Paquet : blasr (5.3.5+dfsg-6 et autres)
Liens pour blasr
Ressources Debian :
- Rapports de bogues
- Developer Information
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- Suivis des correctifs pour Debian
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Responsables :
Ressources externes :
- Page d'accueil [github.com]
Paquets similaires :
correspondance de lectures de séquençage de molécules simples
BLASR (« Basic local alignment with successive refinement ») est une méthode pour mettre en correspondance des lectures de séquençage de molécules simples avec un génome de référence. De telles lectures sont longues de plusieurs milliers de bases et les divergences entre elles et le génome sont dominées par les erreurs d'insertion et de suppression.
Autres paquets associés à blasr
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- dep: libblasr [x32]
- outils pour l'alignement de lectures PacBio sur des séquences cibles
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- dep: libblasr5.3.5 (>= 5.3.5+dfsg) [non hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- outils pour l'alignement de lectures PacBio sur des séquences cibles
-
- dep: libc6 (>= 2.16) [x32]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6-udeb
- dep: libc6 (>= 2.17) [hppa, ppc64]
- dep: libc6 (>= 2.28) [sh4]
- dep: libc6 (>= 2.34) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el, riscv64]
- dep: libc6 (>= 2.4) [m68k]
-
- dep: libc6.1 (>= 2.34) [alpha]
- bibliothèque C GNU : bibliothèques partagées
un paquet virtuel est également fourni par libc6.1-udeb
- dep: libc6.1 (>= 2.37) [ia64]
-
- dep: libgcc-s1 (>= 3.0) [amd64, arm64, mips64el, ppc64el]
- bibliothèque de prise en charge de GCC
- dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [alpha, riscv64]
-
- dep: libgcc1 (>= 1:3.0) [x32]
- Paquet indisponible
- dep: libgcc1 (>= 1:3.4) [sh4]
-
- dep: libgcc2 (>= 4.2.1) [m68k]
- Paquet indisponible
-
- dep: libhdf5-10 [hppa, ppc64]
- Paquet indisponible
-
- dep: libhdf5-100 [x32]
- Paquet indisponible
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- dep: libhdf5-cpp-100 (>= 1.10.0) [x32]
- Paquet indisponible
-
- dep: libhdf5-cpp-103 (>= 1.10.1) [m68k, sh4]
- HDF5 - C++ runtime files - serial version (transitional package)
-
- dep: libhdf5-cpp-103-1 (>= 1.10.5) [non hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- HDF5 - C++ runtime files - serial version
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- dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.15-patch1) [ppc64]
- Paquet indisponible
- dep: libhdf5-cpp-11 (>= 1.8.16) [hppa]
-
- dep: libpbbam0.23.0 (>= 0.23.0+dfsg) [m68k, sh4]
- Paquet indisponible
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- dep: libpbbam2.4.0 (>= 2.4.0+dfsg) [non hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- Pacific Biosciences binary alignment/map (BAM) library
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- dep: libpbcopper2.3.0 (>= 2.3.0+dfsg) [non hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- data structures, algorithms, and utilities for C++ applications
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- dep: libpbdata [x32]
- tools for handling PacBio sequences
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- dep: libpbihdf [x32]
- tools for handling PacBio hdf5 files
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- dep: libpbseq [m68k, sh4]
- library for analyzing PacBio sequencing data
- dep: libpbseq (>= 5.3.5+dfsg-4~) [non hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
-
- dep: libstdc++6 (>= 13.1) [non hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
- bibliothèque standard C++ de GNU v3
- dep: libstdc++6 (>= 5.2) [hppa, m68k, ppc64, sh4, x32]
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- dep: libunwind8 [ia64]
- bibliothèque pour déterminer la chaîne d'appel d'un programme –⋅exécutable
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- dep: zlib1g (>= 1:1.1.4) [hppa, ppc64, x32]
- Bibliothèque de compression - binaires
Télécharger blasr
Architecture | Version | Taille du paquet | Espace occupé une fois installé | Fichiers |
---|---|---|---|---|
alpha (portage non officiel) | 5.3.5+dfsg-6+b4 | 211,9 ko | 744,0 ko | [liste des fichiers] |
amd64 | 5.3.5+dfsg-6+b3 | 219,0 ko | 664,0 ko | [liste des fichiers] |
arm64 | 5.3.5+dfsg-6+b3 | 190,0 ko | 616,0 ko | [liste des fichiers] |
hppa (portage non officiel) | 0~20150724+git3ca7fe8-1+b2 | 1 423,6 ko | 6 078,0 ko | [liste des fichiers] |
ia64 (portage non officiel) | 5.3.5+dfsg-6+b4 | 271,0 ko | 1 226,0 ko | [liste des fichiers] |
m68k (portage non officiel) | 5.3.3+dfsg-1+b1 | 180,6 ko | 591,0 ko | [liste des fichiers] |
mips64el | 5.3.5+dfsg-6+b3 | 197,4 ko | 760,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64 (portage non officiel) | 0~20150724+git3ca7fe8-1+b2 | 1 367,5 ko | 6 824,0 ko | [liste des fichiers] |
ppc64el | 5.3.5+dfsg-6+b3 | 215,2 ko | 744,0 ko | [liste des fichiers] |
riscv64 | 5.3.5+dfsg-6+b1 | 216,3 ko | 528,0 ko | [liste des fichiers] |
sh4 (portage non officiel) | 5.3.3+dfsg-1+b1 | 223,0 ko | 543,0 ko | [liste des fichiers] |
x32 (portage non officiel) | 5.3-1+b1 | 459,5 ko | 1 607,0 ko | [liste des fichiers] |