3-noise (1.2.3-4+b4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.2.3-4+b3 [riscv64])
- Perlin noise for image generation
- python3-onnx (1.14.1-2.1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.14.1-2.1 [hppa], 1.12.0-2+b3 [alpha], 1.7.0+dfsg-2 [ia64])
- Open Neural Network Exchange (ONNX) (Python)
- python3-parmed (4.2.2+dfsg-3)
- parameter and topology file editor and molecular mechanical simulator
- python3-pdbtools (2.5.1-1)
- tools for manipulating and editing PDB files (Python 3 package)
- python3-peptidebuilder (1.1.0-3)
- generate atomic oligopeptide 3D structure from sequence
- python3-pomegranate (0.14.8-6 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 0.14.8-4 [alpha, ppc64], 0.14.8-3 [hppa], 0.12.2-1 [x32], 0.11.1+dfsg2-1+b1 [ia64])
- modélisation probabiliste rapide, flexible et facile à utiliser
- python3-prodigy (2.1.5-1)
- Protein Binding Affinity Prediction (Python 3)
- python3-prody (2.4.1+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 2.3.1+dfsg-3+b1 [i386])
- paquet de Python pour l’analyse dynamique de protéines
- python3-prody-tests (2.4.1+dfsg-2)
- Python package for protein dynamics analysis - test data
- python3-propka (3.5.1-1)
- heuristic pKa calculations with ligands (Python 3)
- python3-py2bit (0.3.1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4, x32], 0.3.0-5+b1 [m68k], 0.3.0-3+b1 [hppa, ppc64, sparc64])
- access to 2bit files
- python3-pyaml-env (1.2.1-1)
- Python3 YAML configuration with environment variables parsing
- python3-pybel (0.14.10-1)
- Biological Expression Language
- python3-pybigwig (0.3.22+dfsg-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 0.3.22+dfsg-1 [x32])
- Python 3 module for quick access to bigBed and bigWig files
- python3-pyimagetool (1.0-2)
- Image Tool for multidimensional analysis (Python 3)
- python3-pymbar (3.1.0-4)
- Python implementation of the multistate Bennett acceptance ratio (MBAR)
- python3-pynlpl (1.2.9-1)
- PyNLPl is a library for Natural Language Processing (Python 3 version)
- python3-pynndescent (0.5.8-2)
- nearest neighbor descent for approximate nearest neighbors
- python3-pyobjcryst (2.2.5-1+b3)
- Object-Oriented Crystallographic Library bindings (Python 3)
- python3-pyvista (0.43.2-1+b1 [amd64], 0.43.2-1 [arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64])
- Python3 high-level API to the Visualization Toolkit (VTK)
- python3-pyvkfft (2024.1.2+ds1-2)
- Binding to the OpenCL backends of VkFFT - Python3
- python3-pyxrd (0.8.4-3+b1 [riscv64], 0.8.4-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64])
- modeling of X-ray diffraction (XRD) patterns of disordered lamellar structures
- python3-qiskit-aer (0.4.1-2+b3 [amd64, armhf, i386, ppc64el], 0.4.1-2+b2 [arm64, mips64el], 0.4.1-2 [riscv64])
- Quantum Information Science Kit (Qiskit): Aer
- python3-qiskit-ibmq-provider (0.4.6-4)
- Qiskit (Quantum Information Science Kit) : « provider » pour IBM Q
- python3-qiskit-terra (0.12.0-4+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 0.12.0-4+b1 [alpha, hppa], 0.12.0-1 [x32])
- Quantum Information Science Kit (Qiskit) for Python 3
- python3-seqcluster (1.2.9+ds-3) [contrib]
- analysis of small RNA in NGS data
- python3-skorch (0.15.0-1)
- scikit-learn compatible neural network library that wraps PyTorch
- python3-tinyalign (0.2.2-1+b1)
- numerical representation of differences between strings
- python3-torch-cluster (1.6.3-1)
- PyTorch extension library of optimized graph cluster algorithms (Python 3)
- python3-torch-geometric (2.3.1-1)
- Graph Neural Network Library for PyTorch
- python3-torch-ignite (0.4.12-1)
- High-level library to help with training and evaluating in PyTorch
- python3-torch-scatter (2.1.2-1 [amd64, arm64, ppc64el, s390x], 2.1.0-2 [riscv64])
- PyTorch Extension Library of Optimized Scatter Operations
- python3-torch-sparse (0.6.18-2 [amd64, arm64, ppc64el, s390x], 0.6.16-2 [riscv64])
- PyTorch Extension Library of Optimized Autograd Sparse Matrix Operations
- python3-torchaudio (0.13.1-1+b2 [amd64, arm64, ppc64el, s390x], 0.13.1-1+b1 [riscv64], 0.7.2-1+b2 [hppa])
- Data manipulation and transformation for audio signal processing
- python3-torchtext (0.15.2-1 [amd64, arm64, ppc64el, s390x], 0.14.1-2 [riscv64], 0.8.1-1+b1 [hppa])
- Data loaders and abstractions for text and NLP
- python3-torchvision (0.15.2-1+b1 [ppc64el], 0.15.2-1 [amd64, arm64, s390x], 0.14.1-2 [riscv64], 0.8.2-1+b2 [hppa])
- Datasets, Transforms and Models specific to Computer Vision
- python3-weblogo (3.7.12-5)
- sequence logo generator
- python3-xeus-python-shell (0.15.10+~0.6.1-2)
- Native jupyter kernel for python (python library)
- python3-xgboost (2.0.3-1+b1)
- Scalable and Flexible Gradient Boosting (Python3)
- python3-xraydb (4.5.3-2)
- X-ray Reference Data (Python 3)
- python3-xraylarch (0.9.74+ds1-1)
- spectroscopie d’absorption et de fluorescence de rayons X et analyse de données de diffraction
- python3-xrstools (0.15.0+git20210910+c147919d-3+b1)
- outils pour la diffusion Raman de rayons X – Python 3
- python3-xrt (1.6.0+ds1-1)
- lancer de rayons X et propagation d’ondes – Python 3
- pyzo (4.12.3-1)
- interactive editor for scientific Python
- q2-alignment (2024.2.0-1)
- QIIME 2 plugin for generating and manipulating alignments
- q2-cutadapt (2024.2.0-1)
- QIIME 2 plugin to work with adapters in sequence data
- q2-dada2 (2024.2.0-1)
- QIIME 2 plugin to work with adapters in sequence data
- q2-demux (2024.2.0+dfsg-1)
- QIIME 2 plugin for demultiplexing of sequence reads
- q2-diversity-lib (2024.2.0-1)
- QIIME2 plugin to expose diversity metrics/measures as actions
- q2-emperor (2024.2.0-1)
- QIIME2 plugin for display of ordination plots
- q2-feature-classifier (2024.2.0-1)
- classification taxinomique gérant le greffon QIIME 2
- q2-feature-table (2024.2.0+dfsg-1)
- QIIME 2 plugin supporting operations on feature tables
- q2-fragment-insertion (2024.2.0-1)
- QIIME 2 plugin for fragment insertion
- q2-metadata (2024.2.0+dfsg-1)
- QIIME 2 plugin for working with and visualizing Metadata
- q2-phylogeny (2024.2.0-1)
- QIIME 2 plugin for phylogeny
- q2-quality-control (2024.2.0-2)
- QIIME 2 plugin for quality assurance of feature and sequence data
- q2-quality-filter (2024.2.0-1)
- QIIME2 plugin for PHRED-based filtering and trimming
- q2-sample-classifier (2024.2.0-1)
- QIIME 2 plugin for machine learning prediction of sample data
- q2-taxa (2024.2.0+dfsg-1)
- QIIME 2 plugin for working with feature taxonomy annotations
- q2-types (2024.2.0-1)
- QIIME 2 plugin defining types for microbiome analysis
- q2cli (2024.2.0-1)
- Click-based command line interface for QIIME 2
- q2templates (2024.2.0+ds-1)
- Design template package for QIIME 2 Plugins
- qcat (1.1.0-6)
- demultiplexing Oxford Nanopore reads from FASTQ files
- qcat-examples (1.1.0-6)
- demultiplexing Oxford Nanopore reads from FASTQ files (examples)
- qcumber (2.3.0-2)
- quality control of genomic sequences
- qemu-web-desktop (24.01.19+ds1-4 [amd64, arm64, ppc64el, riscv64], 21.05.03-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sparc64])
- Remote desktop service with virtual machines in a browser (DARTS).
