Paquet : vt (0.57721+ds-3 et autres)

[ Paquet source : vt  ]

toolset for short variant discovery in genetic sequence data

vt is a variant tool set that discovers short variants from Next Generation Sequencing data.

Vt-normalize is a tool to normalize representation of genetic variants in the VCF. Variant normalization is formally defined as the consistent representation of genetic variants in an unambiguous and concise way. In vt a simple general algorithm to enforce this is implemented.

Autres paquets associés à vt

• dep: libbz2-1.0 [sparc64]

  Bibliothèque de compression de fichiers (tri de block haute qualité)

• dep: libc6 (>= 2.34) [non alpha, ia64, sh4]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb

  dep: libc6 (>= 2.37) [sh4]

• dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]

  bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
  un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb

  dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]

• dep: libcurl3t64-gnutls (>= 7.16.2) [sparc64]

  bibliothèque de transfert par URL côté client et simple d'utilisation - avec GnuTLS

• dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, i386, mips64el, ppc64, ppc64el, s390x, x32]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

  dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64, sh4, sparc64]

  dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armel, armhf]

  dep: libgcc-s1 (>= 4.2) [ia64]

• dep: libgcc-s2 (>= 4.2.1) [m68k]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libgcc-s4 (>= 4.1.1) [hppa]

  bibliothèque de prise en charge de GCC

• dep: libhts3t64 (>= 1.17)

  C library for high-throughput sequencing data formats

• dep: liblzma5 (>= 5.1.1alpha+20110809) [sparc64]

  librairie de compression au format XZ

• dep: libpcre2-8-0 (>= 10.22)

  nouvelle bibliothèque d'expressions rationnelles compatibles Perl –⋅fichiers d'exécution⋅8⋅bits

• dep: libssl3t64 (>= 3.0.0) [sparc64]

  trousse à outils SSL - bibliothèques partagées

• dep: libstdc++6 (>= 13.1)

  bibliothèque standard C++ de GNU v3

• dep: libsvm3 (>= 3.21+ds) [sparc64]

  library implementing support vector machines

• dep: libunwind8 [ia64]

  bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable

• dep: r-base-core

  noyau de GNU R, un système de calculs statistiques et de graphiques

• dep: r-mathlib (>= 4.3.3) [sparc64]

  bibliothèque mathématique autonome de GNU R

• dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [sparc64]

  Bibliothèque de compression - binaires

Télécharger vt

Télécharger pour toutes les architectures proposées

Architecture	Version	Taille du paquet	Espace occupé une fois installé	Fichiers
alpha (portage non officiel)	0.57721+ds-3+b1	694,3 ko	3 221,0 ko	[liste des fichiers]
amd64	0.57721+ds-3+b1	821,5 ko	2 902,0 ko	[liste des fichiers]
arm64	0.57721+ds-3+b1	667,7 ko	2 578,0 ko	[liste des fichiers]
armel	0.57721+ds-3+b1	637,2 ko	2 361,0 ko	[liste des fichiers]
armhf	0.57721+ds-3+b1	657,9 ko	1 661,0 ko	[liste des fichiers]
hppa (portage non officiel)	0.57721+ds-3+b2	695,5 ko	2 646,0 ko	[liste des fichiers]
i386	0.57721+ds-3+b1	826,5 ko	3 065,0 ko	[liste des fichiers]
ia64 (portage non officiel)	0.57721+ds-3+b1	906,8 ko	5 619,0 ko	[liste des fichiers]
m68k (portage non officiel)	0.57721+ds-3+b2	735,5 ko	2 777,0 ko	[liste des fichiers]
mips64el	0.57721+ds-3+b1	604,5 ko	3 505,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64 (portage non officiel)	0.57721+ds-3+b1	702,2 ko	3 218,0 ko	[liste des fichiers]
ppc64el	0.57721+ds-3+b1	726,7 ko	3 090,0 ko	[liste des fichiers]
riscv64	0.57721+ds-3+b2	803,1 ko	2 342,0 ko	[liste des fichiers]
s390x	0.57721+ds-3+b1	757,8 ko	2 834,0 ko	[liste des fichiers]
sh4 (portage non officiel)	0.57721+ds-3+b2	931,7 ko	2 642,0 ko	[liste des fichiers]
sparc64 (portage non officiel)	0.57721+ds-3+b2	597,0 ko	3 097,0 ko	[liste des fichiers]
x32 (portage non officiel)	0.57721+ds-3+b1	822,2 ko	2 813,0 ko	[liste des fichiers]