Paquet : ballview (1.5.0+git20180813.37fc53c-11 et autres) [debports]

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modélisation moléculaire (libre) et outil graphique moléculaire

BALLView propose une visualisation rapide des structures moléculaires, des méthodes de mécanique moléculaire (minimisation, simulation dynamique moléculaire utilisant les champs de force « Assisted Model Building with Energy Refinement » et « Chemistry at HARvard Macromolecular Mechanics ») à l'aide de la technologie OpenGL, un calcul et une visualisation des propriétés électrostatiques (méthode « Finite Difference Poisson-Boltzmann ») et des fonctionnalités d'édition moléculaire.

BALLView peut être considéré comme une interface graphique utilisateur basée sur BALL (« Biochemical Algorithms Library »), en se concentrant sur les demandes les plus courantes de la chimie des protéines et des biophysiciens en particulier. Il est développé par les groupes de Hans-Peter Lenhof (Université de Saarland, Sarrebruck, Allemagne) et d'Oliver Kohlbacher (Université de Tübingen, Allemagne). BALL est un framework applicatif écrit en C++ qui a été spécifiquement conçu pour le développement rapide de logiciels pour la modélisation moléculaire et le calcul de la biologie moléculaire. Il propose de nombreuses structures de données ainsi que des cours de mécanique moléculaire, des méthodes avancées de résolution, la comparaison et l'analyse de structures de protéines, l'import/export de fichiers et la visualisation.

Autres paquets associés à ballview

• dep: libball1.5 (>= 1.5.0+git20180813.37fc53c)

  bibliothèque d'algorithmes de biochimie

• dep: libballview1.5 (>= 1.5.0+git20180813.37fc53c)

  bibliothèque d'algorithmes de biochimie, environnement applicatif pour VIEW

• dep: libc6 (>= 2.37)

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0)

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libglew2.2 (>= 2.2.0-4+b1)

  extension Wrangler OpenGL –⋅environnement d'exécution

• dep: libqt5core5t64 (>= 5.15.1)

  module principal de QT⋅5

• dep: libqt5gui5t64 (>= 5.0.2)

  module Qt⋅5 d'interface graphique

  ou libqt5gui5-gles (>= 5.0.2)

  Qt 5 GUI module — OpenGL ES variant

• dep: libqt5opengl5t64 (>= 5.0.2)

  Qt 5 OpenGL module

• dep: libqt5widgets5t64 (>= 5.0.2)

  module de widgets de Qt⋅5

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

Télécharger ballview

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Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
sh4 (portage non officiel)	1.5.0+git20180813.37fc53c-11+b2	198,4 ko	543,0 ko	[liste des fichiers]