- qfits-tools (6.2.0-9)
- outils pour manipuler des fichiers FITS
- qfitsview (4.1+dfsg-2+b2 [riscv64], 4.1+dfsg-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 4.1+dfsg-2 [m68k])
- visualisateur de fichier FITS basé sur DPUSER
- qgis (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64])
- système d'information géographique –⋅SIG
- qgis-api-doc (3.34.5+dfsg-1)
- documentation de l'API de QGIS
- qgis-common (3.34.5+dfsg-1)
- QGIS –⋅données indépendantes de l'architecture
- qgis-plugin-grass (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64])
- greffon GRASS pour QGIS
- qgis-plugin-grass-common (3.34.5+dfsg-1)
- greffon GRASS pour QGIS –⋅données indépendantes de l'architecture
- qgis-provider-grass (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64])
- fournisseur GRASS pour QGIS
- qgis-providers (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64])
- fournisseurs de collections de données pour QGIS
- qgis-providers-common (3.34.5+dfsg-1)
- fournisseur de collections de données pour QGIS –⋅fichiers indépendants de l'architecture
- qgis-server (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k], 2.14.19+dfsg-1 [sparc64])
- serveur pour QGIS fournissant divers services de l’OGC
- qgis-server-bin (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k])
- serveur pour QGIS fournissant divers services de l’OGC – exécutables
- qgis-server-common (3.34.5+dfsg-1)
- QGIS server providing various OGC services (data)
- qgis-server-dummy (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k])
- serveur QGIS fournissant divers services d’OGC – paquet factice
- qgis-server-landingpage (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k])
- serveur QGIS fournissant divers services d’OGC – page de renvoi
- qgis-server-wcs (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k])
- serveur QGIS fournissant divers services de l’OGC – WCS
- qgis-server-wfs (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k])
- serveur pour QGIS fournissant divers services de l’OGC – WFS
- qgis-server-wfs3 (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k])
- serveur QGIS fournissant divers services d’OGC – WFS 3
- qgis-server-wms (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k])
- serveur pour QGIS fournissant divers services de l’OGC – WMS
- qgis-server-wmts (3.34.5+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 3.28.15+dfsg-1 [hppa, sh4], 3.28.7+dfsg-1 [alpha], 3.22.13+dfsg-1+b1 [x32], 3.16.16+dfsg-1 [m68k])
- serveur pour QGIS fournissant divers services de l’OGC – WMTS
- qgis3-survex-import (1.3-1)
- QGIS3 plugin to read survex 3d files, for cave surveying
- qiime (2024.2.0-1)
- QIIME, Quantitative Insights Into Microbial Ecology
- qmapshack (1.17.1-1+b3 [amd64], 1.17.1-1+b2 [armhf], 1.17.1-1+b1 [arm64, i386, mips64el], 1.11.1-4 [alpha, m68k, ppc64, sh4], 1.11.1-3 [riscv64, x32], 1.11.1-1 [hppa], 1.9.0-1 [sparc64])
- cartographie GPS (GeoTiff et vectorielle) et gestion d’appareils GPS
- qmc (0.94-4.1+b1 [riscv64], 0.94-4.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Outil de simplification Quine McClusky
- qrisk2 (0.1.20150729-5+b1 [riscv64], 0.1.20150729-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- calculateur de risque de maladies cardiovasculaires
- qthid-fcd-controller (4.1-6+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 4.1-6+b1 [alpha], 4.1-6 [m68k, x32])
- contrôleur pour le dongle de Funcube
- qtltools (1.3.1+dfsg-4+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.3.1+dfsg-4+b1 [hppa], 1.3.1+dfsg-2+b1 [sh4])
- Tool set for molecular QTL discovery and analysis
- qttinysa (0.10.2-1)
- QT Gui for a tiny SA Spectrum Analyser
- quantum-espresso (6.7-2+b3 [armhf, m68k, mips64el, riscv64], 6.7-2+b2 [amd64, arm64, i386, ia64, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 6.7-2+b1 [x32], 6.7-2 [hppa], 6.5-2 [alpha])
- suite Electronic-Structure et Ab-Initio Molecular Dynamics
- quantum-espresso-data (6.7-2)
- Electronic-Structure and Ab-Initio Molecular Dynamics Suite (Documentation)
- quantum-espresso-data-sssp (1.3.0-2)
- Standard solid-state pseudopotentials (SSSP) library
- quicktree (2.5-6+b1 [riscv64], 2.5-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- algorithme Neighbor-Joining pour les phylogénies
- quorum (1.1.2-2+b2 [ppc64el, riscv64], 1.1.2-2+b1 [mips64el], 1.1.2-2 [amd64, arm64], 1.1.1-5 [ia64])
- QUality Optimized Reads of genomic sequences
- qutemol (0.4.1~cvs20081111-15+b4 [riscv64], 0.4.1~cvs20081111-15+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 0.4.1~cvs20081111-15 [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, x32])
- visualisation interactive de macromolécules
- r-cran-alakazam (1.3.0-1+b1 [riscv64], 1.3.0-1 [alpha, amd64, arm64, hppa, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4], 1.2.1-1 [x32], 1.0.2-1 [sparc64], 0.3.0-1 [m68k])
- lignage clonal d’immunoglobuline et analyse de diversité
- r-cran-sdmtools (1.1-221.2-1+b2 [riscv64], 1.1-221.2-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Species Distribution Modelling Tools
- r-cran-shazam (1.2.0-1)
- Immunoglobulin Somatic Hypermutation Analysis
- r-cran-tigger (1.1.0-1)
- Infers new Immunoglobulin alleles from Rep-Seq Data
- racon (1.5.0-3+b1 [riscv64], 1.5.0-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- consensus module for raw de novo DNA assembly of long uncorrected reads
- radiant (2.8.1+dfsg-2)
- explore hierarchical metagenomic data with zoomable pie charts
- ragout (2.3-5)
- Reference-Assisted Genome Ordering UTility
- ragout-examples (2.3-5)
- Reference-Assisted Genome Ordering UTility (example data)
- rambo-k (1.21+dfsg-4)
- Read Assignment Method Based On K-mers
- rampler (2.1.1-1+b1 [riscv64], 2.1.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- module for sampling genomic sequences
- rapmap (0.15.0+dfsg-4)
- rapid sensitive and accurate DNA read mapping via quasi-mapping
- rapmap-dev (0.15.0+dfsg-4)
- rapmap - rapid sensitive and accurate DNA read mapping (some headers)
- rapmap-example-data (0.15.0+dfsg-4)
- example data for rapmap - rapid sensitive and accurate DNA read mapping
- rasmol (2.7.6.0-3+b2 [riscv64], 2.7.6.0-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 2.7.6.0-3 [hppa, sh4])
- visualisation de macromolécules biologiques
- raster3d (3.0-7-2+b2 [riscv64], 3.0-7-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outils pour la génération d'images de protéines ou d'autres molécules
- rate4site (3.0.0-8+b1 [riscv64], 3.0.0-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- detector of conserved amino-acid sites
- rawtran (1.1-1+b5 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el], 1.1-1+b4 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- RAW photo to FITS converter
- raxml (8.2.13+dfsg-1+b1 [riscv64], 8.2.13+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- ressemblance maximale accélérée aléatoire d'arbres phylogénétiques
- ray (2.3.1-8+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 2.3.1-8 [sh4])
- de novo genome assemblies of next-gen sequencing data
- (2.3.1-8)
- Scripts and XSL sheets for post-processing for ray
- rdkit-data (202309.3-3)
- Collection of cheminformatics and machine-learning software (data files)
- rdp-classifier (2.10.2-7)
- extensible sequence classifier for fungal lsu, bacterial and archaeal 16s
- readseq (1-15)
- conversion entre formats de séquences
- readucks (0.0.3-5)
- Nanopore read de-multiplexer (read demux -> readux -> readucks, innit)
- reapr (1.0.18+dfsg-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0.18+dfsg-5 [ia64])
- outil universel pour l’évaluation d’assemblage de génomes
- recan (0.5+dfsg-1)
- tracé de distances génétiques l’analyse de recombinaison d’évènements
- refmac-dictionary (5.41-2)
- dictionary for macromolecular refinement and model building
- relion (3.1.3-3+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 3.1.3-3+b1 [alpha, sh4])
- toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
- relion-cuda (3.1.3-2) [contrib]
- parallel toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy
- relion-gui (3.1.3-3+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 3.1.3-3+b1 [alpha, sh4])
- toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy (gui apps)
- relion-gui-cuda (3.1.3-2) [contrib]
- toolkit for 3D reconstructions in cryo-electron microscopy (gui apps)
- repeatmasker-recon (1.08-8)
- finds repeat families from biological sequences
- reprof (1.0.1-8)
- prédicteur de structure secondaire de protéines et d'accessibilité
- resfinder (4.4.2-1)
- identify acquired antimicrobial resistance genes
- resfinder-db (0.0+git20220524.fa32d9a-1)
- ResFinder database is a curated database of acquired resistance genes
- resfinder-example (4.4.2-1)
- identify acquired antimicrobial resistance genes (example data)
- rna-star (2.7.11b+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el], 2.5.2a+dfsg-2 [x32], 2.4.2a+dfsg-1+b1 [m68k], 2.4.2a+dfsg-1 [sh4])
- aligneur universel et ultra-rapide de RNA-seq
- rnahybrid (2.1.2-8+b2 [riscv64], 2.1.2-8 [alpha, amd64, arm64, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- prédiction rapide et efficace des complexes microARN/cible
- roary (3.13.0+dfsg-1)
- pipeline de pangénome autonome et très rapide
- rocketcea (1.1.34+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 1.1.18+dfsg-1 [x32])
- NASA Chemical Equilibrium, wrapped in Python
- rockhopper (2.0.3+dfsg2-4)
- system for analyzing bacterial RNA-seq data
- roguenarok (1.0.1-3+b1 [riscv64], 1.0.1-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- versatile and scalable algorithm for rogue taxon identification
- routine-update (0.2)
- routine updater for a Debian source package
- rsem (1.3.3+dfsg-3+b2 [riscv64], 1.3.3+dfsg-3+b1 [alpha, amd64, arm64, hppa, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.3.2+dfsg-2+b1 [sh4], 1.2.26+dfsg-2 [m68k])
- RNA-Seq by Expectation-Maximization
- rtax (0.984-8)
- classification de lectures de séquence d’ARN ribosomique 16S
- ruby-getspg (2.4.0-1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 2.3.1-1+b1 [alpha], 2.2.0-2 [x32], 1.16.0-1 [ia64])
- C library for crystal symmetry determination - Ruby bindings
- ruby-rgfa (1.3.1+dfsg-2)
- parse, edit and write GFA format graphs in Ruby
- runcircos-gui (0.0+git20200528.82dda8c-1+b2 [riscv64], 0.0+git20200528.82dda8c-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.0+git20200528.82dda8c-1 [alpha])
- outil graphique pour exécuter circos
- sac2mseed (1.13+ds1-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 1.13+ds1-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Convert SAC waveform data to MiniSEED
- saga (9.4.0+dfsg-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 9.3.2+dfsg-1 [sparc64], 9.3.1+dfsg-3 [alpha, m68k], 9.3.1+dfsg-1 [hppa], 9.1.2+dfsg-1 [sh4], 8.5.0+dfsg-2 [ia64], 8.2.2+dfsg-1 [x32])
- système d’analyses automatisées géoscientifiques
- saga-common (9.4.0+dfsg-1)
- SAGA GIS architecture independent files
- saint (2.5.0+dfsg-4+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.5.0+dfsg-4+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Significance Analysis of INTeractome
- salmid (0.1.23-5)
- rapid Kmer based Salmonella identifier from sequence data
- salmon (1.10.2+ds1-1+b2)
- wicked-fast transcript quantification from RNA-seq data
- sambamba (1.0.1+dfsg-2)
- tools for working with SAM/BAM data
- samblaster (0.1.26-4+b1 [riscv64], 0.1.26-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- marks duplicates, extracts discordant/split reads
- samclip (0.4.0-4)
- filter SAM file for soft and hard clipped alignments
- samtools (1.19.2-1+b1)
- traitement d'alignements de séquence pour les formats SAM et BAM et CRAM
- samtools-test (1.19.2-1)
- test files for the samtools package
- saods9 (8.5+repack-1)
- outil d’affichage d’image pour l’astronomie
- sasview (5.0.6-2)
- Small Angle Scattering Analysis suite
- sat4j (2.3.5-0.3)
- bibliothèque de solveurs SAT en Java
- savi (1.6.0-1+b1 [riscv64], 1.6.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- représentation de constellations satellitaires
- savvy-util (2.1.0-2+b1 [riscv64], 2.1.0-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- conversion tool for SAV file format
- sbmltoolbox (4.1.0-5)
- libsbml toolbox for octave and matlab
- scamp (2.10.0-2+b2 [riscv64], 2.10.0-2+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 2.10.0-2 [alpha, m68k], 2.0.4+dfsg-1+b2 [hppa], 2.0.4-3 [sparc64])
- Compute astrometric and photometric solutions
- science-config (1.14.5)
- paquet de configuration pour le projet Debian Science
- science-dataacquisition-dev (1.14.5)
- Debian Science data acquisition development packages
- science-electronics (1.14.5)
- paquet de transition pour l’électronique de Debian Science
- science-engineering-dev (1.14.5)
- Debian Science Engineering-dev packages
- science-highenergy-physics (1.14.5)
- Debian Science High Energy Physics packages
- science-highenergy-physics-dev (1.14.5)
- Debian Science High Energy Physics development packages
- science-machine-learning (1.14.5)
- paquets pour l’apprentissage automatique de Debian Science
- science-mathematics-dev (1.14.5)
- Debian Science Mathematics-dev packages
- science-meteorology-dev (1.14.5)
- Debian Science Meteorology-dev packages
- science-nanoscale-physics (1.14.5)
- paquets Debian pour les nanosciences
- science-nanoscale-physics-dev (1.14.5)
- paquets de développement Debian pour les nanosciences
- science-neuroscience-cognitive (1.14.5)
- paquets pour les neurosciences cognitives de Debian Science
- science-neuroscience-modeling (1.14.5)
- paquets de Debian Science pour la modélisation de systèmes neuronaux
- science-physics-dev (1.14.5)
- Debian Science Physics-dev packages
- science-robotics-dev (1.14.5)
- Debian Robotics development packages
- science-tasks (1.14.5)
- tâches de Debian Science pour tasksel
- science-viewing-dev (1.14.5)
- Debian Science development of visualisation applications
- scoary (1.6.16-6)
- pangenome-wide association studies
- scram (0.16.2-3+b2)
- outil d’analyse probabiliste de risque
- scram-gui (0.16.2-3+b2)
- frontal graphique pour SCRAM
- scrappie (1.4.2-8+b5 [amd64, arm64, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x, sparc64], 1.4.2-8+b4 [ppc64, riscv64])
- basecaller for Nanopore sequencer
- scrm (1.7.4-1+b1 [riscv64], 1.7.4-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- simulator of evolution of genetic sequences
- sctk (2.4.10-20151007-1312Z+dfsg2-3.1+b1 [riscv64], 2.4.10-20151007-1312Z+dfsg2-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- boite à outils de notation de reconnaissance automatique de la parole
- scythe (0.994+git20141017.20d3cff-3+b1 [riscv64], 0.994+git20141017.20d3cff-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- élagage bayésien d’adaptateurs pour des lectures de séquence
- sdaps (1.9.8-0.1+b4 [riscv64], 1.9.8-0.1+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 1.9.8-0.1+b2 [hppa], 1.9.8-0.1+b1 [sparc64], 1.9.8-0.1 [x32])
- scripts for data acquisition with paper-based surveys
- seaview (1:5.0.5-2+b2 [riscv64], 1:5.0.5-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- interface multiplateforme pour l’alignement de séquences et la phylogénie
- secrecy (0.0.5+ds-3+b3 [sh4], 0.0.5+ds-3+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32])
- tool to handle libsecrecy keys and encrypted files
- seer (1.1.4-7+b4 [alpha, riscv64], 1.1.4-7+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 1.1.4-7+b2 [hppa, sh4], 1.1.4-6 [ia64])
- genomic sequence element (kmer) enrichment analysis
- segemehl (0.3.4-5+b2 [riscv64], 0.3.4-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- associations de lectures courtes avec des trous
- segyio-bin (1.8.3-1.2)
- SEG-Y read/write library for seismic processing (shell utilities)
- sentencepiece (0.2.0-1)
- Unsupervised text tokenizer and detokenizer
- sepp (4.5.1+really4.5.1+dfsg-5)
- phylogeny with ensembles of Hidden Markov Models
- seq-gen (1.3.4-2+b1 [riscv64], 1.3.4-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x]) [non-free]
- simulate the evolution of nucleotide or amino acid sequences
- seqan-apps (2.4.0+dfsg-16 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 2.4.0+dfsg-15 [hppa], 2.4.0+dfsg-11 [x32], 2.3.2+dfsg2-4 [sparc64])
- C++ library for the analysis of biological sequences
- seqan-needle (1.0.2+ds-2)
- pre-filter for the counting of very large collections of nucleotide sequences
- seqan-raptor (3.0.1+ds-5+b1 [riscv64], 3.0.1+ds-5 [alpha, amd64, arm64, mips64el, ppc64el], 3.0.1+ds-2 [sparc64], 3.0.0+ds-2 [ppc64], 2.0.0.0.git.fecfbca+ds-3 [ia64])
- pre-filter for querying very large collections of nucleotide sequences
- seqan-raptor-doc (3.0.1+ds-5)
- HTML & PDF documentation for seqan-raptor and its APIs
- seqcluster (1.2.9+ds-3) [contrib]
- analysis of small RNA in NGS data
- seqkit (2.3.1+ds-2)
- cross-platform and ultrafast toolkit for FASTA/Q file manipulation
- seqkit-examples (2.3.1+ds-2)
- examples for seqkit: toolkit for FASTA/Q file manipulation
- seqmagick (0.8.6-2)
- imagemagick-like frontend to Biopython SeqIO
- seqprep (1.3.2-9)
- stripping adaptors and/or merging paired reads of DNA sequences with overlap
- seqprep-data (1.3.2-9)
- ensemble de données d’exemple pour seqprep – pour tests uniquement
- seqsero (1.0.1+dfsg-6)
- Salmonella serotyping from genome sequencing data
- seqtk (1.4-2+b1 [riscv64], 1.4-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Fast and lightweight tool for processing sequences in the FASTA or FASTQ format
- seriation (0.1+git20210125.fc7b8cb-1+b1 [riscv64], 0.1+git20210125.fc7b8cb-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- finds a suitable linear order for a set of objects
- seriation-data (0.1+git20210125.fc7b8cb-1)
- test data for seriation
- sga (0.10.15-7+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, x32], 0.10.15-7 [alpha], 0.10.15-4 [sh4], 0.10.14-2 [hppa, ppc64, sparc64])
- de novo genome assembler that uses string graphs
- shapeit4 (4.2.2+dfsg-1+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 4.2.2+dfsg-1+b2 [hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, x32])
- fast and accurate method for estimation of haplotypes (phasing)
- shasta (0.11.1-4+b1)
- nanopore whole genome assembly (binaries and scripts)
- shelxle (1.0.1552-1+b2 [amd64, riscv64], 1.0.1552-1+b1 [arm64, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0.1552-1 [alpha])
- interface graphique pour SHELXL
- shiny-server (1.5.20.1002-2+b2)
- put Shiny web apps online
- shovill (1.1.0-9 [amd64], 1.1.0-7 [hppa, ia64, m68k, ppc64, riscv64, sh4, sparc64, x32], 1.1.0-2 [alpha])
- assemblage de génomes d’isolats bactériens à partir de lectures paired-end Illumina
- shovill-examples (1.1.0-9)
- Test Data for shovill
- sibelia (3.0.7+dfsg-3+b1 [riscv64], 3.0.7+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- comparative genomics tool
- sibelia-examples (3.0.7+dfsg-3)
- comparative genomics tool (example data)
- sibsim4 (0.20-5+b1 [riscv64], 0.20-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Alignement de séquences d'ARN sur une séquence d'ADN
- sickle (1.33+git20150314.f3d6ae3-2+b1 [riscv64], 1.33+git20150314.f3d6ae3-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- outil de réduction adaptative à des fenêtres pour des fichiers FASTQ utilisant la qualité
- siconos (4.4.0+dfsg-4)
- modeling and simulation of nonsmooth dynamical systems (simulation runner tool)
- siconos-mechanics-tools (4.4.0+dfsg-4)
- modeling and simulation of nonsmooth dynamical systems (mechanics tools)
- sift (4.0.3b-6+b1) [non-free]
- predicts if a substitution in a protein has a phenotypic effect
- sightcalibrator (23.1.0-2+b2)
- Camera calibration software
- sightviewer (23.1.0-2+b2)
- DICOM viewer
- sigma-align (1.1.3-9)
- alignement de multiples séquences d'ADN non codant
- sigviewer (0.6.4-3+b2 [armel, armhf, riscv64], 0.6.4-3+b1 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 0.6.4-3 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32])
- visionneur graphique pour biosignaux tels que EEG, EMG et ECG
- silx (2.0.1+dfsg-3)
- boite à outils pour l’analyse de données de rayons X – exécutables
- sim4 (0.0.20121010-8+b1 [riscv64], 0.0.20121010-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Outil d'alignement d'ADNc et d'ADN génomique
- sim4db (0~20150903+r2013-8+b3)
- alignement par lot d’épissages de séquences de cDNA pour un génome cible
- simgrid-java (3.11.1-10) [debports]
- Java bindings for the SimGrid Toolkit
- simka (1.5.3-8+b1 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sparc64], 1.5.3-7 [x32], 1.5.3-6 [hppa])
- comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets
- simkamin (1.5.3-8)
- approximate comparative metagenomics method dedicated to NGS datasets
- simrisc (15.05.00-1)
- simulation model for breast/lung cancer risk
- siril (1.2.1-1+b3 [armel, armhf], 1.2.1-1+b2 [alpha, amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.2.1-1 [hppa], 1.2.0-1 [m68k], 0.9.12-2 [x32], 0.9.7-1 [sh4])
- outil de traitement d'images astronomiques
- siril-common (1.2.1-1)
- architecture-independent files for siril
- ska (1.0+dfsg-4)
- Split Kmer Analysis
- skesa (2.4.0-6+b2 [amd64, arm64], 2.4.0-4 [x32])
- strategic Kmer extension for scrupulous assemblies
- skewer (0.2.2-6+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.2.2-6 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- post-processing of high-throughput DNA sequence reads
- skycat (3.1.2+starlink1~b+dfsg-7+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el], 3.1.2+starlink1~b+dfsg-7+b2 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Image visualization and access to catalogs and data for astronomy
- slang-xfig (0.2.0~.138-1)
- tracés et dessins avec fig2dev d’Xfig en utilisant S-lang
- smalt (0.7.6-13)
- Sequence Mapping and Alignment Tool
- smalt-examples (0.7.6-13)
- Sequence Mapping and Alignment Tool (examples)
- smiles-scripts (0.2.0+dfsg1-5)
- command line tools to handle SMILES descriptors
- smithwaterman (0.0+git20160702.2610e25-12+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.0+git20160702.2610e25-12 [m68k])
- determination de régions similaires entre deux chaines de séquences génomiques
- smrtanalysis (0~20210112)
- software suite for single molecule, real-time sequencing
- snakemake (7.32.4-3)
- pythonic workflow management system
- snap (2013-11-29-11+b1 [riscv64], 2013-11-29-11 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- location of genes from DNA sequence with hidden markov model
- snap-aligner (2.0.3+dfsg-2)
- Scalable Nucleotide Alignment Program
- snaphu (2.0.7-1) [non-free]
- Statistical-Cost, Network-Flow Algorithm for 2D Phase Unwrapping
- sniffles (2.2-1)
- structural variation caller using third-generation sequencing
- snippy (4.6.0+dfsg-4)
- rapid haploid variant calling and core genome alignment
- snippy-examples (4.6.0+dfsg-4)
- rapid haploid variant calling and core genome alignment (examples)
- snp-sites (2.5.1-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.5.1-2 [ia64])
- code binaire pour le paquet snp-sites
- snpomatic (1.0-7 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.0-5 [ia64])
- logiciel de mappage strict et rapide de « lectures courtes »
- soapaligner (2.20-5)
- aligner of short reads of next generation sequencers
- soapdenovo (1.05-6)
- short-read assembly method to build de novo draft assembly
- soapdenovo2 (242+dfsg-3)
- méthode d'assemblage de lectures courtes pour construire un assemblage brouillon de novo
- soapsnp (1.03-5+b1 [riscv64], 1.03-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- resequencing utility that can assemble consensus sequence of genomes
- solvate (1.0-3) [non-free]
- arranges water molecules around protein structures
- solvate-doc (1.0-3) [non-free]
- Documentation for solvate
- sortmerna (4.3.6-3+b2 [amd64, i386], 2.1-5 [x32])
- tool for filtering, mapping and OTU-picking NGS reads
- (2.28.0+ds-1+b2 [riscv64], 2.28.0+ds-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64])
- extracteur de sources dans des images astronomiques
- sp800-90b-entropy-assessment (1.1.5-4+b2 [riscv64], 1.1.5-4+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Estimating the quality of a source of entropy
- spaced (1.2.0-201605+dfsg-4)
- alignment-free sequence comparison using spaced words
- spades (3.15.5+dfsg-7)
- assembleur génomique pour des ensembles de données de « single-cell » et « isolates »
- spaln (3.0.2+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.4.7+dfsg-1 [hppa, m68k, sh4, x32])
- alignement de transcriptions selon les épissures pour l’ADN génomique
- spaln-data (3.0.2+dfsg-2)
- splicing-aware transcript-alignment to genomic DNA (data)
- spass (3.9-1.1+b1 [riscv64], 3.9-1.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- démonstrateur automatique de théorème pour la logique du premier ordre avec égalité
- spatialite-bin (5.1.0a-1+b3 [riscv64], 5.1.0a-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- extension géospatiale pour SQLite – outils
- spd (1.3.0-1.1+b1 [riscv64], 1.3.0-1.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Synchrotron image corrections and azimuthal integration
- splash (3.10.1-2)
- Visualisation tool for Smoothed Particle Hydrodynamics simulation
- spoa (4.1.4-1)
- SIMD partial order alignment tool
- sprai (0.9.9.23+dfsg1-2+b1 [riscv64], 0.9.9.23+dfsg1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- single-pass sequencing read accuracy improver
- spread-phy (1.0.7+dfsg-5)
- analyze and visualize phylogeographic reconstructions
- spview (2.0.2-1)
- Spectrum Viewer
- squizz (0.99d+dfsg-3+b1 [riscv64], 0.99d+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- convertisseur pour les séquences génétiques et les alignements
- sra-toolkit (3.0.3+dfsg-6+b1 [amd64, arm64], 2.3.5-2+dfsg-1 [x32])
- utilities for the NCBI Sequence Read Archive
- sra-toolkit-libs-dev (2.3.5-2+dfsg-1) [debports]
- Development files for the NCBI SRA Toolkit's libraries
- sra-toolkit-libs0 (2.3.5-2+dfsg-1) [debports]
- Libraries for the SRA Toolkit
- srst2 (0.2.0-11 [alpha, amd64, arm64, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4, sparc64], 0.1.8-1 [hppa, x32])
- Short Read Sequence Typing for Bacterial Pathogens
- ssake (4.0.1-1)
- application de génomique pour assembler des millions de séquences très courtes d’ADN
- ssake-examples (4.0.1-1)
- example data for SSAKE, a genomic assembler of short reads
- sspace (2.1.1+dfsg-7)
- scaffolding pre-assembled contigs after extension
- ssshtest (0.0+git20220105.0d6df3d-1)
- stupid simple (ba)sh testing
- ssw-align (1.1-14+b1 [riscv64], 1.1-14 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Smith-Waterman aligner based on libssw
- stacks (2.66+dfsg-1+b1)
- pipeline for building loci from short-read DNA sequences
- staden (2.0.0+b11-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 2.0.0+b11-4+b1 [hppa])
- DNA sequence assembly (Gap4/Gap5), editing and analysis tools
- staden-common (2.0.0+b11-5)
- Architecture independent files for Staden
- staden-io-lib-examples (1.15.0-1.1)
- programs for manipulating DNA sequencing files (usage examples)
- staden-io-lib-utils (1.15.0-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.15.0-1.1 [m68k], 1.14.15-1 [hppa])
- programs for manipulating DNA sequencing files
- stardata-common (0.8+nmu1+b1 [riscv64], 0.8+nmu1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- cadriciel commun de gestion des paquets pour l’astronomie
- starpu-contrib-examples (1.4.3+dfsg-5+b1) [contrib]
- Task scheduler for heterogeneous multicore machines - exs
- starpu-examples (1.4.3+dfsg-5+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.4.3+dfsg-5 [hppa, m68k], 1.4.3+dfsg-2 [sh4])
- Task scheduler for heterogeneous multicore machines - exs
- stellarium (24.1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 23.4-2 [alpha, hppa], 0.22.2-1 [m68k, x32], 0.22.1-1 [ia64])
- générateur de ciel photo-réaliste en temps réel
- stellarium-data (24.1-1)
- Stellarium data files
- step (4:22.12.3-1+b2 [riscv64], 4:22.12.3-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 4:22.12.3-1 [alpha, hppa, m68k, sh4], 4:21.12.3-1 [x32], 4:21.08.0-1+b2 [ia64], 4:19.08.1-1 [sparc64])
- simulateur interactif pour la physique de KDE
- stiff (2.4.0-7+b1)
- conversion d’images scientifiques FITS dans le format TIFF
- stilts (3.4.9-5)
- Starlink Tables Infrastructure Library Tool Set
- stimfit (0.16.0-1.2+b4 [ppc64], 0.16.0-1.2+b1 [riscv64, sparc64], 0.16.0-1.2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, s390x, sh4, x32], 0.16.0-1+b2 [ia64])
- Programme pour visualiser et analyser des données d’électrophysiologie
- stringtie (2.2.1+ds-3+b1)
- assemble short RNAseq reads to transcripts
- subarch-select (0.2-1)
- Select among binaries based upon x86 microarchitecture support
- subread (2.0.6+dfsg-2+b1 [riscv64], 2.0.6+dfsg-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el], 1.4.6-p2+dfsg-2 [x32])
- boite à outils pour le traitement de données de séquençage de nouvelle génération
- subread-data (2.0.6+dfsg-2)
- data files for subread package
- suitename (0.4.130509+git20210223.ebb1325-1+b1 [riscv64], 0.4.130509+git20210223.ebb1325-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- categorize each suite in an RNA backbone
- sumaclust (1.0.36+ds-2+b1 [riscv64], 1.0.36+ds-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- fast and exact clustering of genomic sequences
- sumatra (1.0.36+ds-2+b1 [riscv64], 1.0.36+ds-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- fast and exact comparison and clustering of sequences
- sumo (1.18.0+dfsg-3+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 1.18.0+dfsg-3+b1 [alpha, ia64, sh4], 1.15.0+dfsg-1+b1 [x32], 1.15.0+dfsg-1 [m68k], 1.4.0+dfsg1-1+b1 [hppa])
- Simulation of Urban MObility (SUMO)
- surankco (0.0.r5+dfsg-4)
- Supervised Ranking of Contigs in de novo Assemblies
- surpyvor (0.5-2)
- modification of VCF files with SURVIVOR
- survex (1.4.7-4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 1.4.4-1+b3 [sparc64], 1.4.4-1+b1 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32], 1.2.42-1+b1 [ia64])
- logiciel de relevé et de cartographie de grotte
- survex-aven (1.4.7-4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 1.4.4-1+b3 [sparc64], 1.4.4-1+b1 [alpha, hppa, m68k, sh4, x32], 1.2.42-1+b1 [ia64])
- visionneur de levé de grotte sophistiqué pour Survex
- survivor (1.0.7-4+b1 [riscv64], 1.0.7-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- tool set for simulating/evaluating SVs
- svim (2.0.0-3)
- Structural variant caller for long sequencing reads
- swarm (3.1.4+dfsg-1)
- robust and fast clustering method for amplicon-based studies
- swarp (2.41.5-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, s390x], 2.41.5-1+b2 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, sh4, sparc64, x32])
- Resample and co-add together FITS images
- swe-standard-data (4.0-20221111-2)
- Swiss Ephemeris library (standard set of ephemeris files).
- sweed (3.2.1+dfsg-5+b1 [riscv64], 3.2.1+dfsg-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- assessment of SNPs for their evolutionary advantage
- syrthes (4.3.5+20200129-dfsg1-1+b3 [riscv64], 4.3.5+20200129-dfsg1-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 4.3.0-dfsg1-3 [sparc64], 4.3.0-dfsg1-2 [ia64])
- simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide
- syrthes-gui (4.3.5+20200129-dfsg1-1)
- simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide – interface graphique
- syrthes-tests (4.3.5+20200129-dfsg1-1)
- cas à tester pour SYRTHES
- syrthes-tools (4.3.5+20200129-dfsg1-1+b3 [riscv64], 4.3.5+20200129-dfsg1-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 4.3.0-dfsg1-3 [sparc64], 4.3.0-dfsg1-2 [ia64])
- simulations de thermique transitoire pour des géométries complexes de solide – outils
- t-coffee (13.45.0.4846264+really13.41.0.28bdc39+dfsg-1+b1 [riscv64], 13.45.0.4846264+really13.41.0.28bdc39+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- alignement multiple de séquences
- t-coffee-examples (13.45.0.4846264+really13.41.0.28bdc39+dfsg-1)
- exemples annotés pour l'utilisation de T-Coffee
- tabix (1.19+ds-1.1+b1)
- indexeur générique pour fichiers de positions de génome, délimités par des tabulations
- tandem-mass (1:201702011-1+b1 [amd64, riscv64], 1:201702011-1 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- logiciel de spectrométrie de masse pour l’identification de protéines
- tantan (49-2)
- masqueur de répétitions en tandem peu complexes pour bioséquences
- tcd-utils (20061127-2.1+b1 [riscv64], 20061127-2.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- convertisseur de fichiers TCD (Tide Constituent Database)
- tclfitsy (8.5+repack-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 8.5+repack-1+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- extension Tcl pour FITS
- terraintool (1.19-1)
- création de modèles de terrain au format survex ou therion à partir de données SRTM ou NASADEM
- theli (3.1.4-1+b6 [amd64, arm64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 3.1.4-1+b4 [alpha, riscv64], 3.1.4-1+b2 [m68k])
- pipeline de réduction des données d’images d’astronomie
- therion (6.2.1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 6.2.0-1+b1 [m68k], 6.2.0-1 [alpha, hppa], 6.1.8-1 [sh4], 5.5.1ds1-1 [x32])
- levé de cavité souterraine – logiciel de dessin en 2D et 3D
- therion-viewer (6.2.1-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 6.2.0-1+b1 [m68k], 6.2.0-1 [alpha, hppa], 6.1.8-1 [sh4], 5.5.1ds1-1 [x32])
- levé de grotte – visualisateur 3D pour les modèles de Therion
- theseus (3.3.0-14)
- superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance
- theseus-examples (3.3.0-14)
- superposition de macromolécules par maximum de vraisemblance – exemples
- thesias (3.1.1-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 3.1.1-1 [x32])
- test des effets d’haplotypes dans les études d’associations
- threeb (0.0~git20220106110332.a3144e0-6+b2 [riscv64], 0.0~git20220106110332.a3144e0-6+b1 [amd64, i386, m68k, s390x, sh4, sparc64, x32])
- 3B Microscopy Analysis Software - command-line tool
- threeb-imagej (0.0~git20220106110332.a3144e0-6+b2 [riscv64], 0.0~git20220106110332.a3144e0-6+b1 [amd64, i386, m68k, s390x, sh4, sparc64, x32])
- 3B Microscopy Analysis Software - ImageJ plugin
- tiddit (3.6.1+dfsg-1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, sh4], 3.6.1+dfsg-1 [x32], 2.12.2+dfsg-1+b1 [hppa, ppc64])
- structural variant calling
- tigr-glimmer (3.02b-6+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 3.02b-6 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Détection de gènes dans des archées et des bactéries
- timbl (6.5-3.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 6.5-3.1 [m68k, sh4])
- apprentissage automatique – Tilburg Memory Based Learner
- timblserver (1.14-3.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.14-3.1 [sh4])
- extensions de serveur pour TiMBL
- tiny-dnn (1.0.0a3+ds-4)
- header only deep learning framework in C++
- tipp (1.0+dfsg-3)
- tool for Taxonomic Identification and Phylogenetic Profiling
- tippecanoe (2.53.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 2.52.0-1 [x32])
- build vector tilesets from large collections of GeoJSON features
- tksao (8.5+repack-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 8.5+repack-1+b1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- Tk widgets for astronomical imaging and data visualization
- tm-align (20190822+dfsg-2+b1 [riscv64], 20190822+dfsg-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- alignement structurel de protéines
- tnseq-transit (3.3.4-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sh4], 3.3.3-1 [hppa, ppc64], 3.1.0-2 [alpha, x32], 2.3.2-1 [ia64, sparc64])
- statistical calculations of essentiality of genes or genomic regions
- tombo (1.5.1-6+b1 [riscv64], 1.5.1-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 1.5.1-4 [ia64, x32])
- identification of modified nucleotides from raw nanopore sequencing data
- topcat (4.9-1)
- Tool for OPerations on Catalogues And Tables
- tophat-recondition (1.4-3)
- post-processor for TopHat unmapped reads
- topp (2.6.0+cleaned1-4+b2 [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.6.0+cleaned1-4 [hppa, ia64, x32], 2.6.0+cleaned1-3+b5 [alpha], 2.6.0+cleaned1-3+b3 [m68k])
- ensemble de programmes implémentant The OpenMS Proteomic Pipeline
- topparser (1.3-3)
- Conversion utility from pockettopo to therion, for cave surveying
- toppic (1.5.3+dfsg1-1+b3 [riscv64], 1.5.3+dfsg1-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.5.3+dfsg1-1+b1 [alpha, hppa], 1.5.3+dfsg1-1 [m68k])
- caractérisation et identification des protéoformes (approche descendante) – programmes
- toppic-common (1.5.3+dfsg1-1)
- Top-down proteoform identification and characterization (common data)
- toppred (1.10-10+b1 [riscv64], 1.10-10 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 1.10-9 [x32])
- transmembrane topology prediction
- tortoize (2.0.11-1+b1 [riscv64, sparc64], 2.0.11-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32], 2.0.5-2 [hppa])
- Application to calculate ramachandran z-scores
- toulbar2 (1.2.1+dfsg-0.1)
- Exact combinatorial optimization for Graphical Models
- toulbar2-doc (1.2.1+dfsg-0.1)
- Exact combinatorial optimization for Graphical Models - documentation
- trace2dbest (3.0.1-2)
- bulk submission of chromatogram data to dbEST
- trace2dbest-doc (3.0.1-2)
- Documentation and sample files for trace2dbest
- tracetuner (3.0.6~beta+dfsg-3+b1 [riscv64], 3.0.6~beta+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- interpretation of DNA Sanger sequencing data
- transdecoder (5.7.1-2)
- recherche de séquences codantes dans des séquences de transcriptions d’ARN
- transfuse (0.5.8-1+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.5.8-1+b2 [riscv64])
- Runs formatted documents through transformations/translation
- transrate-tools (1.0.0-5+b1 [riscv64], 1.0.0-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- assistant pour Transrate
- transtermhp (2.09-5+b1 [riscv64], 2.09-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- trouve les terminateurs de transcription dans les génomes bactériens
- travis (220729-1+b1 [riscv64], 220729-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- analyse et visualisation de trajectoires
- tree-ppuzzle (5.3~rc16+dfsg-9+b2 [riscv64], 5.3~rc16+dfsg-9+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 5.3~rc16+dfsg-9 [sh4])
- Reconstruction d'arbres phylogéniques par ressemblance maximum
- tree-puzzle (5.3~rc16+dfsg-9+b2 [riscv64], 5.3~rc16+dfsg-9+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 5.3~rc16+dfsg-9 [sh4])
- reconstruction d’arbres phylogénétiques par la vraisemblance maximale
- treeview (1.2.0+dfsg-1)
- réimplémentation en Java de TreeView de Michael Eisen
- treeviewx (0.5.1+git20100823.7e4d0e9-4+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 0.5.1+git20100823.7e4d0e9-4+b3 [riscv64], 0.5.1+git20100823.7e4d0e9-4+b2 [alpha, hppa, sh4], 0.5.1+git20100823.7e4d0e9-4 [ia64, m68k, x32])
- affiche et imprime les arbres phylogénétiques
- trf (4.09.1-6+b1 [riscv64], 4.09.1-6 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- locate and display tandem repeats in DNA sequences
- trf-examples (4.09.1-6)
- locate and display tandem repeats in DNA sequences (examples)
- triangle-bin (1.6-6) [non-free]
- High-quality 2-D mesh generator -- binary programs
- trim-galore (0.6.10-1)
- automate quality and adapter trimming for DNA sequencing
- trimmomatic (0.39+dfsg-2)
- outil flexible de découpage de lecture pour les données Illumina NGS
- trinculo (0.96+dfsg-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.96+dfsg-4 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- toolkit to carry out genetic association for multi-category phenotypes
- trinityrnaseq (2.15.1+dfsg-5+b1 [amd64, arm64, ppc64el, riscv64], 2.15.1+dfsg-2 [alpha, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- assemblage de novo de séquences d’Arn
- trinityrnaseq-examples (2.15.1+dfsg-5+b1)
- assemblage de novo de séquences d’Arn – fichiers de test et d’exemple
- trnascan-se (2.0.12+ds-1) [non-free]
- detection of transfer RNA genes in genomic sequence
- trnascan-se-common (2.0.12+ds-1) [non-free]
- detection of transfer RNA genes in genomic sequence (common files)
- tunnelx (20190701-1)
- logiciel pour le levé de caverne
- tvc (5.0.3+git20151221.80e144e+dfsg-5+b1)
- genetic variant caller for Ion Torrent sequencing platforms
- twms (0.07z+git20201202+bb7c3f8-2)
- minuscule service de cartographie web
- twopaco (1.0.0+dfsg-1+b1 [riscv64], 1.0.0+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32])
- construction des graphes de de Bruijn à partir de plusieurs génomes complets
- ubertooth (2018.12.R1-5.1+b1 [riscv64], 2018.12.R1-5.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- plateforme de développement pour sans fil 2,4 GHz et pour expérimentation Bluetooth
- ubertooth-firmware (2018.12.R1-5.1)
- micrologiciels pour Ubertooth
- ubertooth-firmware-source (2018.12.R1-5.1)
- code source du micrologiciel d’Ubertooth
- uc-echo (1.12-18+b1 [riscv64], 1.12-18 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64], 1.12-16 [x32])
- algorithme de correction d'erreurs pour les lectures courtes réalisées à partir de NGS
- ucto (0.21.1-2.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 0.21.1-2.1 [sh4])
- analyseur lexical pour Unicode
- uctodata (0.8-2)
- fichiers de données pour Ucto
- ucx-utils (1.16.0+ds-5)
- Utilities for the UCX messaging library
- ugene (49.1+dfsg-2+b1)
- integrated bioinformatics toolkit
- ugene-data (49.1+dfsg-2)
- required data for UGENE - integrated bioinformatics toolkit
- uhd-doc (4.6.0.0+ds1-5.1)
- universal hardware driver for Ettus Research products - doc
- uhd-host (4.6.0.0+ds1-5.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 4.3.0.0+ds1-5 [sh4])
- pilote matériel universel pour les produits Ettus Research – applications hôtes
- umap-learn (0.5.4+dfsg-1)
- Uniform Manifold Approximation and Projection
- umis (1.0.9-1+b1 [riscv64], 1.0.9-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, sh4, x32], 1.0.3-1 [hppa, ppc64, sparc64])
- tools for processing UMI RNA-tag data
- umis-examples (1.0.9-1)
- tools for processing UMI RNA-tag data (examples)
- uncalled (2.3+ds-1+b3 [riscv64], 2.3+ds-1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 2.3+ds-1+b1 [alpha, ia64, sh4])
- Utility for Nanopore Current Alignment to Large Expanses of DNA
- unicycler (0.5.0+dfsg-1)
- hybrid assembly pipeline for bacterial genomes
- unicycler-data (0.5.0+dfsg-1)
- hybrid assembly pipeline for bacterial genomes (data package)
- unifrac-tools (1.4-3+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64], 1.4-3+b1 [alpha, ia64, m68k, x32], 1.4-3 [sh4])
- high-performance phylogenetic diversity calculations (binaries)
- unihedron-device-manager (1.0.0.337-1+b1)
- gestionnaire de périphériquec d’Unihedron (UDM)
- unikmer (0.19.1-1+b6 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 0.19.1-1+b4 [riscv64])
- Toolkit for nucleic acid k-mer analysis
- units-filter (4.2.1-1+b1 [riscv64], 4.2.1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 4.2-3 [x32], 4.0-1 [ia64, m68k, sh4, sparc64])
- analyseur d'expressions concernant des valeurs physiques
- units-master (4.2.1-1)
- convertisseur d’unité puissant avec une interface graphique
- v-sim (3.7.2-9+b2 [riscv64], 3.7.2-9+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 3.7.2-9 [sh4])
- visualisation de structures atomiques
- v-sim-common (3.7.2-9)
- visualisation de structures atomiques – fichiers de prise en charge
- v-sim-plugins (3.7.2-9+b2 [riscv64], 3.7.2-9+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 3.7.2-9 [sh4])
- greffons pour V_Sim (paquet de visualisation 3D)
- varna (3-93+ds-5)
- appliquette de visualisation d’ARN
- varscan (2.4.3+dfsg-4) [non-free]
- variant detection in next-generation sequencing data
- vcfanno (0.3.5+ds-2)
- annotate a VCF with other VCFs/BEDs/tabixed files
- vcfanno-examples (0.3.5+ds-2)
- examples for vcfanno: annotate a VCF with other VCFs/BEDs/tabixed files
- vcftools (0.1.16-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 0.1.16-3 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- ensemble d'outils pour travailler avec les fichiers VCF
- vdjtools (1.2.1+git20190311+repack-2) [non-free]
- framework for post-analysis of B/T cell repertoires
- velvet (1.2.10+dfsg1-8+b1 [riscv64], 1.2.10+dfsg1-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- assembleur de séquences d'acides nucléiques pour de très courtes lectures
- velvet-example (1.2.10+dfsg1-8)
- données d’exemples pour l’assembleur génomique Velvet
- velvet-long (1.2.10+dfsg1-8+b1 [riscv64], 1.2.10+dfsg1-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- assembleur de séquences d’acide nucléique pour des très courtes lectures, version longue
- velvet-tests (1.2.10+dfsg1-8)
- données de test pour l’assembleur de séquences Velvet
- velvetoptimiser (2.2.6-5)
- optimisation automatique de paramètres pour Velvet, assembleur génomique de type de novo
- veryfasttree (4.0.3+dfsg-1+b1 [riscv64], 4.0.3+dfsg-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Speeding up the estimation of phylogenetic trees from sequences
- veusz (3.6.2-1)
- application de préparations scientifique 2D et 3D en mode graphique
- veusz-helpers (1.21.1-1+b1) [debports]
- Architecture-specific helper module for Veusz
- vg (1.30.0+ds-1+b2)
- tools for working with genome variation graphs
- vg-docs (1.30.0+ds-1)
- tools for working with genome variation graphs -- docs
- vienna-rna (2.5.1+dfsg-1+b2 [riscv64], 2.5.1+dfsg-1+b1 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, s390x]) [non-free]
- RNA sequence analysis
- virulencefinder (2.0.5-1)
- identify virulence genes in total or partial sequenced isolates of bacteria
- virulencefinder-examples (2.0.5-1)
- example data for virulencefinder
- visp-images-data (3.6.0-1)
- bibliothèque pour asservissement visuel – ensembles de données de référence
- vistrails (3.0~git+9dc22bd.dfsg.1-2)
- boîte à outils de visualisation de flux de travail scientifique
- vitables (3.0.2-4)
- outil graphique pour éditer ou parcourir des fichiers PyTables et HDF5
- vmatch (2.3.1+dfsg-9+b1 [riscv64], 2.3.1+dfsg-9 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32])
- large scale sequence analysis software
- voro++ (0.5+revert-to-0.4.6+dfsg1-1+b1 [riscv64], 0.5+revert-to-0.4.6+dfsg1-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- library for the computation of the Voronoi diagram
- voro++-examples (0.5+revert-to-0.4.6+dfsg1-1)
- library for the computation of the Voronoi diagram (examples)
- voronota (1.22.3149-2+b1 [riscv64], 1.22.3149-2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Voronoi diagram-based tool to find atom contacts
- votca (2024-2+b3 [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2024-2+b1 [ppc64, sparc64])
- Molecular dynamics analysis - coarse-graining and charge transport
- votca-data (2024-2)
- VOTCA molecular dynamics analysis - basis sets and scripts
- votca-tutorials (2024-2)
- VOTCA molecular dynamics analysis - tutorials
- vowpal-wabbit (8.6.1.dfsg1-1+b3 [amd64, i386], 8.6.1.dfsg1-1+b2 [x32], 7.3-1.1+b3 [alpha, ppc64], 7.3-1.1+b2 [armel, armhf, hppa, m68k, s390x, sh4, sparc64], 7.3-1.1+b1 [arm64, mips64el, ppc64el])
- algorithme rapide et extensible d’apprentissage automatique en ligne
- vsearch (2.27.0-1)
- outil pour le traitement de séquences métagénomiques
- vsearch-examples (2.27.0-1)
- Test Data for vsearch tool for processing metagenomic sequences
- vt (0.57721+ds-3+b2 [hppa, m68k, riscv64, sh4, sparc64], 0.57721+ds-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32])
- toolset for short variant discovery in genetic sequence data
- vt-examples (0.57721+ds-3)
- toolset for short variant discovery in genetic sequence data (examples)
- wannier90 (3.1.0+ds-8)
- Maximally Localized Wannier Functions - executables
- wannier90-data (3.1.0+ds-8)
- Maximally Localized Wannier Functions - documentation and examples
- wcslib-tools (8.2.2+ds-3+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 8.2.2+ds-3+b1 [alpha, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32], 8.2.2+ds-3 [hppa])
- Command line tools utilizing wcslib
- wcstools (3.9.7-1.1)
- gestion du WCS d’une image FITS
- weightwatcher (1.12+dfsg-3+b1 [riscv64], 1.12+dfsg-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- association de cartes et polygones pour le traitement d’images astronomiques
- weka (3.6.14-4)
- algorithmes d'apprentissage automatique pour l’exploration de données
- wham-align (0.1.5-8+b1 [riscv64], 0.1.5-8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, x32])
- méthode Wisconsin d’alignement à haut débit
- wigeon (20101212+dfsg1-6)
- réimplémentation de l'utilitaire de détection d'anomalies de l'ADN 16S Pintail
- wise (2.4.1-24)
- comparaison de biopolymères, tels les séquences d'ADN et de protéines
- wsclean (3.4-1+b3 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64el, riscv64, s390x], 3.4-1+b2 [alpha, ia64, m68k, ppc64, sparc64, x32], 3.4-1+b1 [hppa, sh4])
- imageur générique rapide à grand champ pour l’interférométrie
- wtdbg2 (2.5-9 [amd64], 2.5-8 [ia64])
- assembleur de séquences de novo pour les lectures longues bruitées
- wtdbg2-examples (2.5-9)
- Examples for wtdbg - de novo sequence assembler
- wxastrocapture (1.8.1+git20140821.796e1a1+dfsg-2+b4 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x], 1.8.1+git20140821.796e1a1+dfsg-2+b3 [riscv64], 1.8.1+git20140821.796e1a1+dfsg-2+b2 [sh4], 1.8.1+git20140821.796e1a1+dfsg-2 [hppa, m68k, x32])
- Windows linuX Astronomy Capture
- x13as (1.1-b60-1+b1 [riscv64], 1.1-b60-1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, s390x]) [non-free]
- seasonal adjustment software for modeling time series
- xbs (0-11+b1 [riscv64], 0-11 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- modèles 3D et animations de molécules
- xcas (1.9.0.93+dfsg2-2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, riscv64], 1.6.0.25+dfsg1-2+b1 [m68k], 1.6.0.25+dfsg1-2 [alpha], 1.5.0.87+dfsg1-7 [ppc64, sparc64], 1.2.3.57+dfsg1-2 [sh4])
- système de calcul formel – calculateur graphique et en console
- xcrysden (1.6.2-4+b1 [riscv64], 1.6.2-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- visualisation de structure cristalline et moléculaire
- xcrysden-data (1.6.2-4)
- visualisation de structure cristalline et moléculaire – fichiers de données
- xdrawchem (1:1.11.0-4+b2 [riscv64], 1:1.11.0-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 1:1.11.0-4 [alpha])
- éditeur de structures chimiques et de réactions
- xeus-python-dev (0.15.10+~0.6.1-2+b1)
- Native jupyter kernel for python (headers)
- xfoil (6.99.dfsg+1-3+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 6.99.dfsg+1-3 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- programme d’analyse et de conception de profil d'élément aérodynamique subsonique
- xgboost (2.0.3-1+b1)
- Scalable and Flexible Gradient Boosting (Executable)
- xgterm (2.1+dfsg-2)
- Terminal emulator to work with IRAF
- ximtool (2.1+dfsg-2)
- Interactive image display program for the X Window System
- xmakemol (5.16-10+b2)
- programme pour visualiser les systèmes atomiques et moléculaires
- xmakemol-gl (5.16-10+b2)
- programme pour visualiser les systèmes atomiques et moléculaires – OpenGL
- xmds2 (3.1.0+dfsg2-8)
- simulateur extensible multidimensionnel
- xmpsolve (3.2.1-10.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 3.2.1-10.1 [ia64, sh4, sparc64])
- résolveur multiprécision de polynômes – version graphique
- xpa-tools (2.1.20-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 2.1.20-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sh4, sparc64, x32])
- outils pour une communication ininterrompue entre des programmes Unix
- xplot (1.19-9.1+b2 [riscv64, sh4], 1.19-9.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32])
- simple traceur de données en coordonnées cartésiennes sur un écran
- xplot-xplot.org (0.90.7.1-4+b1 [amd64, riscv64], 0.90.7.1-4 [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Outil rapide pour tracer et visualiser de nombreuses données
- xpore (2.1-2)
- Nanopore analysis of differential RNA modifications
- xppaut (6.11b+1.dfsg-1.1+b1 [riscv64], 6.11b+1.dfsg-1.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- résolution de différentes sortes d’équation avec Phase Plane Plus Auto
- xpython (0.15.10+~0.6.1-2+b1)
- Native jupyter kernel for python (binary)
- xtb (6.7.0-1)
- semiempirical extended tight-binding program package
- xtide (2.15.2-1.1)
- prévisions des courants et marées
- xtide-coastline (20020202-1.3)
- données de littoral pour xtide
- xtide-data (20191229-1.1)
- données d’harmoniques pour xtide
- xtide-data-nonfree (20100529-1.1) [non-free]
- Harmonics data for xtide (Canada, Netherlands, Germany and UK)
- xtpcpp (0.4.54-1)
- paquet de transition de xtpcpp vers i2masschroq
- xtpcpp-tools (0.4.54-1)
- paquet de transition pour xtpcpp-tools vers i2masschroq-tools
- xyscan (4.66-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 4.64-2 [hppa], 4.64-1 [ia64, x32], 4.50-1 [m68k, sh4], 4.30-2+b3 [sparc64])
- pilleur de données pour les scientifiques
- yade (2024.02a-1+b2 [amd64, arm64], 2018.02b-5 [ppc64], 2018.02b-1 [x32], 2018.02a-2 [hppa], 2017.01a-9 [sparc64], 1.00.0-2 [alpha])
- plateforme pour la modélisation d'élément discret
- yagv (0.4~20171211.r234ef16+dfsg-2)
- encore un autre visionneur de G-code
- yaha (0.1.83-3+b1 [riscv64], 0.1.83-3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- find split-read mappings on single-end queries
- yale (5.0.95-3) [non-free]
- stellar data set from the Yale Bright Star Catalog
- yanagiba (1.0.0-5)
- filter low quality Oxford Nanopore reads basecalled with Albacore
- yanosim (0.1-5+b1 [riscv64], 0.1-5 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64el, sh4, x32], 0.1-2 [hppa, ppc64, sparc64])
- simulateur de lectures pour des ensembles de données DRS de nanopore
- yorick (2.2.04+dfsg1-12+b2 [m68k, riscv64], 2.2.04+dfsg1-12+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- langage interprété et graphiques scientifiques
- yorick-av (0.0.6-1+b3 [ppc64, riscv64, sparc64, x32], 0.0.6-1+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64el, s390x], 0.0.6-1+b1 [m68k, sh4], 0.0.6-1 [ia64])
- production de vidéos dans divers formats depuis Yorick
- yorick-cubeview (2.2-2.2)
- afficheur de données 3D FITS spécialisé en imagerie spectrale
- yorick-curses (0.1-6+b3 [ppc64], 0.1-6+b2 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.1-6+b1 [ia64])
- Interface avec la bibliothèque (n)curses pour le langage Yorick
- yorick-data (2.2.04+dfsg1-12)
- bibliothèque interprétée pour le langage Yorick
- yorick-dev (2.2.04+dfsg1-12+b2 [m68k, riscv64], 2.2.04+dfsg1-12+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- fichiers de développement pour le langage interprété Yorick
- yorick-full (2.2.04+dfsg1+full+b1 [amd64, riscv64], 2.2.04+dfsg1+full [alpha, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- installation complète de l'interprèteur Yorick et ses greffons
- yorick-gl (1.1+cvs20070922+dfsg-6.1+b2 [ppc64], 1.1+cvs20070922+dfsg-6.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.1+cvs20070922+dfsg-6.1 [ia64])
- gestion graphique OpenGL 3D pour le langage Yorick
- yorick-gy (0.0.5-2+b2 [riscv64], 0.0.5-2+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- introspection GObject et interfaces Gtk pour Yorick
- yorick-gyoto (2.0.2-1.1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64], 2.0.2-1 [hppa], 1.4.4-8+b4 [sh4], 1.4.4-8+b3 [alpha], 1.2.0-4+b5 [x32])
- intégration géodésique de la relativité générale pour le langage Yorick
- yorick-hdf5 (0.8.0-8+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x, x32], 0.8.0-8+b2 [m68k, ppc64, sparc64], 0.8.0-8+b1 [sh4])
- Interface avec le format de fichiers HDF5 pour le langage Yorick
- yorick-imutil (0.5.7-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 0.5.7-3 [ia64])
- routines de manipulations d'images rapides pour le langage Yorick
- yorick-mira (1.1.0+git20170124.3bd1c3~dfsg1-2)
- reconstruction d'image d'interferométrie optique avec Yorick
- yorick-ml4 (0.6.0-4+b1 [riscv64], 0.6.0-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- prise en charge du format de fichier Matlab pour le langage Yorick
- yorick-mpeg (0.1-4+b1 [riscv64], 0.1-4 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- gestion de la sortie MPEG pour le langage Yorick
- yorick-mpy-common (2.2.04+dfsg1-12)
- Message Passing Yorick - fichiers communs
- yorick-mpy-mpich2 (2.2.04+dfsg1-12+b2 [m68k], 2.2.04+dfsg1-12+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- Message Passing Yorick - basé sur MPICH2
- yorick-mpy-openmpi (2.2.04+dfsg1-12+b1)
- Message Passing Yorick - basé sur OpenMPI
- yorick-optimpack (1.3.2+dfsg+1.4.0-1+b1 [riscv64], 1.3.2+dfsg+1.4.0-1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- optimization of large scale problems for the Yorick language
- yorick-soy (1.4.0-3+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64, x32], 1.4.0-3 [ia64])
- opérations sur les matrices creuses pour le langage Yorick
- yorick-svipc (0.16-5+b8 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64], 0.16-5+b7 [riscv64, sh4], 0.16-5+b4 [x32])
- interprocess communication (shared memory...) for Yorick
- yorick-yeti (6.4.0-1.1+b2 [riscv64], 6.4.0-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 6.4.0-1.1 [m68k, sh4])
- module utilitaire pour le langage Yorick
- yorick-yeti-fftw (6.4.0-1.1+b2 [riscv64], 6.4.0-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 6.4.0-1.1 [m68k, sh4])
- greffon FFT pour le langage Yorick
- yorick-yeti-regex (6.4.0-1.1+b2 [riscv64], 6.4.0-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 6.4.0-1.1 [m68k, sh4])
- expressions rationnelles POSIX pour le langage Yorick
- yorick-yeti-tiff (6.4.0-1.1+b2 [riscv64], 6.4.0-1.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sparc64, x32], 6.4.0-1.1 [m68k, sh4])
- lecture du format d’image TIFF pour le langage Yorick
- yorick-ygsl (1.2.1-1+b5 [mips64el], 1.2.1-1+b3 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, m68k, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sparc64, x32], 1.2.1-1+b2 [ia64, sh4])
- greffon pour des fonctions GSL spéciales, pour le langage Yorick
- yorick-ynfft (1.0.3-1+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x], 1.0.3-1 [alpha, hppa, ia64, m68k, sh4, sparc64, x32])
- transformation de Fourier rapide non uniforme pour Yorick
- yorick-yutils (1.5.2-2)
- divers utilitaires pour le langage Yorick
- yorick-z (1.2.0+cvs20080115-5.1+b2 [mips64el, riscv64], 1.2.0+cvs20080115-5.1+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- prise en charge de zlib, jpeg et png par le langage Yorick
- z3 (4.8.12-3.1+b2 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, mips64el, ppc64el, riscv64, s390x], 4.8.12-3.1 [alpha, hppa, ia64, m68k, ppc64, sparc64, x32])
- justificateur de théorème de Microsoft Research
- z88 (13.0.0+dfsg2-6+b2 [riscv64], 13.0.0+dfsg2-6+b1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32])
- programme d'analyse d'éléments finis - exécution
- z88-data (13.0.0+dfsg2-6)
- programme d'analyse d'éléments finis - données
- zegrapher (3.1.1-4+b2 [riscv64], 3.1.1-4+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, sh4, sparc64, x32], 3.1.1-4 [alpha, m68k])
- tracé de courbes planes pour des fonctions et des suites mathématiques
- zfp (1.0.1-3.1 [alpha, amd64, arm64, armel, armhf, hppa, i386, ia64, m68k, mips64el, ppc64, ppc64el, riscv64, s390x, sh4, sparc64], 1.0.0-7 [x32])
- tableaux compressés de nombres en virgule flottante à taux fixe – exécutable
- ztex-bmp (20120314-2+b1 [amd64, arm64, armel, armhf, i386, ppc64], 20120314-2 [m68k, ppc64el, sparc64])
- analyseur universel de macro
